MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_016913	GCT	2	6	1001572	1001577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016899
25502	NC_016913	AAC	2	6	1001610	1001615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016899
25503	NC_016913	TAAA	2	8	1001675	1001682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_016913	ATAG	2	8	1001684	1001691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_016913	TAC	2	6	1001699	1001704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016900
25506	NC_016913	TCTT	2	8	1001765	1001772	0 %	75 %	0 %	25 %	379016900
25507	NC_016913	TA	3	6	1001784	1001789	50 %	50 %	0 %	0 %	379016900
25508	NC_016913	TA	3	6	1001844	1001849	50 %	50 %	0 %	0 %	379016900
25509	NC_016913	TAA	2	6	1001880	1001885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016900
25510	NC_016913	TAT	2	6	1001914	1001919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016900
25511	NC_016913	CTTT	2	8	1001924	1001931	0 %	75 %	0 %	25 %	379016900
25512	NC_016913	ACGC	2	8	1001950	1001957	25 %	0 %	25 %	50 %	379016900
25513	NC_016913	TCT	2	6	1001960	1001965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016900
25514	NC_016913	CTT	2	6	1001991	1001996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016900
25515	NC_016913	ACG	2	6	1002016	1002021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016900
25516	NC_016913	ACA	2	6	1002077	1002082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016900
25517	NC_016913	ACATT	2	10	1002132	1002141	40 %	40 %	0 %	20 %	379016900
25518	NC_016913	ATT	2	6	1002274	1002279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016900
25519	NC_016913	CAA	2	6	1002303	1002308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016900
25520	NC_016913	CAG	2	6	1002324	1002329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016900
25521	NC_016913	CCTCAA	2	12	1002345	1002356	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379016900
25522	NC_016913	A	6	6	1002376	1002381	100 %	0 %	0 %	0 %	379016900
25523	NC_016913	TAC	2	6	1002460	1002465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016900
25524	NC_016913	TA	3	6	1002538	1002543	50 %	50 %	0 %	0 %	379016900
25525	NC_016913	TTG	2	6	1002553	1002558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016900
25526	NC_016913	TTG	2	6	1002572	1002577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25527	NC_016913	ATT	2	6	1002687	1002692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25528	NC_016913	AAT	2	6	1002693	1002698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016901
25529	NC_016913	ACT	2	6	1002730	1002735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016901
25530	NC_016913	ATCT	2	8	1002746	1002753	25 %	50 %	0 %	25 %	379016901
25531	NC_016913	CTT	2	6	1002854	1002859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016901
25532	NC_016913	CTC	2	6	1002878	1002883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016901
25533	NC_016913	TTA	3	9	1002901	1002909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25534	NC_016913	GCTTGA	2	12	1002913	1002924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379016901
25535	NC_016913	TTTCTT	2	12	1002929	1002940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379016901
25536	NC_016913	GGC	2	6	1002991	1002996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016901
25537	NC_016913	TAA	2	6	1003005	1003010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016901
25538	NC_016913	TCT	2	6	1003055	1003060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016901
25539	NC_016913	ATA	2	6	1003106	1003111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016901
25540	NC_016913	AAAAT	2	10	1003198	1003207	80 %	20 %	0 %	0 %	379016901
25541	NC_016913	ATT	2	6	1003215	1003220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25542	NC_016913	TCA	2	6	1003261	1003266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016901
25543	NC_016913	TAT	2	6	1003304	1003309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25544	NC_016913	AG	3	6	1003324	1003329	50 %	0 %	50 %	0 %	379016901
25545	NC_016913	TAT	2	6	1003383	1003388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25546	NC_016913	TTA	2	6	1003457	1003462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25547	NC_016913	GCT	2	6	1003465	1003470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016901
25548	NC_016913	CTT	2	6	1003478	1003483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016901
25549	NC_016913	CAA	3	9	1003526	1003534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016901
25550	NC_016913	ATT	2	6	1003540	1003545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016901
25551	NC_016913	AATTGA	2	12	1003570	1003581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379016901
25552	NC_016913	AAATT	2	10	1003585	1003594	60 %	40 %	0 %	0 %	379016901
25553	NC_016913	TCT	2	6	1003624	1003629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016901
25554	NC_016913	T	7	7	1003659	1003665	0 %	100 %	0 %	0 %	379016901
25555	NC_016913	T	6	6	1003680	1003685	0 %	100 %	0 %	0 %	379016901
25556	NC_016913	TAT	2	6	1003711	1003716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25557	NC_016913	TA	4	8	1003735	1003742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25558	NC_016913	TA	3	6	1003749	1003754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25559	NC_016913	T	6	6	1003866	1003871	0 %	100 %	0 %	0 %	379016902
25560	NC_016913	TAA	2	6	1003905	1003910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016902
25561	NC_016913	AT	3	6	1003928	1003933	50 %	50 %	0 %	0 %	379016902
25562	NC_016913	GAA	2	6	1003957	1003962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016902
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25564	NC_016913	A	6	6	1004050	1004055	100 %	0 %	0 %	0 %	379016902
25565	NC_016913	A	8	8	1004088	1004095	100 %	0 %	0 %	0 %	379016902
25566	NC_016913	TAG	2	6	1004102	1004107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016902
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25568	NC_016913	TAG	2	6	1004192	1004197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016902
25569	NC_016913	AT	3	6	1004228	1004233	50 %	50 %	0 %	0 %	379016902
25570	NC_016913	AAT	2	6	1004271	1004276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016902
25571	NC_016913	CTT	2	6	1004316	1004321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016902
25572	NC_016913	ATT	2	6	1004341	1004346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016902
25573	NC_016913	ATT	2	6	1004382	1004387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016902
25574	NC_016913	ATT	2	6	1004414	1004419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016902
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25578	NC_016913	AAT	2	6	1004583	1004588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016902
25579	NC_016913	ATA	2	6	1004615	1004620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016902
25580	NC_016913	ATATA	2	10	1004643	1004652	60 %	40 %	0 %	0 %	379016902
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25587	NC_016913	TGATA	2	10	1004957	1004966	40 %	40 %	20 %	0 %	379016903
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25590	NC_016913	AAT	2	6	1005041	1005046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016903
25591	NC_016913	T	6	6	1005147	1005152	0 %	100 %	0 %	0 %	379016903
25592	NC_016913	GAC	2	6	1005192	1005197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016903
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25598	NC_016913	ATGAAG	2	12	1005346	1005357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379016903
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25600	NC_016913	AAATA	2	10	1005380	1005389	80 %	20 %	0 %	0 %	379016903
25601	NC_016913	TA	3	6	1005388	1005393	50 %	50 %	0 %	0 %	379016903
25602	NC_016913	A	6	6	1005400	1005405	100 %	0 %	0 %	0 %	379016903
25603	NC_016913	T	7	7	1005410	1005416	0 %	100 %	0 %	0 %	379016903
25604	NC_016913	TAG	2	6	1005425	1005430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016903
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25607	NC_016913	ATA	2	6	1005466	1005471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016903
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25613	NC_016913	CTCAAT	2	12	1005572	1005583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016903
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25987	NC_016913	A	6	6	1020111	1020116	100 %	0 %	0 %	0 %	379016918
25988	NC_016913	TAA	2	6	1020138	1020143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016918
25989	NC_016913	TA	4	8	1020237	1020244	50 %	50 %	0 %	0 %	379016918
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