MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_016913	TCA	2	6	902980	902985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23002	NC_016913	GCA	2	6	902989	902994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23003	NC_016913	ATA	2	6	903025	903030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_016913	AT	4	8	903061	903068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_016913	TTC	2	6	903081	903086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23006	NC_016913	CAG	2	6	903122	903127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23007	NC_016913	TGCT	2	8	903152	903159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23008	NC_016913	ACT	2	6	903184	903189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23009	NC_016913	CCT	2	6	903194	903199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23010	NC_016913	CTT	2	6	903200	903205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23011	NC_016913	ATTT	2	8	903263	903270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_016913	TAC	2	6	903272	903277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23013	NC_016913	ATACTT	2	12	903281	903292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23014	NC_016913	TAT	2	6	903306	903311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23015	NC_016913	ATC	2	6	903318	903323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23016	NC_016913	TCT	2	6	903334	903339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23017	NC_016913	ATC	3	9	903351	903359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23018	NC_016913	ATC	2	6	903363	903368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23019	NC_016913	CT	3	6	903403	903408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23020	NC_016913	CTT	2	6	903422	903427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23021	NC_016913	TAA	2	6	903464	903469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_016913	CCGGTG	2	12	903473	903484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_016913	CAG	2	6	903584	903589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23024	NC_016913	CTA	2	6	903593	903598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23025	NC_016913	ACT	2	6	903601	903606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23026	NC_016913	CCA	2	6	903607	903612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23027	NC_016913	TGC	3	9	903642	903650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23028	NC_016913	TGC	2	6	903708	903713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23029	NC_016913	ATT	2	6	903723	903728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23030	NC_016913	ATTC	2	8	903762	903769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23031	NC_016913	CTT	2	6	903848	903853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23032	NC_016913	CTT	2	6	903926	903931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23033	NC_016913	TCCTT	2	10	903955	903964	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23034	NC_016913	CT	3	6	903981	903986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23035	NC_016913	GCT	2	6	904009	904014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23036	NC_016913	AAC	2	6	904023	904028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23037	NC_016913	T	7	7	904097	904103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23038	NC_016913	AGC	2	6	904243	904248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016805
23039	NC_016913	TCA	2	6	904279	904284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016805
23040	NC_016913	TTAT	2	8	904286	904293	25 %	75 %	0 %	0 %	379016805
23041	NC_016913	ATT	2	6	904369	904374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016805
23042	NC_016913	CTAT	2	8	904546	904553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23043	NC_016913	TTA	2	6	904585	904590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23044	NC_016913	ATT	2	6	904596	904601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23045	NC_016913	T	7	7	904617	904623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23046	NC_016913	TAT	2	6	904643	904648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23047	NC_016913	TTA	2	6	904663	904668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23048	NC_016913	ATT	2	6	904710	904715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23049	NC_016913	CATTTT	2	12	904736	904747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23050	NC_016913	TTTTAT	2	12	904800	904811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23051	NC_016913	CTT	2	6	904819	904824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23052	NC_016913	TTC	3	9	904895	904903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23053	NC_016913	A	6	6	904919	904924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_016913	TTG	2	6	904929	904934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_016913	TAT	2	6	904942	904947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23056	NC_016913	TTAAAG	2	12	904948	904959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23057	NC_016913	CAT	3	9	904984	904992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23058	NC_016913	AAT	2	6	905009	905014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23059	NC_016913	AAT	2	6	905062	905067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_016913	TCT	2	6	905093	905098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23061	NC_016913	CTAAT	2	10	905145	905154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23062	NC_016913	ATT	2	6	905184	905189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23063	NC_016913	CCGGTG	2	12	905273	905284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379016806
23064	NC_016913	TTC	2	6	905291	905296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016806
23065	NC_016913	TCT	2	6	905311	905316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016806
23066	NC_016913	TCA	3	9	905351	905359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016806
23067	NC_016913	GGA	3	9	905420	905428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379016806
23068	NC_016913	GCT	2	6	905429	905434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016806
23069	NC_016913	AGAGGC	2	12	905447	905458	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379016806
23070	NC_016913	TAC	2	6	905464	905469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016806
23071	NC_016913	CTA	2	6	905504	905509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016807
23072	NC_016913	T	6	6	905545	905550	0 %	100 %	0 %	0 %	379016807
23073	NC_016913	ATT	2	6	905589	905594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016807
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23075	NC_016913	TCA	2	6	905683	905688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016807
23076	NC_016913	TTCA	2	8	905703	905710	25 %	50 %	0 %	25 %	379016807
23077	NC_016913	AT	3	6	905734	905739	50 %	50 %	0 %	0 %	379016807
23078	NC_016913	CTT	2	6	905741	905746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016807
23079	NC_016913	AAT	2	6	905768	905773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23080	NC_016913	ACT	2	6	905776	905781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23081	NC_016913	TAA	2	6	905886	905891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23082	NC_016913	CTT	2	6	905981	905986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23083	NC_016913	ATT	2	6	905991	905996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23084	NC_016913	TA	3	6	906042	906047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23085	NC_016913	CTG	2	6	906217	906222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016808
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23089	NC_016913	CTT	2	6	906348	906353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016808
23090	NC_016913	CAA	2	6	906373	906378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016808
23091	NC_016913	CAC	2	6	906382	906387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016808
23092	NC_016913	CAG	2	6	906454	906459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016808
23093	NC_016913	AT	3	6	906469	906474	50 %	50 %	0 %	0 %	379016808
23094	NC_016913	GCA	2	6	906525	906530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23095	NC_016913	TAAG	2	8	906541	906548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23096	NC_016913	AAT	2	6	906549	906554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23097	NC_016913	TAA	2	6	906608	906613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23098	NC_016913	TTA	2	6	906617	906622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23099	NC_016913	T	6	6	906639	906644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23100	NC_016913	TTA	2	6	906646	906651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23101	NC_016913	A	6	6	906667	906672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_016913	TAT	2	6	906673	906678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_016913	TGA	2	6	906694	906699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23104	NC_016913	TA	5	10	906729	906738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23105	NC_016913	TTA	2	6	906784	906789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23106	NC_016913	TAT	2	6	906803	906808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23107	NC_016913	TAT	2	6	906837	906842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23108	NC_016913	ATT	2	6	906853	906858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_016913	ATG	2	6	906891	906896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23110	NC_016913	GTC	2	6	906919	906924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23111	NC_016913	TC	3	6	907088	907093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23112	NC_016913	TTA	2	6	907110	907115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23113	NC_016913	ATATT	2	10	907133	907142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23114	NC_016913	TCC	2	6	907150	907155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23115	NC_016913	TAT	2	6	907302	907307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23116	NC_016913	AAT	2	6	907388	907393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23117	NC_016913	GGC	2	6	907403	907408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23118	NC_016913	CTA	2	6	907410	907415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23119	NC_016913	CTA	2	6	907458	907463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23120	NC_016913	ATT	2	6	907512	907517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23121	NC_016913	GTA	2	6	907563	907568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23122	NC_016913	AGC	2	6	907582	907587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23123	NC_016913	ATT	2	6	907757	907762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23124	NC_016913	TAA	2	6	907765	907770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23125	NC_016913	AAT	2	6	907853	907858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23126	NC_016913	TAT	2	6	907867	907872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23127	NC_016913	ACT	2	6	907877	907882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23128	NC_016913	GCT	2	6	907901	907906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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