MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016913	TTA	2	6	588235	588240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_016913	TAA	2	6	588297	588302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_016913	TCAT	2	8	588307	588314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15004	NC_016913	A	7	7	588352	588358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_016913	CAA	2	6	588374	588379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_016913	AAATT	2	10	588380	588389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_016913	TTA	2	6	588402	588407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_016913	TAG	2	6	588420	588425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_016913	T	7	7	588434	588440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_016913	TAA	2	6	588481	588486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_016913	GAA	2	6	588497	588502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_016913	TAAT	2	8	588607	588614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_016913	A	8	8	588648	588655	100 %	0 %	0 %	0 %	379016463
15014	NC_016913	AGA	3	9	588744	588752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016463
15015	NC_016913	TGG	2	6	588765	588770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016463
15016	NC_016913	TA	3	6	588802	588807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_016913	TAA	2	6	588827	588832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_016913	TAT	2	6	588841	588846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_016913	ATA	2	6	588918	588923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_016913	AGC	2	6	588951	588956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_016913	TAC	2	6	589003	589008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_016913	T	8	8	589012	589019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_016913	GGTA	2	8	589030	589037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_016913	AAC	2	6	589091	589096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_016913	TAA	2	6	589106	589111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_016913	A	6	6	589163	589168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_016913	GAG	2	6	589240	589245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016913	ACG	2	6	589289	589294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_016913	TCT	2	6	589352	589357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016464
15030	NC_016913	ATA	2	6	589486	589491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016464
15031	NC_016913	TCA	2	6	589516	589521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016464
15032	NC_016913	TA	3	6	589541	589546	50 %	50 %	0 %	0 %	379016464
15033	NC_016913	TTC	2	6	589578	589583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016464
15034	NC_016913	TAG	2	6	589608	589613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15035	NC_016913	CAG	2	6	589676	589681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016464
15036	NC_016913	TTA	2	6	589792	589797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016464
15037	NC_016913	CAT	2	6	589811	589816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016464
15038	NC_016913	TTA	2	6	589855	589860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016464
15039	NC_016913	AGC	2	6	589871	589876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016464
15040	NC_016913	ACT	2	6	590032	590037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016464
15041	NC_016913	TAT	2	6	590039	590044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016464
15042	NC_016913	CTTT	2	8	590047	590054	0 %	75 %	0 %	25 %	379016464
15043	NC_016913	A	6	6	590058	590063	100 %	0 %	0 %	0 %	379016464
15044	NC_016913	ACT	2	6	590080	590085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016464
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15048	NC_016913	A	6	6	590211	590216	100 %	0 %	0 %	0 %	379016464
15049	NC_016913	ATA	2	6	590225	590230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016464
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15051	NC_016913	TA	3	6	590259	590264	50 %	50 %	0 %	0 %	379016464
15052	NC_016913	T	6	6	590295	590300	0 %	100 %	0 %	0 %	379016464
15053	NC_016913	GAT	2	6	590350	590355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15054	NC_016913	A	6	6	590358	590363	100 %	0 %	0 %	0 %	379016464
15055	NC_016913	GAT	3	9	590435	590443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15056	NC_016913	CAT	2	6	590474	590479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016464
15057	NC_016913	ATAGGA	2	12	590545	590556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379016464
15058	NC_016913	TGA	2	6	590645	590650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15059	NC_016913	CTT	2	6	590651	590656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016464
15060	NC_016913	AATT	2	8	590696	590703	50 %	50 %	0 %	0 %	379016464
15061	NC_016913	TAA	3	9	590867	590875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016464
15062	NC_016913	CCTT	2	8	590932	590939	0 %	50 %	0 %	50 %	379016464
15063	NC_016913	CTT	2	6	590962	590967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016464
15064	NC_016913	TAT	2	6	591030	591035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016464
15065	NC_016913	GAT	2	6	591038	591043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15066	NC_016913	TAG	2	6	591107	591112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016464
15067	NC_016913	TGAAA	2	10	591134	591143	60 %	20 %	20 %	0 %	379016464
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15071	NC_016913	TC	3	6	591464	591469	0 %	50 %	0 %	50 %	379016464
15072	NC_016913	GCT	2	6	591503	591508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016464
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15077	NC_016913	T	7	7	591820	591826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_016913	TA	3	6	591831	591836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_016913	CATTGT	2	12	591840	591851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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15083	NC_016913	CT	3	6	591971	591976	0 %	50 %	0 %	50 %	379016465
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15094	NC_016913	CTT	2	6	592318	592323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016465
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15096	NC_016913	TTC	2	6	592443	592448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016465
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15099	NC_016913	A	6	6	592554	592559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_016913	ATT	2	6	592605	592610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016466
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15103	NC_016913	GAC	2	6	592822	592827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016468
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15107	NC_016913	TAT	2	6	592974	592979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016468
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15110	NC_016913	TTA	2	6	593112	593117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016468
15111	NC_016913	ATTA	2	8	593155	593162	50 %	50 %	0 %	0 %	379016468
15112	NC_016913	GCT	3	9	593173	593181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016468
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15119	NC_016913	T	6	6	593636	593641	0 %	100 %	0 %	0 %	379016468
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15124	NC_016913	GCA	2	6	593985	593990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016469
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15499	NC_016913	A	7	7	610187	610193	100 %	0 %	0 %	0 %	379016488
15500	NC_016913	TA	3	6	610260	610265	50 %	50 %	0 %	0 %	379016488

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