MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016913	ATTAAT	2	12	549107	549118	50 %	50 %	0 %	0 %	379016421
14002	NC_016913	TAAT	2	8	549124	549131	50 %	50 %	0 %	0 %	379016421
14003	NC_016913	T	6	6	549145	549150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_016913	AAT	2	6	549153	549158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_016913	GAC	2	6	549210	549215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_016913	CAAA	2	8	549303	549310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14007	NC_016913	TAC	2	6	549431	549436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_016913	AGT	2	6	549467	549472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_016913	AGC	2	6	549473	549478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_016913	ATT	2	6	549531	549536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_016913	AGT	2	6	549537	549542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_016913	CAA	2	6	549598	549603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_016913	AG	3	6	549643	549648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_016913	TAA	2	6	549653	549658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_016913	TTGA	2	8	549705	549712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_016913	TTACT	2	10	549727	549736	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14017	NC_016913	TTAAT	2	10	549747	549756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_016913	AT	3	6	549755	549760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_016913	TAA	2	6	549775	549780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_016913	TATT	2	8	549786	549793	25 %	75 %	0 %	0 %	379016422
14021	NC_016913	CTTT	2	8	549861	549868	0 %	75 %	0 %	25 %	379016422
14022	NC_016913	CGG	2	6	549875	549880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016422
14023	NC_016913	TTC	2	6	549905	549910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14024	NC_016913	ACC	2	6	549968	549973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016422
14025	NC_016913	TCA	2	6	550045	550050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016422
14026	NC_016913	CAGC	2	8	550077	550084	25 %	0 %	25 %	50 %	379016422
14027	NC_016913	GTGAAT	2	12	550121	550132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016422
14028	NC_016913	TTG	2	6	550171	550176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016422
14029	NC_016913	AAC	2	6	550189	550194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016422
14030	NC_016913	GGT	2	6	550241	550246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016422
14031	NC_016913	GTA	2	6	550326	550331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016422
14032	NC_016913	TCT	2	6	550344	550349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14033	NC_016913	TTC	2	6	550391	550396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14034	NC_016913	GAT	2	6	550399	550404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016422
14035	NC_016913	CTAT	2	8	550407	550414	25 %	50 %	0 %	25 %	379016422
14036	NC_016913	T	6	6	550568	550573	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14037	NC_016913	AAT	2	6	550606	550611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14038	NC_016913	AT	4	8	550653	550660	50 %	50 %	0 %	0 %	379016422
14039	NC_016913	T	6	6	550660	550665	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14040	NC_016913	AATA	2	8	550715	550722	75 %	25 %	0 %	0 %	379016422
14041	NC_016913	CAA	2	6	550762	550767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016422
14042	NC_016913	TCA	2	6	550851	550856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016422
14043	NC_016913	AGC	2	6	550857	550862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016422
14044	NC_016913	CCG	2	6	550971	550976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379016422
14045	NC_016913	ATA	2	6	551065	551070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14046	NC_016913	TAT	2	6	551197	551202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016422
14047	NC_016913	AGGC	2	8	551216	551223	25 %	0 %	50 %	25 %	379016422
14048	NC_016913	CTT	2	6	551323	551328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14049	NC_016913	T	7	7	551350	551356	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14050	NC_016913	TCA	2	6	551385	551390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016422
14051	NC_016913	ATA	2	6	551426	551431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14052	NC_016913	T	6	6	551443	551448	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14053	NC_016913	TGC	2	6	551469	551474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016422
14054	NC_016913	TAA	2	6	551521	551526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14055	NC_016913	TCT	2	6	551556	551561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14056	NC_016913	TGC	2	6	551568	551573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016422
14057	NC_016913	AT	3	6	551608	551613	50 %	50 %	0 %	0 %	379016422
14058	NC_016913	AAT	2	6	551666	551671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14059	NC_016913	TTA	2	6	551748	551753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016422
14060	NC_016913	TTC	2	6	551765	551770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016422
14061	NC_016913	AAT	2	6	551777	551782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016422
14062	NC_016913	TCG	2	6	551805	551810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016422
14063	NC_016913	TAT	2	6	551866	551871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016422
14064	NC_016913	GT	3	6	551927	551932	0 %	50 %	50 %	0 %	379016422
14065	NC_016913	T	6	6	551954	551959	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14066	NC_016913	AT	3	6	551976	551981	50 %	50 %	0 %	0 %	379016422
14067	NC_016913	TAT	2	6	551986	551991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016422
14068	NC_016913	GTA	2	6	552006	552011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016422
14069	NC_016913	GA	3	6	552013	552018	50 %	0 %	50 %	0 %	379016422
14070	NC_016913	TAC	2	6	552074	552079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016422
14071	NC_016913	TC	3	6	552084	552089	0 %	50 %	0 %	50 %	379016422
14072	NC_016913	T	6	6	552110	552115	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
14073	NC_016913	ATT	2	6	552147	552152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_016913	TA	3	6	552156	552161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_016913	ATT	2	6	552191	552196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_016913	TAC	2	6	552217	552222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016423
14077	NC_016913	CCT	2	6	552225	552230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016423
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14079	NC_016913	ATA	2	6	552250	552255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016423
14080	NC_016913	T	8	8	552328	552335	0 %	100 %	0 %	0 %	379016423
14081	NC_016913	A	6	6	552352	552357	100 %	0 %	0 %	0 %	379016423
14082	NC_016913	TTA	2	6	552393	552398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016423
14083	NC_016913	ATT	2	6	552485	552490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016423
14084	NC_016913	ATTT	2	8	552507	552514	25 %	75 %	0 %	0 %	379016423
14085	NC_016913	AGCA	2	8	552541	552548	50 %	0 %	25 %	25 %	379016423
14086	NC_016913	CGG	2	6	552560	552565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016423
14087	NC_016913	TA	4	8	552572	552579	50 %	50 %	0 %	0 %	379016423
14088	NC_016913	AAG	2	6	552592	552597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016423
14089	NC_016913	GAA	2	6	552600	552605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016423
14090	NC_016913	AGA	2	6	552614	552619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016423
14091	NC_016913	AGCAGG	2	12	552671	552682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379016423
14092	NC_016913	CAG	2	6	552705	552710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016423
14093	NC_016913	GCG	4	12	552745	552756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016423
14094	NC_016913	ATG	2	6	552838	552843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016423
14095	NC_016913	TTAT	2	8	552845	552852	25 %	75 %	0 %	0 %	379016423
14096	NC_016913	ATA	2	6	552862	552867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016423
14097	NC_016913	A	6	6	552954	552959	100 %	0 %	0 %	0 %	379016423
14098	NC_016913	TGA	2	6	552962	552967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016423
14099	NC_016913	AGA	2	6	552980	552985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016423
14100	NC_016913	AT	3	6	552993	552998	50 %	50 %	0 %	0 %	379016423
14101	NC_016913	AGT	2	6	553050	553055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016423
14102	NC_016913	T	6	6	553079	553084	0 %	100 %	0 %	0 %	379016423
14103	NC_016913	AGC	2	6	553226	553231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016423
14104	NC_016913	A	6	6	553330	553335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_016913	AAC	2	6	553377	553382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_016913	CCT	2	6	553384	553389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14107	NC_016913	ATG	2	6	553394	553399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_016913	TCT	2	6	553424	553429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
14109	NC_016913	CTT	2	6	553435	553440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
14110	NC_016913	TAG	2	6	553447	553452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016424
14111	NC_016913	CTT	2	6	553491	553496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
14112	NC_016913	TTA	2	6	553501	553506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016424
14113	NC_016913	GATT	2	8	553540	553547	25 %	50 %	25 %	0 %	379016424
14114	NC_016913	AAATTA	2	12	553563	553574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016424
14115	NC_016913	TTG	2	6	553580	553585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016424
14116	NC_016913	CTTTAT	2	12	553651	553662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379016424
14117	NC_016913	GCA	2	6	553689	553694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016424
14118	NC_016913	AT	3	6	553770	553775	50 %	50 %	0 %	0 %	379016424
14119	NC_016913	T	6	6	553798	553803	0 %	100 %	0 %	0 %	379016424
14120	NC_016913	AAG	2	6	553849	553854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016424
14121	NC_016913	TTA	2	6	553942	553947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016424
14122	NC_016913	TGA	2	6	553967	553972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016424
14123	NC_016913	AGTA	2	8	553976	553983	50 %	25 %	25 %	0 %	379016424
14124	NC_016913	TAA	2	6	553984	553989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016424
14125	NC_016913	TAT	2	6	554014	554019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016424
14126	NC_016913	T	7	7	554019	554025	0 %	100 %	0 %	0 %	379016424
14127	NC_016913	TAA	2	6	554035	554040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016424
14128	NC_016913	CTG	2	6	554042	554047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016424
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14142	NC_016913	T	8	8	554724	554731	0 %	100 %	0 %	0 %	379016424
14143	NC_016913	ATC	2	6	554738	554743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016424
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14145	NC_016913	ATT	2	6	554777	554782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14155	NC_016913	T	6	6	555074	555079	0 %	100 %	0 %	0 %	379016425
14156	NC_016913	CTA	2	6	555107	555112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016425
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14161	NC_016913	TAA	2	6	555337	555342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14162	NC_016913	CTT	2	6	555402	555407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14164	NC_016913	TGC	2	6	555453	555458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14168	NC_016913	T	6	6	555635	555640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14169	NC_016913	T	6	6	555675	555680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14172	NC_016913	T	6	6	555821	555826	0 %	100 %	0 %	0 %	379016426
14173	NC_016913	AGA	2	6	555830	555835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016426
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14215	NC_016913	TGT	2	6	557768	557773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14216	NC_016913	CTA	2	6	557783	557788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14231	NC_016913	T	6	6	558360	558365	0 %	100 %	0 %	0 %	379016427
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14239	NC_016913	TCC	2	6	558680	558685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14240	NC_016913	ATTA	2	8	558710	558717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14241	NC_016913	TTC	2	6	558737	558742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_016913	TACA	2	8	558748	558755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14243	NC_016913	TAA	2	6	558767	558772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_016913	ATT	2	6	558788	558793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_016913	TAT	2	6	558806	558811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_016913	T	6	6	558975	558980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14247	NC_016913	AAT	2	6	559015	559020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14366	NC_016913	AT	3	6	563945	563950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14367	NC_016913	T	7	7	563960	563966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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