MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_016913	TACG	2	8	489698	489705	25 %	25 %	25 %	25 %	379016361
12503	NC_016913	GTA	2	6	489715	489720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016361
12504	NC_016913	CCA	2	6	489733	489738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016361
12505	NC_016913	TGC	2	6	489828	489833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016361
12506	NC_016913	CT	3	6	489872	489877	0 %	50 %	0 %	50 %	379016361
12507	NC_016913	CTT	2	6	489947	489952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016361
12508	NC_016913	GCA	2	6	490045	490050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016361
12509	NC_016913	CTT	2	6	490061	490066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016361
12510	NC_016913	CCG	2	6	490069	490074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379016361
12511	NC_016913	AAT	2	6	490092	490097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016361
12512	NC_016913	CAT	2	6	490115	490120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016361
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12515	NC_016913	CTT	2	6	490250	490255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016361
12516	NC_016913	TTA	2	6	490273	490278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016361
12517	NC_016913	ACA	2	6	490297	490302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016361
12518	NC_016913	TTG	2	6	490369	490374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016361
12519	NC_016913	TTATT	2	10	490429	490438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_016913	CAA	2	6	490494	490499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_016913	TGA	2	6	490517	490522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_016913	GCT	2	6	490542	490547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_016913	GAC	2	6	490554	490559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_016913	CT	3	6	490582	490587	0 %	50 %	0 %	50 %	379016362
12525	NC_016913	TGC	2	6	490602	490607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016362
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12529	NC_016913	TAT	2	6	490844	490849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016362
12530	NC_016913	CTTT	2	8	490856	490863	0 %	75 %	0 %	25 %	379016362
12531	NC_016913	TTTCA	2	10	490872	490881	20 %	60 %	0 %	20 %	379016362
12532	NC_016913	T	7	7	490900	490906	0 %	100 %	0 %	0 %	379016362
12533	NC_016913	CGCTAC	2	12	490950	490961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379016362
12534	NC_016913	ATT	2	6	490974	490979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016362
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12542	NC_016913	ATAA	2	8	491159	491166	75 %	25 %	0 %	0 %	379016362
12543	NC_016913	TGTT	2	8	491178	491185	0 %	75 %	25 %	0 %	379016362
12544	NC_016913	ATT	3	9	491223	491231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016362
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12547	NC_016913	CAT	2	6	491417	491422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016362
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12552	NC_016913	T	6	6	491518	491523	0 %	100 %	0 %	0 %	379016362
12553	NC_016913	T	6	6	491546	491551	0 %	100 %	0 %	0 %	379016362
12554	NC_016913	CTT	2	6	491720	491725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016362
12555	NC_016913	T	7	7	491724	491730	0 %	100 %	0 %	0 %	379016362
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12558	NC_016913	TTG	2	6	491823	491828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_016913	TTA	2	6	491829	491834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_016913	CT	3	6	491909	491914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12561	NC_016913	ATC	2	6	491978	491983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016363
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12565	NC_016913	ATTTC	2	10	492195	492204	20 %	60 %	0 %	20 %	379016363
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12569	NC_016913	T	6	6	492250	492255	0 %	100 %	0 %	0 %	379016363
12570	NC_016913	ACAG	2	8	492292	492299	50 %	0 %	25 %	25 %	379016363
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12574	NC_016913	TAT	2	6	492481	492486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12577	NC_016913	TTATT	2	10	492517	492526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12594	NC_016913	T	8	8	492974	492981	0 %	100 %	0 %	0 %	379016365
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12623	NC_016913	T	6	6	494337	494342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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