MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016913	TTC	2	6	452798	452803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_016913	ATTTT	2	10	452828	452837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_016913	ATC	2	6	452844	452849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_016913	TTTCA	2	10	452851	452860	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11505	NC_016913	TAA	2	6	452872	452877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016913	ATT	2	6	452936	452941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_016913	TTTA	2	8	452977	452984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_016913	GTA	2	6	453046	453051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_016913	ATT	2	6	453070	453075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016913	ATT	2	6	453088	453093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016316
11511	NC_016913	TCT	2	6	453108	453113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016316
11512	NC_016913	ATTA	2	8	453175	453182	50 %	50 %	0 %	0 %	379016316
11513	NC_016913	TAT	2	6	453249	453254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016316
11514	NC_016913	AGT	2	6	453272	453277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016316
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11517	NC_016913	TCT	2	6	453356	453361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_016913	TAA	2	6	453373	453378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_016913	TTA	2	6	453379	453384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_016913	A	6	6	453444	453449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_016913	AT	3	6	453466	453471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_016913	ATA	2	6	453501	453506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016317
11523	NC_016913	ATT	2	6	453529	453534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016317
11524	NC_016913	TAAT	2	8	453582	453589	50 %	50 %	0 %	0 %	379016317
11525	NC_016913	TGA	2	6	453604	453609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016317
11526	NC_016913	T	6	6	453647	453652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_016913	GATT	2	8	453739	453746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_016913	ATA	2	6	453797	453802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016318
11529	NC_016913	AATAT	2	10	453828	453837	60 %	40 %	0 %	0 %	379016318
11530	NC_016913	GAAG	2	8	453901	453908	50 %	0 %	50 %	0 %	379016318
11531	NC_016913	TAAA	2	8	453922	453929	75 %	25 %	0 %	0 %	379016318
11532	NC_016913	TATT	2	8	453943	453950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_016913	AGG	2	6	453963	453968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_016913	TA	3	6	454031	454036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016913	AAT	2	6	454092	454097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016913	TAA	2	6	454124	454129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_016913	ATT	2	6	454139	454144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016913	ATC	2	6	454158	454163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_016913	AT	3	6	454185	454190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016913	ATCA	2	8	454192	454199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_016913	ATA	2	6	454217	454222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016913	GAA	2	6	454240	454245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_016913	TA	3	6	454254	454259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_016913	TA	3	6	454262	454267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_016913	GTC	2	6	454288	454293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11547	NC_016913	A	6	6	454325	454330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_016913	ATA	2	6	454465	454470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016913	A	7	7	454470	454476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_016913	TAT	2	6	454493	454498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_016913	ATTT	4	16	454508	454523	25 %	75 %	0 %	0 %	379016319
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11556	NC_016913	TAT	2	6	454578	454583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016319
11557	NC_016913	TA	3	6	454595	454600	50 %	50 %	0 %	0 %	379016319
11558	NC_016913	TACT	2	8	454613	454620	25 %	50 %	0 %	25 %	379016319
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11561	NC_016913	ATT	2	6	454725	454730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11563	NC_016913	ATA	2	6	454830	454835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_016913	A	7	7	454861	454867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016913	TAT	2	6	454873	454878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_016913	A	7	7	454880	454886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_016913	T	7	7	454923	454929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11569	NC_016913	A	6	6	454956	454961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11579	NC_016913	TTG	2	6	455300	455305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11584	NC_016913	GCT	2	6	455433	455438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11588	NC_016913	CTAGAG	2	12	455575	455586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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11594	NC_016913	AGA	2	6	455792	455797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_016913	A	7	7	455797	455803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_016913	ATT	2	6	455810	455815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11603	NC_016913	A	7	7	456121	456127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_016913	A	6	6	456212	456217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_016913	A	6	6	456242	456247	100 %	0 %	0 %	0 %	379016320
11606	NC_016913	AG	3	6	456273	456278	50 %	0 %	50 %	0 %	379016320
11607	NC_016913	A	6	6	456317	456322	100 %	0 %	0 %	0 %	379016320
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11614	NC_016913	GAT	2	6	456567	456572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_016913	CTAG	2	8	456599	456606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_016913	T	6	6	456624	456629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_016913	CAA	2	6	456638	456643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_016913	TTAT	2	8	456671	456678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_016913	TC	3	6	456684	456689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_016913	CTT	2	6	456690	456695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_016913	CTA	2	6	456704	456709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11623	NC_016913	ATA	2	6	456762	456767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_016913	TA	3	6	456772	456777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_016913	GGTT	2	8	456831	456838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_016913	AT	3	6	456947	456952	50 %	50 %	0 %	0 %	379016321
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