MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016913	AAAT	2	8	254294	254301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_016913	CTT	2	6	254384	254389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_016913	CTT	2	6	254407	254412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_016913	TTCT	2	8	254415	254422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6505	NC_016913	TA	3	6	254479	254484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_016913	AAG	2	6	254507	254512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_016913	TGA	2	6	254518	254523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_016913	TTA	2	6	254538	254543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_016913	T	8	8	254554	254561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_016913	ATT	2	6	254578	254583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_016913	TTA	2	6	254600	254605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_016913	TAT	2	6	254613	254618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_016913	TAAT	2	8	254619	254626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_016913	T	7	7	254678	254684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016913	GTATTT	2	12	254717	254728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_016913	AGT	2	6	254758	254763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_016913	GTT	2	6	254775	254780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016913	CTAT	2	8	254801	254808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_016913	CTA	2	6	254823	254828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_016913	TGT	2	6	254873	254878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_016913	GTA	2	6	254916	254921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016913	GT	3	6	254948	254953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016913	TTAA	2	8	255044	255051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016913	TATT	2	8	255114	255121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016913	ATT	2	6	255128	255133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016913	ATT	2	6	255142	255147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016913	TAT	2	6	255186	255191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016099
6528	NC_016913	TTA	2	6	255192	255197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016099
6529	NC_016913	AAT	2	6	255221	255226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016099
6530	NC_016913	TTA	2	6	255239	255244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016099
6531	NC_016913	TGC	2	6	255263	255268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016099
6532	NC_016913	TA	4	8	255277	255284	50 %	50 %	0 %	0 %	379016099
6533	NC_016913	ATC	2	6	255286	255291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016099
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6535	NC_016913	TTG	2	6	255334	255339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016099
6536	NC_016913	ATC	2	6	255349	255354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016099
6537	NC_016913	TAA	2	6	255367	255372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016099
6538	NC_016913	AAG	2	6	255388	255393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016099
6539	NC_016913	TAC	2	6	255412	255417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016099
6540	NC_016913	TAT	2	6	255421	255426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016099
6541	NC_016913	CTA	2	6	255435	255440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016099
6542	NC_016913	GCA	2	6	255455	255460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016099
6543	NC_016913	ATA	2	6	255509	255514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016099
6544	NC_016913	TTA	2	6	255551	255556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016099
6545	NC_016913	GTT	2	6	255691	255696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016099
6546	NC_016913	GTT	2	6	255702	255707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016100
6547	NC_016913	GT	3	6	255713	255718	0 %	50 %	50 %	0 %	379016100
6548	NC_016913	TAT	2	6	255755	255760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016100
6549	NC_016913	AT	3	6	255759	255764	50 %	50 %	0 %	0 %	379016100
6550	NC_016913	ATC	2	6	255767	255772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016100
6551	NC_016913	ATC	2	6	255836	255841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016100
6552	NC_016913	GCT	2	6	255862	255867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016100
6553	NC_016913	TAT	2	6	255886	255891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016100
6554	NC_016913	GAT	2	6	255894	255899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016100
6555	NC_016913	AGTG	2	8	255927	255934	25 %	25 %	50 %	0 %	379016100
6556	NC_016913	TTTCT	2	10	255942	255951	0 %	80 %	0 %	20 %	379016100
6557	NC_016913	T	6	6	255951	255956	0 %	100 %	0 %	0 %	379016100
6558	NC_016913	ATT	2	6	256024	256029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_016913	TAA	2	6	256039	256044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_016913	AATTA	2	10	256053	256062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_016913	AG	3	6	256118	256123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016913	ATAA	2	8	256124	256131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016913	ACTA	2	8	256140	256147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_016913	TAT	2	6	256158	256163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016913	A	6	6	256165	256170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016913	AT	3	6	256174	256179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_016913	TTAT	2	8	256196	256203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_016913	TAA	2	6	256244	256249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016101
6569	NC_016913	AAG	2	6	256315	256320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016101
6570	NC_016913	TAG	2	6	256325	256330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016101
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6572	NC_016913	GAA	2	6	256422	256427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016101
6573	NC_016913	TA	3	6	256435	256440	50 %	50 %	0 %	0 %	379016101
6574	NC_016913	TAATT	2	10	256443	256452	40 %	60 %	0 %	0 %	379016101
6575	NC_016913	TA	3	6	256453	256458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_016913	AAT	3	9	256500	256508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_016913	TAA	2	6	256563	256568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_016913	ATC	2	6	256580	256585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_016913	ATT	2	6	256597	256602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_016913	TAAA	2	8	256615	256622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_016913	TACA	2	8	256642	256649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6582	NC_016913	AT	3	6	256666	256671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_016913	TAT	2	6	256800	256805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_016913	TAGA	2	8	256821	256828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_016913	AGTGCT	2	12	256876	256887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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6587	NC_016913	CTA	2	6	256898	256903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_016913	A	6	6	256918	256923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_016913	TAA	2	6	256924	256929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_016913	TCT	2	6	256937	256942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_016913	ATT	2	6	256968	256973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_016913	CAA	2	6	257039	257044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_016913	AGT	2	6	257064	257069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016913	AGC	2	6	257073	257078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_016913	TACC	2	8	257102	257109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_016913	CA	3	6	257190	257195	50 %	0 %	0 %	50 %	379016102
6597	NC_016913	GGC	2	6	257323	257328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_016913	TAA	2	6	257400	257405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_016913	TAT	2	6	257427	257432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016103
6600	NC_016913	AAT	2	6	257439	257444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016103
6601	NC_016913	A	6	6	257485	257490	100 %	0 %	0 %	0 %	379016103
6602	NC_016913	AAG	2	6	257495	257500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016103
6603	NC_016913	GAAA	2	8	257527	257534	75 %	0 %	25 %	0 %	379016103
6604	NC_016913	TCA	2	6	257538	257543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016103
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6607	NC_016913	T	8	8	257657	257664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_016913	T	6	6	257680	257685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_016913	CTT	2	6	257784	257789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016104
6610	NC_016913	GTT	2	6	257801	257806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016104
6611	NC_016913	TAT	2	6	257902	257907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016104
6612	NC_016913	GTAAA	2	10	258030	258039	60 %	20 %	20 %	0 %	379016104
6613	NC_016913	GTAA	2	8	258062	258069	50 %	25 %	25 %	0 %	379016104
6614	NC_016913	TAA	2	6	258090	258095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016104
6615	NC_016913	AT	3	6	258102	258107	50 %	50 %	0 %	0 %	379016104
6616	NC_016913	ATG	2	6	258146	258151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016104
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6618	NC_016913	A	8	8	258184	258191	100 %	0 %	0 %	0 %	379016104
6619	NC_016913	TAA	2	6	258198	258203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016104
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6621	NC_016913	TAAT	2	8	258270	258277	50 %	50 %	0 %	0 %	379016104
6622	NC_016913	T	6	6	258320	258325	0 %	100 %	0 %	0 %	379016104
6623	NC_016913	ATA	2	6	258326	258331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016104
6624	NC_016913	TCA	2	6	258368	258373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016104
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6627	NC_016913	AT	4	8	258405	258412	50 %	50 %	0 %	0 %	379016104
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