MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016913	ATA	3	9	197520	197528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016913	AAT	2	6	197559	197564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016913	TTG	2	6	197568	197573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016913	CTA	2	6	197583	197588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_016913	CTT	3	9	197604	197612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016913	TAT	2	6	197613	197618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016913	CTA	2	6	197709	197714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_016913	ATC	2	6	197720	197725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016913	ATA	2	6	197732	197737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016913	TGC	2	6	197753	197758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_016913	ATT	3	9	197772	197780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016913	T	6	6	197804	197809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016913	TAG	2	6	197823	197828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016913	ATTT	2	8	197870	197877	25 %	75 %	0 %	0 %	379016029
5015	NC_016913	TTGG	2	8	197959	197966	0 %	50 %	50 %	0 %	379016029
5016	NC_016913	T	8	8	197967	197974	0 %	100 %	0 %	0 %	379016029
5017	NC_016913	TTA	2	6	198029	198034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016029
5018	NC_016913	TTAT	2	8	198038	198045	25 %	75 %	0 %	0 %	379016029
5019	NC_016913	GTA	2	6	198051	198056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016029
5020	NC_016913	TAT	2	6	198079	198084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016029
5021	NC_016913	AT	3	6	198090	198095	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5022	NC_016913	AG	3	6	198133	198138	50 %	0 %	50 %	0 %	379016029
5023	NC_016913	TAGC	2	8	198144	198151	25 %	25 %	25 %	25 %	379016029
5024	NC_016913	AAACA	2	10	198229	198238	80 %	0 %	0 %	20 %	379016029
5025	NC_016913	TA	5	10	198241	198250	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5026	NC_016913	T	6	6	198253	198258	0 %	100 %	0 %	0 %	379016029
5027	NC_016913	TAA	2	6	198264	198269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016029
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5030	NC_016913	TGT	2	6	198413	198418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016029
5031	NC_016913	AT	3	6	198451	198456	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5032	NC_016913	GAT	2	6	198467	198472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016029
5033	NC_016913	TA	3	6	198499	198504	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5034	NC_016913	TA	3	6	198536	198541	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5035	NC_016913	TA	3	6	198545	198550	50 %	50 %	0 %	0 %	379016029
5036	NC_016913	TTAT	2	8	198563	198570	25 %	75 %	0 %	0 %	379016029
5037	NC_016913	CAA	2	6	198576	198581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016029
5038	NC_016913	ATA	2	6	198594	198599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016029
5039	NC_016913	GCT	2	6	198620	198625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016029
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5041	NC_016913	TTA	2	6	198736	198741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016029
5042	NC_016913	TAA	2	6	198753	198758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016913	A	6	6	198860	198865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016913	AATTT	2	10	198874	198883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016913	CAA	2	6	198934	198939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016030
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5047	NC_016913	TA	3	6	198980	198985	50 %	50 %	0 %	0 %	379016030
5048	NC_016913	TAC	2	6	199072	199077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016030
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5050	NC_016913	TAAA	2	8	199114	199121	75 %	25 %	0 %	0 %	379016030
5051	NC_016913	CAG	2	6	199131	199136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016030
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5053	NC_016913	ATT	2	6	199211	199216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016030
5054	NC_016913	T	6	6	199293	199298	0 %	100 %	0 %	0 %	379016030
5055	NC_016913	TAT	2	6	199310	199315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016030
5056	NC_016913	AATCAT	2	12	199319	199330	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379016030
5057	NC_016913	TCA	2	6	199360	199365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016030
5058	NC_016913	AT	3	6	199378	199383	50 %	50 %	0 %	0 %	379016030
5059	NC_016913	TA	3	6	199427	199432	50 %	50 %	0 %	0 %	379016030
5060	NC_016913	AT	3	6	199437	199442	50 %	50 %	0 %	0 %	379016030
5061	NC_016913	TGA	2	6	199517	199522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016030
5062	NC_016913	TAC	2	6	199523	199528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016030
5063	NC_016913	GAG	2	6	199537	199542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379016030
5064	NC_016913	T	6	6	199607	199612	0 %	100 %	0 %	0 %	379016030
5065	NC_016913	TAT	2	6	199738	199743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016030
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5072	NC_016913	AT	3	6	199895	199900	50 %	50 %	0 %	0 %	379016030
5073	NC_016913	TAA	2	6	199925	199930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016030
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5081	NC_016913	A	8	8	200147	200154	100 %	0 %	0 %	0 %	379016030
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5084	NC_016913	TAA	2	6	200265	200270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_016913	T	6	6	200918	200923	0 %	100 %	0 %	0 %	379016031
5099	NC_016913	AG	3	6	200952	200957	50 %	0 %	50 %	0 %	379016031
5100	NC_016913	A	7	7	201011	201017	100 %	0 %	0 %	0 %	379016031
5101	NC_016913	TAT	2	6	201020	201025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016031
5102	NC_016913	GA	3	6	201056	201061	50 %	0 %	50 %	0 %	379016031
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5105	NC_016913	TACT	2	8	201135	201142	25 %	50 %	0 %	25 %	379016032
5106	NC_016913	TAC	2	6	201147	201152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016032
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5110	NC_016913	TGA	2	6	201368	201373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016032
5111	NC_016913	ATG	2	6	201392	201397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016032
5112	NC_016913	AAC	2	6	201408	201413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016032
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5114	NC_016913	T	6	6	201443	201448	0 %	100 %	0 %	0 %	379016032
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5116	NC_016913	T	7	7	201522	201528	0 %	100 %	0 %	0 %	379016032
5117	NC_016913	TAC	2	6	201741	201746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016032
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5122	NC_016913	GTA	2	6	202133	202138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016032
5123	NC_016913	CAAA	2	8	202169	202176	75 %	0 %	0 %	25 %	379016032
5124	NC_016913	TTA	2	6	202186	202191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016032
5125	NC_016913	TAC	2	6	202197	202202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016032
5126	NC_016913	AAT	2	6	202219	202224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016032
5127	NC_016913	AT	3	6	202267	202272	50 %	50 %	0 %	0 %	379016032
5128	NC_016913	TAA	2	6	202344	202349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016032
5129	NC_016913	ATT	2	6	202363	202368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016032
5130	NC_016913	A	7	7	202423	202429	100 %	0 %	0 %	0 %	379016032
5131	NC_016913	TAAA	2	8	202550	202557	75 %	25 %	0 %	0 %	379016032
5132	NC_016913	GAA	2	6	202558	202563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016032
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5134	NC_016913	GT	3	6	202653	202658	0 %	50 %	50 %	0 %	379016032
5135	NC_016913	AC	3	6	202684	202689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_016913	CTA	2	6	202690	202695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_016913	GTA	2	6	202740	202745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016033
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5159	NC_016913	ATA	2	6	203664	203669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016033
5160	NC_016913	A	6	6	203674	203679	100 %	0 %	0 %	0 %	379016033
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5163	NC_016913	CAT	2	6	203784	203789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016034
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5167	NC_016913	CTG	2	6	203944	203949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5199	NC_016913	A	6	6	205134	205139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5200	NC_016913	ATT	2	6	205151	205156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_016913	TAT	2	6	206037	206042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5225	NC_016913	T	7	7	206218	206224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_016913	T	6	6	206229	206234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_016913	GTT	2	6	206650	206655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_016913	ATG	2	6	206703	206708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_016913	AT	3	6	206732	206737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_016913	ATA	2	6	206857	206862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_016913	CAT	2	6	206866	206871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_016913	TAA	2	6	207007	207012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5421	NC_016913	A	6	6	213334	213339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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