MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016913	T	6	6	178067	178072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016913	TTA	2	6	178103	178108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016913	ATT	2	6	178145	178150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016913	ATTA	2	8	178180	178187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016913	GTA	2	6	178230	178235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016014
4506	NC_016913	CTG	2	6	178285	178290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016014
4507	NC_016913	TTG	2	6	178310	178315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016014
4508	NC_016913	GTT	2	6	178344	178349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016014
4509	NC_016913	GGCA	2	8	178364	178371	25 %	0 %	50 %	25 %	379016014
4510	NC_016913	TGA	2	6	178379	178384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016014
4511	NC_016913	TAA	2	6	178415	178420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016014
4512	NC_016913	TAA	2	6	178427	178432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016014
4513	NC_016913	T	6	6	178452	178457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016913	T	6	6	178524	178529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016913	TAA	2	6	178550	178555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016913	AT	3	6	178556	178561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016913	TA	3	6	178566	178571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016913	CT	3	6	178759	178764	0 %	50 %	0 %	50 %	379016015
4519	NC_016913	ACT	2	6	178823	178828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016015
4520	NC_016913	TAC	2	6	178869	178874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016015
4521	NC_016913	ATA	2	6	178895	178900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4522	NC_016913	ATT	2	6	178913	178918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4523	NC_016913	T	8	8	178917	178924	0 %	100 %	0 %	0 %	379016015
4524	NC_016913	TCA	2	6	178976	178981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016015
4525	NC_016913	GTA	2	6	179004	179009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016015
4526	NC_016913	TCC	2	6	179041	179046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016015
4527	NC_016913	AGC	2	6	179101	179106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016015
4528	NC_016913	TTC	2	6	179110	179115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016015
4529	NC_016913	TAT	2	6	179131	179136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4530	NC_016913	ATTT	2	8	179140	179147	25 %	75 %	0 %	0 %	379016015
4531	NC_016913	CGT	2	6	179148	179153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016015
4532	NC_016913	GCTT	2	8	179155	179162	0 %	50 %	25 %	25 %	379016015
4533	NC_016913	ATT	2	6	179164	179169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4534	NC_016913	ATA	2	6	179177	179182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4535	NC_016913	A	6	6	179202	179207	100 %	0 %	0 %	0 %	379016015
4536	NC_016913	CAG	2	6	179250	179255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016015
4537	NC_016913	TAA	2	6	179283	179288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4538	NC_016913	GCA	2	6	179319	179324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016015
4539	NC_016913	CTAC	2	8	179360	179367	25 %	25 %	0 %	50 %	379016015
4540	NC_016913	ATT	2	6	179407	179412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4541	NC_016913	AAT	2	6	179413	179418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4542	NC_016913	ATT	2	6	179485	179490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4543	NC_016913	ATT	2	6	179503	179508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4544	NC_016913	ATT	2	6	179540	179545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4545	NC_016913	TAG	2	6	179581	179586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016015
4546	NC_016913	ATA	2	6	179626	179631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4547	NC_016913	ATT	2	6	179857	179862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
4548	NC_016913	TCA	2	6	179870	179875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016015
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4550	NC_016913	TTAA	2	8	179945	179952	50 %	50 %	0 %	0 %	379016015
4551	NC_016913	TAA	2	6	179959	179964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4552	NC_016913	TAA	2	6	179976	179981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4553	NC_016913	A	6	6	180010	180015	100 %	0 %	0 %	0 %	379016015
4554	NC_016913	TAATG	2	10	180019	180028	40 %	40 %	20 %	0 %	379016015
4555	NC_016913	A	7	7	180058	180064	100 %	0 %	0 %	0 %	379016015
4556	NC_016913	TTC	2	6	180142	180147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016015
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4558	NC_016913	CTT	2	6	180186	180191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016015
4559	NC_016913	ATT	2	6	180223	180228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016015
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4562	NC_016913	TAA	2	6	180274	180279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4563	NC_016913	AT	3	6	180284	180289	50 %	50 %	0 %	0 %	379016015
4564	NC_016913	TAA	2	6	180370	180375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016015
4565	NC_016913	GAT	2	6	180409	180414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016015
4566	NC_016913	T	6	6	180421	180426	0 %	100 %	0 %	0 %	379016015
4567	NC_016913	TA	3	6	180453	180458	50 %	50 %	0 %	0 %	379016015
4568	NC_016913	A	7	7	180478	180484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016913	GCGA	2	8	180492	180499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_016913	GTT	2	6	180508	180513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_016913	AGCGA	2	10	180542	180551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4572	NC_016913	A	6	6	180574	180579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016913	T	6	6	180595	180600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016913	CGT	2	6	180610	180615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_016913	TTC	2	6	180632	180637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_016913	ATG	2	6	180641	180646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016913	CA	3	6	180657	180662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_016913	AAC	2	6	180762	180767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_016913	AT	3	6	180819	180824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016913	TA	3	6	180834	180839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016913	TA	4	8	180847	180854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016913	ACA	2	6	180858	180863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016016
4583	NC_016913	TA	3	6	180872	180877	50 %	50 %	0 %	0 %	379016016
4584	NC_016913	AAAG	2	8	180882	180889	75 %	0 %	25 %	0 %	379016016
4585	NC_016913	ACA	2	6	181226	181231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016017
4586	NC_016913	GAAA	2	8	181247	181254	75 %	0 %	25 %	0 %	379016017
4587	NC_016913	TA	3	6	181257	181262	50 %	50 %	0 %	0 %	379016017
4588	NC_016913	AATC	2	8	181269	181276	50 %	25 %	0 %	25 %	379016017
4589	NC_016913	A	8	8	181433	181440	100 %	0 %	0 %	0 %	379016017
4590	NC_016913	TTA	2	6	181451	181456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016018
4591	NC_016913	CTA	2	6	181473	181478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016018
4592	NC_016913	A	6	6	181563	181568	100 %	0 %	0 %	0 %	379016018
4593	NC_016913	ATTA	2	8	181576	181583	50 %	50 %	0 %	0 %	379016018
4594	NC_016913	ACA	2	6	181600	181605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016018
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4596	NC_016913	TGA	2	6	181654	181659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016018
4597	NC_016913	AC	3	6	181807	181812	50 %	0 %	0 %	50 %	379016018
4598	NC_016913	ACTA	2	8	181823	181830	50 %	25 %	0 %	25 %	379016018
4599	NC_016913	GTC	2	6	181839	181844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016018
4600	NC_016913	AT	3	6	181849	181854	50 %	50 %	0 %	0 %	379016018
4601	NC_016913	A	6	6	181908	181913	100 %	0 %	0 %	0 %	379016018
4602	NC_016913	TAA	2	6	181932	181937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016018
4603	NC_016913	A	6	6	181961	181966	100 %	0 %	0 %	0 %	379016018
4604	NC_016913	AGA	2	6	182020	182025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016018
4605	NC_016913	AAT	2	6	182084	182089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016018
4606	NC_016913	GTAT	2	8	182107	182114	25 %	50 %	25 %	0 %	379016018
4607	NC_016913	AT	3	6	182123	182128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016913	ATAA	2	8	182133	182140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016913	TAA	3	9	182144	182152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016913	AAT	2	6	182153	182158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016913	GTT	2	6	182190	182195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016913	ATT	2	6	182210	182215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016913	TCT	2	6	182222	182227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_016913	TATAA	2	10	182229	182238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016913	CATATT	2	12	182245	182256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4616	NC_016913	TA	3	6	182275	182280	50 %	50 %	0 %	0 %	379016019
4617	NC_016913	GGA	2	6	182357	182362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379016019
4618	NC_016913	ATT	2	6	182371	182376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016019
4619	NC_016913	TA	3	6	182409	182414	50 %	50 %	0 %	0 %	379016019
4620	NC_016913	AGA	2	6	182441	182446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016019
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4622	NC_016913	ATA	2	6	182527	182532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016019
4623	NC_016913	TAATA	2	10	182555	182564	60 %	40 %	0 %	0 %	379016019
4624	NC_016913	CAT	2	6	182574	182579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016019
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4626	NC_016913	TAT	2	6	182678	182683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016019
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