MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016911	TGC	2	6	117396	117401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723501
3002	NC_016911	ATG	2	6	117440	117445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723501
3003	NC_016911	TTA	2	6	117461	117466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723501
3004	NC_016911	TA	3	6	117613	117618	50 %	50 %	0 %	0 %	378723501
3005	NC_016911	A	7	7	117750	117756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016911	GTC	2	6	117829	117834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016911	CTA	2	6	117891	117896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016911	GTT	2	6	117905	117910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016911	TAT	2	6	117949	117954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016911	TAC	2	6	118050	118055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016911	AGA	2	6	118056	118061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016911	T	6	6	118137	118142	0 %	100 %	0 %	0 %	378723502
3013	NC_016911	AGT	2	6	118271	118276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016911	TAT	2	6	118280	118285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016911	TAA	2	6	118450	118455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3016	NC_016911	ATT	2	6	118496	118501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723503
3017	NC_016911	TTAGT	2	10	118519	118528	20 %	60 %	20 %	0 %	378723503
3018	NC_016911	GCT	2	6	118560	118565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723503
3019	NC_016911	ATA	2	6	118623	118628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3020	NC_016911	TGC	2	6	118643	118648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723503
3021	NC_016911	CCG	2	6	118683	118688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723503
3022	NC_016911	A	7	7	118711	118717	100 %	0 %	0 %	0 %	378723503
3023	NC_016911	TA	3	6	118745	118750	50 %	50 %	0 %	0 %	378723503
3024	NC_016911	ATC	2	6	118754	118759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723503
3025	NC_016911	TAGCGG	2	12	118789	118800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378723503
3026	NC_016911	ATA	2	6	118866	118871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3027	NC_016911	CTT	2	6	118999	119004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723503
3028	NC_016911	A	6	6	119141	119146	100 %	0 %	0 %	0 %	378723503
3029	NC_016911	TAG	2	6	119201	119206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723503
3030	NC_016911	ATA	2	6	119313	119318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3031	NC_016911	TATC	2	8	119320	119327	25 %	50 %	0 %	25 %	378723503
3032	NC_016911	AAG	2	6	119395	119400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723503
3033	NC_016911	AACG	2	8	119410	119417	50 %	0 %	25 %	25 %	378723503
3034	NC_016911	TAT	2	6	119437	119442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723503
3035	NC_016911	TGCT	2	8	119476	119483	0 %	50 %	25 %	25 %	378723503
3036	NC_016911	TTA	2	6	119616	119621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723503
3037	NC_016911	TCT	2	6	119700	119705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723503
3038	NC_016911	TAA	2	6	119714	119719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3039	NC_016911	TAA	2	6	119750	119755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3040	NC_016911	ATA	2	6	119771	119776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3041	NC_016911	TAA	2	6	119777	119782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723503
3042	NC_016911	CAT	2	6	119783	119788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723503
3043	NC_016911	TAT	2	6	119911	119916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723504
3044	NC_016911	TAA	2	6	119970	119975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723504
3045	NC_016911	TA	3	6	120024	120029	50 %	50 %	0 %	0 %	378723504
3046	NC_016911	TAT	2	6	120058	120063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723504
3047	NC_016911	TAG	2	6	120123	120128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723504
3048	NC_016911	CTA	2	6	120132	120137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723504
3049	NC_016911	CTA	2	6	120159	120164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723504
3050	NC_016911	AAGTA	2	10	120342	120351	60 %	20 %	20 %	0 %	378723504
3051	NC_016911	TATT	2	8	120401	120408	25 %	75 %	0 %	0 %	378723504
3052	NC_016911	T	6	6	120410	120415	0 %	100 %	0 %	0 %	378723504
3053	NC_016911	T	6	6	120421	120426	0 %	100 %	0 %	0 %	378723504
3054	NC_016911	ATT	2	6	120440	120445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723504
3055	NC_016911	T	7	7	120444	120450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016911	AAGT	2	8	120500	120507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016911	GCT	2	6	120555	120560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_016911	ATG	2	6	120565	120570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016911	TC	3	6	120616	120621	0 %	50 %	0 %	50 %	378723505
3060	NC_016911	TAC	2	6	120709	120714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723505
3061	NC_016911	CTT	2	6	120726	120731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723505
3062	NC_016911	AAT	2	6	120766	120771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3063	NC_016911	T	7	7	120896	120902	0 %	100 %	0 %	0 %	378723505
3064	NC_016911	TA	3	6	120925	120930	50 %	50 %	0 %	0 %	378723505
3065	NC_016911	AGC	2	6	120958	120963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723505
3066	NC_016911	AAT	2	6	121006	121011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3067	NC_016911	T	6	6	121112	121117	0 %	100 %	0 %	0 %	378723505
3068	NC_016911	ATC	2	6	121156	121161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723505
3069	NC_016911	ATC	2	6	121183	121188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723505
3070	NC_016911	TTC	2	6	121243	121248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723505
3071	NC_016911	TAA	3	9	121287	121295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3072	NC_016911	AAT	2	6	121438	121443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3073	NC_016911	TA	4	8	121482	121489	50 %	50 %	0 %	0 %	378723505
3074	NC_016911	CCG	2	6	121499	121504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723505
3075	NC_016911	TAT	2	6	121513	121518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723505
3076	NC_016911	TCA	2	6	121520	121525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723505
3077	NC_016911	TAT	2	6	121539	121544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723505
3078	NC_016911	TTGC	2	8	121569	121576	0 %	50 %	25 %	25 %	378723505
3079	NC_016911	CGC	2	6	121639	121644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723505
3080	NC_016911	ATA	2	6	121697	121702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3081	NC_016911	T	6	6	121714	121719	0 %	100 %	0 %	0 %	378723505
3082	NC_016911	T	7	7	121731	121737	0 %	100 %	0 %	0 %	378723505
3083	NC_016911	AAT	2	6	121786	121791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723505
3084	NC_016911	TA	3	6	121830	121835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016911	AT	3	6	121861	121866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016911	ATA	2	6	121908	121913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016911	CTT	2	6	121956	121961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_016911	T	6	6	121967	121972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016911	T	7	7	121996	122002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016911	T	6	6	122012	122017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016911	TCC	2	6	122031	122036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_016911	CTCAAT	2	12	122054	122065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_016911	T	7	7	122115	122121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016911	ATTCG	2	10	122122	122131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_016911	AGATT	2	10	122140	122149	40 %	40 %	20 %	0 %	378723506
3096	NC_016911	TTC	3	9	122181	122189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723506
3097	NC_016911	AAT	2	6	122199	122204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723506
3098	NC_016911	TTCT	2	8	122215	122222	0 %	75 %	0 %	25 %	378723506
3099	NC_016911	TAA	2	6	122225	122230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723506
3100	NC_016911	T	6	6	122278	122283	0 %	100 %	0 %	0 %	378723506
3101	NC_016911	CTAC	2	8	122316	122323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_016911	TAA	2	6	122329	122334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016911	ATT	3	9	122376	122384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016911	TAT	2	6	122413	122418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016911	TAAAA	2	10	122457	122466	80 %	20 %	0 %	0 %	378723507
3106	NC_016911	ATT	2	6	122480	122485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723507
3107	NC_016911	TAA	2	6	122495	122500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723507
3108	NC_016911	TTA	2	6	122513	122518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723507
3109	NC_016911	TA	3	6	122545	122550	50 %	50 %	0 %	0 %	378723507
3110	NC_016911	CT	3	6	122569	122574	0 %	50 %	0 %	50 %	378723507
3111	NC_016911	TA	3	6	122615	122620	50 %	50 %	0 %	0 %	378723507
3112	NC_016911	ATG	2	6	122633	122638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723507
3113	NC_016911	T	6	6	122668	122673	0 %	100 %	0 %	0 %	378723507
3114	NC_016911	T	6	6	122718	122723	0 %	100 %	0 %	0 %	378723507
3115	NC_016911	A	6	6	122724	122729	100 %	0 %	0 %	0 %	378723507
3116	NC_016911	T	6	6	122796	122801	0 %	100 %	0 %	0 %	378723507
3117	NC_016911	CTA	2	6	122879	122884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723507
3118	NC_016911	TAA	2	6	122889	122894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723507
3119	NC_016911	AT	3	6	123124	123129	50 %	50 %	0 %	0 %	378723507
3120	NC_016911	AAAAC	2	10	123153	123162	80 %	0 %	0 %	20 %	378723507
3121	NC_016911	TAA	2	6	123165	123170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723507
3122	NC_016911	ATT	2	6	123178	123183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723507
3123	NC_016911	TTTAA	2	10	123229	123238	40 %	60 %	0 %	0 %	378723507
3124	NC_016911	TAA	2	6	123252	123257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723507
3125	NC_016911	CGA	2	6	123290	123295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723507
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3127	NC_016911	TGAA	2	8	123338	123345	50 %	25 %	25 %	0 %	378723507
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