MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_016911	ATTT	2	8	1219610	1219617	25 %	75 %	0 %	0 %	378724656
31003	NC_016911	T	6	6	1219797	1219802	0 %	100 %	0 %	0 %	378724656
31004	NC_016911	ATT	2	6	1219803	1219808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724656
31005	NC_016911	TAA	2	6	1219812	1219817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724656
31006	NC_016911	TATTT	2	10	1219869	1219878	20 %	80 %	0 %	0 %	378724656
31007	NC_016911	A	6	6	1219893	1219898	100 %	0 %	0 %	0 %	378724656
31008	NC_016911	A	7	7	1219904	1219910	100 %	0 %	0 %	0 %	378724656
31009	NC_016911	ATT	2	6	1220000	1220005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724656
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31011	NC_016911	TAAA	2	8	1220054	1220061	75 %	25 %	0 %	0 %	378724656
31012	NC_016911	ATT	2	6	1220066	1220071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724656
31013	NC_016911	ATC	2	6	1220105	1220110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724656
31014	NC_016911	TAT	2	6	1220145	1220150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724656
31015	NC_016911	CAT	2	6	1220230	1220235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724657
31016	NC_016911	GCA	2	6	1220241	1220246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724657
31017	NC_016911	ATTGCT	2	12	1220342	1220353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724657
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31019	NC_016911	TAG	2	6	1220536	1220541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724657
31020	NC_016911	GTT	2	6	1220550	1220555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724657
31021	NC_016911	TAAAA	2	10	1220609	1220618	80 %	20 %	0 %	0 %	378724657
31022	NC_016911	CTG	2	6	1220782	1220787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724657
31023	NC_016911	ATC	2	6	1220879	1220884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724657
31024	NC_016911	TGCT	2	8	1220903	1220910	0 %	50 %	25 %	25 %	378724657
31025	NC_016911	GGA	2	6	1220915	1220920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378724657
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31033	NC_016911	T	6	6	1221285	1221290	0 %	100 %	0 %	0 %	378724658
31034	NC_016911	AAT	2	6	1221302	1221307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724658
31035	NC_016911	TAA	2	6	1221400	1221405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724658
31036	NC_016911	TTGC	2	8	1221406	1221413	0 %	50 %	25 %	25 %	378724658
31037	NC_016911	TCT	2	6	1221419	1221424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724658
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31039	NC_016911	CTA	2	6	1221465	1221470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724658
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31041	NC_016911	A	7	7	1221544	1221550	100 %	0 %	0 %	0 %	378724658
31042	NC_016911	ATT	2	6	1221554	1221559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724658
31043	NC_016911	TA	3	6	1221588	1221593	50 %	50 %	0 %	0 %	378724658
31044	NC_016911	ATTA	2	8	1221607	1221614	50 %	50 %	0 %	0 %	378724658
31045	NC_016911	ATTT	2	8	1221636	1221643	25 %	75 %	0 %	0 %	378724658
31046	NC_016911	TAT	2	6	1221649	1221654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724658
31047	NC_016911	TTA	2	6	1221657	1221662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724658
31048	NC_016911	ATC	2	6	1221725	1221730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724658
31049	NC_016911	CTA	2	6	1221735	1221740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724658
31050	NC_016911	ATA	3	9	1221871	1221879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724658
31051	NC_016911	GCT	2	6	1221950	1221955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724658
31052	NC_016911	TTA	2	6	1221968	1221973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724658
31053	NC_016911	TA	3	6	1221982	1221987	50 %	50 %	0 %	0 %	378724658
31054	NC_016911	T	6	6	1222014	1222019	0 %	100 %	0 %	0 %	378724658
31055	NC_016911	GAA	2	6	1222268	1222273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724658
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31061	NC_016911	CTA	2	6	1222362	1222367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724658
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31070	NC_016911	T	7	7	1222740	1222746	0 %	100 %	0 %	0 %	378724658
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31084	NC_016911	CT	3	6	1223400	1223405	0 %	50 %	0 %	50 %	378724659
31085	NC_016911	TCA	2	6	1223410	1223415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724659
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31087	NC_016911	AAGC	2	8	1223432	1223439	50 %	0 %	25 %	25 %	378724659
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31098	NC_016911	AAT	2	6	1223907	1223912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724659
31099	NC_016911	T	6	6	1223928	1223933	0 %	100 %	0 %	0 %	378724659
31100	NC_016911	TAT	3	9	1223941	1223949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_016911	GAAA	2	8	1223953	1223960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31102	NC_016911	TTAA	2	8	1223991	1223998	50 %	50 %	0 %	0 %	378724660
31103	NC_016911	CTC	2	6	1224114	1224119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724660
31104	NC_016911	T	7	7	1224125	1224131	0 %	100 %	0 %	0 %	378724660
31105	NC_016911	T	6	6	1224146	1224151	0 %	100 %	0 %	0 %	378724660
31106	NC_016911	TAT	3	9	1224162	1224170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724660
31107	NC_016911	TCTT	2	8	1224211	1224218	0 %	75 %	0 %	25 %	378724660
31108	NC_016911	GAAT	2	8	1224283	1224290	50 %	25 %	25 %	0 %	378724660
31109	NC_016911	TGC	2	6	1224303	1224308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724660
31110	NC_016911	T	6	6	1224324	1224329	0 %	100 %	0 %	0 %	378724660
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31113	NC_016911	CT	3	6	1224403	1224408	0 %	50 %	0 %	50 %	378724661
31114	NC_016911	AATA	2	8	1224441	1224448	75 %	25 %	0 %	0 %	378724661
31115	NC_016911	GTT	2	6	1224478	1224483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724661
31116	NC_016911	TAA	2	6	1224499	1224504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724661
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31118	NC_016911	AAT	2	6	1224566	1224571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724661
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31466	NC_016911	GCT	2	6	1237462	1237467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724669
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31473	NC_016911	A	6	6	1238000	1238005	100 %	0 %	0 %	0 %	378724670
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31478	NC_016911	ATT	2	6	1238110	1238115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724670
31479	NC_016911	TTA	2	6	1238151	1238156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724670
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