MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_016911	TTC	2	6	1200002	1200007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724636
30503	NC_016911	TAA	2	6	1200014	1200019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724636
30504	NC_016911	T	6	6	1200028	1200033	0 %	100 %	0 %	0 %	378724636
30505	NC_016911	TCT	2	6	1200064	1200069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30506	NC_016911	ATT	2	6	1200076	1200081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30507	NC_016911	A	6	6	1200086	1200091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30508	NC_016911	GATTA	2	10	1200125	1200134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30509	NC_016911	TA	3	6	1200200	1200205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30510	NC_016911	AAT	2	6	1200350	1200355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724637
30511	NC_016911	CAA	2	6	1200418	1200423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724637
30512	NC_016911	TTA	2	6	1200447	1200452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30513	NC_016911	TCG	2	6	1200456	1200461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724637
30514	NC_016911	TCA	2	6	1200483	1200488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
30515	NC_016911	TA	3	6	1200491	1200496	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30516	NC_016911	CAC	2	6	1200556	1200561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724637
30517	NC_016911	AGT	2	6	1200569	1200574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724637
30518	NC_016911	TAAT	2	8	1200622	1200629	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30519	NC_016911	T	6	6	1200649	1200654	0 %	100 %	0 %	0 %	378724637
30520	NC_016911	A	6	6	1200656	1200661	100 %	0 %	0 %	0 %	378724637
30521	NC_016911	GCATC	2	10	1200664	1200673	20 %	20 %	20 %	40 %	378724637
30522	NC_016911	TCA	3	9	1200682	1200690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
30523	NC_016911	TATTT	2	10	1200717	1200726	20 %	80 %	0 %	0 %	378724637
30524	NC_016911	TAT	2	6	1200739	1200744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30525	NC_016911	TTA	2	6	1200808	1200813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30526	NC_016911	ACC	2	6	1200842	1200847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724637
30527	NC_016911	GAG	2	6	1200964	1200969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378724637
30528	NC_016911	GATT	2	8	1200984	1200991	25 %	50 %	25 %	0 %	378724637
30529	NC_016911	AT	3	6	1201011	1201016	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30530	NC_016911	CT	3	6	1201031	1201036	0 %	50 %	0 %	50 %	378724637
30531	NC_016911	TA	3	6	1201090	1201095	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30532	NC_016911	ATC	2	6	1201104	1201109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
30533	NC_016911	TTG	2	6	1201191	1201196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724637
30534	NC_016911	TAT	2	6	1201225	1201230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30535	NC_016911	GAC	2	6	1201270	1201275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724637
30536	NC_016911	TACC	2	8	1201284	1201291	25 %	25 %	0 %	50 %	378724637
30537	NC_016911	TTC	2	6	1201301	1201306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724637
30538	NC_016911	TTC	2	6	1201319	1201324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724637
30539	NC_016911	TTCC	2	8	1201330	1201337	0 %	50 %	0 %	50 %	378724637
30540	NC_016911	CCG	2	6	1201350	1201355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378724637
30541	NC_016911	AAT	2	6	1201382	1201387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724637
30542	NC_016911	AT	3	6	1201400	1201405	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30543	NC_016911	TCA	2	6	1201413	1201418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
30544	NC_016911	TAT	2	6	1201483	1201488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30545	NC_016911	TGA	2	6	1201494	1201499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724637
30546	NC_016911	TCA	2	6	1201515	1201520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
30547	NC_016911	C	8	8	1201585	1201592	0 %	0 %	0 %	100 %	378724637
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30549	NC_016911	AATA	2	8	1201691	1201698	75 %	25 %	0 %	0 %	378724637
30550	NC_016911	TTTA	2	8	1201706	1201713	25 %	75 %	0 %	0 %	378724637
30551	NC_016911	TCT	2	6	1201719	1201724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724637
30552	NC_016911	TTC	2	6	1201874	1201879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724637
30553	NC_016911	TTAA	2	8	1201881	1201888	50 %	50 %	0 %	0 %	378724637
30554	NC_016911	TAT	2	6	1201928	1201933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30555	NC_016911	GTT	2	6	1201945	1201950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724637
30556	NC_016911	TTA	2	6	1201951	1201956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
30557	NC_016911	AAATA	2	10	1202015	1202024	80 %	20 %	0 %	0 %	378724637
30558	NC_016911	TAC	2	6	1202125	1202130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724637
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30561	NC_016911	CGG	2	6	1202363	1202368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724637
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30563	NC_016911	TAT	2	6	1202488	1202493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724637
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30567	NC_016911	ACCC	2	8	1202738	1202745	25 %	0 %	0 %	75 %	378724637
30568	NC_016911	ATA	2	6	1202752	1202757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724637
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30574	NC_016911	TCACT	2	10	1203094	1203103	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30575	NC_016911	T	6	6	1203121	1203126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30579	NC_016911	TAAA	2	8	1203209	1203216	75 %	25 %	0 %	0 %	378724638
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30591	NC_016911	CTA	2	6	1203724	1203729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724639
30592	NC_016911	ATG	2	6	1203733	1203738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724639
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30605	NC_016911	A	6	6	1204406	1204411	100 %	0 %	0 %	0 %	378724639
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30607	NC_016911	ATT	2	6	1204509	1204514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30612	NC_016911	CAA	2	6	1204727	1204732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724640
30613	NC_016911	TAT	2	6	1204880	1204885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30614	NC_016911	AAT	2	6	1204901	1204906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30615	NC_016911	TAA	2	6	1204916	1204921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30616	NC_016911	TAA	2	6	1204926	1204931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30617	NC_016911	CA	3	6	1204991	1204996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30618	NC_016911	AGC	2	6	1205016	1205021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724641
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