MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_016911	TGCATT	2	12	1182069	1182080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724615
30002	NC_016911	GCA	2	6	1182100	1182105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30003	NC_016911	GTA	2	6	1182121	1182126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30004	NC_016911	TAA	2	6	1182131	1182136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30005	NC_016911	ATT	2	6	1182246	1182251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30006	NC_016911	TAT	2	6	1182263	1182268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30007	NC_016911	CAC	2	6	1182282	1182287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724615
30008	NC_016911	CTG	2	6	1182308	1182313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30009	NC_016911	GCA	2	6	1182316	1182321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30010	NC_016911	GTA	2	6	1182337	1182342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30011	NC_016911	TAA	2	6	1182347	1182352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30012	NC_016911	ATTTAA	2	12	1182447	1182458	50 %	50 %	0 %	0 %	378724615
30013	NC_016911	TGCATT	2	12	1182510	1182521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724615
30014	NC_016911	GCA	2	6	1182541	1182546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30015	NC_016911	GTA	2	6	1182562	1182567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30016	NC_016911	TAA	2	6	1182572	1182577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30017	NC_016911	ATT	2	6	1182687	1182692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30018	NC_016911	TAT	2	6	1182704	1182709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30019	NC_016911	CAC	2	6	1182723	1182728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724615
30020	NC_016911	CTG	2	6	1182749	1182754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30021	NC_016911	CTTGTA	2	12	1182800	1182811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724615
30022	NC_016911	ATT	2	6	1182903	1182908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30023	NC_016911	TAT	2	6	1182920	1182925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30024	NC_016911	CAC	2	6	1182939	1182944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724615
30025	NC_016911	CTG	2	6	1182965	1182970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30026	NC_016911	GCA	2	6	1182973	1182978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30027	NC_016911	GTA	2	6	1182994	1182999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30028	NC_016911	TAA	2	6	1183004	1183009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30029	NC_016911	ATTTAA	2	12	1183104	1183115	50 %	50 %	0 %	0 %	378724615
30030	NC_016911	TGCATT	2	12	1183167	1183178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724615
30031	NC_016911	GCA	2	6	1183198	1183203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30032	NC_016911	GTA	2	6	1183219	1183224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30033	NC_016911	TAA	2	6	1183229	1183234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30034	NC_016911	GCA	2	6	1183315	1183320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30035	NC_016911	TTA	2	6	1183334	1183339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30036	NC_016911	CCT	2	6	1183342	1183347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724615
30037	NC_016911	GCA	2	6	1183405	1183410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30038	NC_016911	GCA	2	6	1183480	1183485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30039	NC_016911	ATT	2	6	1183491	1183496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30040	NC_016911	CAA	2	6	1183539	1183544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724615
30041	NC_016911	AGT	2	6	1183605	1183610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
30042	NC_016911	TAA	2	6	1183631	1183636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30043	NC_016911	CAC	2	6	1183670	1183675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724615
30044	NC_016911	GTAA	2	8	1183677	1183684	50 %	25 %	25 %	0 %	378724615
30045	NC_016911	CAG	2	6	1183709	1183714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30046	NC_016911	ATT	3	9	1183755	1183763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30047	NC_016911	ATT	2	6	1183770	1183775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30048	NC_016911	TGC	2	6	1183782	1183787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724615
30049	NC_016911	ATT	3	9	1183788	1183796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
30050	NC_016911	CTA	2	6	1183834	1183839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724615
30051	NC_016911	GGT	2	6	1183863	1183868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724615
30052	NC_016911	TTG	2	6	1183890	1183895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724615
30053	NC_016911	T	6	6	1183902	1183907	0 %	100 %	0 %	0 %	378724615
30054	NC_016911	AAT	2	6	1183909	1183914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
30055	NC_016911	T	6	6	1183986	1183991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_016911	TAT	2	6	1184000	1184005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30057	NC_016911	TAA	2	6	1184009	1184014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30058	NC_016911	GAT	2	6	1184019	1184024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30059	NC_016911	TTG	2	6	1184069	1184074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724616
30060	NC_016911	CTG	2	6	1184090	1184095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724616
30061	NC_016911	AGGG	2	8	1184128	1184135	25 %	0 %	75 %	0 %	378724616
30062	NC_016911	TAA	2	6	1184201	1184206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30063	NC_016911	CAT	3	9	1184207	1184215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30064	NC_016911	ATA	2	6	1184220	1184225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30065	NC_016911	AAT	2	6	1184248	1184253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30066	NC_016911	TAAT	2	8	1184320	1184327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30067	NC_016911	GT	3	6	1184335	1184340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30068	NC_016911	TTC	2	6	1184361	1184366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30069	NC_016911	ATG	2	6	1184388	1184393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30070	NC_016911	TA	3	6	1184444	1184449	50 %	50 %	0 %	0 %	378724617
30071	NC_016911	CTA	2	6	1184460	1184465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724617
30072	NC_016911	AT	3	6	1184482	1184487	50 %	50 %	0 %	0 %	378724617
30073	NC_016911	AT	3	6	1184545	1184550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30074	NC_016911	T	6	6	1184625	1184630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30075	NC_016911	CAA	2	6	1184671	1184676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30076	NC_016911	A	6	6	1184703	1184708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30077	NC_016911	AAT	2	6	1184726	1184731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30078	NC_016911	TC	3	6	1184733	1184738	0 %	50 %	0 %	50 %	378724618
30079	NC_016911	GGT	2	6	1184756	1184761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724618
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30081	NC_016911	T	6	6	1184884	1184889	0 %	100 %	0 %	0 %	378724618
30082	NC_016911	TCA	2	6	1184900	1184905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30083	NC_016911	CTA	2	6	1184930	1184935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30084	NC_016911	TCT	2	6	1184939	1184944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
30085	NC_016911	AT	3	6	1184969	1184974	50 %	50 %	0 %	0 %	378724618
30086	NC_016911	CT	4	8	1184985	1184992	0 %	50 %	0 %	50 %	378724618
30087	NC_016911	ATAA	2	8	1185074	1185081	75 %	25 %	0 %	0 %	378724618
30088	NC_016911	TAA	2	6	1185201	1185206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30089	NC_016911	ATA	3	9	1185233	1185241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30090	NC_016911	TGCC	2	8	1185246	1185253	0 %	25 %	25 %	50 %	378724618
30091	NC_016911	TCA	2	6	1185329	1185334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30092	NC_016911	TCA	2	6	1185510	1185515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30093	NC_016911	CAT	2	6	1185612	1185617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30094	NC_016911	ATCA	2	8	1185643	1185650	50 %	25 %	0 %	25 %	378724618
30095	NC_016911	TTC	2	6	1185664	1185669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
30096	NC_016911	ATC	2	6	1185698	1185703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30097	NC_016911	GGT	2	6	1185733	1185738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724618
30098	NC_016911	CTA	2	6	1185744	1185749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30099	NC_016911	GCT	2	6	1185885	1185890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724618
30100	NC_016911	TTG	2	6	1185942	1185947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724618
30101	NC_016911	CTA	2	6	1185987	1185992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
30102	NC_016911	CTG	2	6	1186011	1186016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724618
30103	NC_016911	ACC	2	6	1186040	1186045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724618
30104	NC_016911	TTGA	2	8	1186051	1186058	25 %	50 %	25 %	0 %	378724618
30105	NC_016911	ATTA	2	8	1186060	1186067	50 %	50 %	0 %	0 %	378724618
30106	NC_016911	TAA	2	6	1186102	1186107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30107	NC_016911	ATG	2	6	1186153	1186158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724618
30108	NC_016911	TAA	2	6	1186174	1186179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30109	NC_016911	GGC	2	6	1186187	1186192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724618
30110	NC_016911	CTT	2	6	1186275	1186280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
30111	NC_016911	AAG	3	9	1186317	1186325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724618
30112	NC_016911	TTATC	2	10	1186332	1186341	20 %	60 %	0 %	20 %	378724618
30113	NC_016911	AAT	2	6	1186358	1186363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
30114	NC_016911	CGA	2	6	1186369	1186374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724618
30115	NC_016911	A	6	6	1186397	1186402	100 %	0 %	0 %	0 %	378724618
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