MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_016911	CAT	2	6	1140796	1140801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724576
29003	NC_016911	ATG	2	6	1140856	1140861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724576
29004	NC_016911	AGC	2	6	1140877	1140882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724576
29005	NC_016911	TAC	2	6	1140900	1140905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724576
29006	NC_016911	GTA	2	6	1140926	1140931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724576
29007	NC_016911	TAT	2	6	1140981	1140986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724576
29008	NC_016911	TGC	2	6	1140990	1140995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724576
29009	NC_016911	ATT	2	6	1141018	1141023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724576
29010	NC_016911	AT	3	6	1141104	1141109	50 %	50 %	0 %	0 %	378724576
29011	NC_016911	AATT	2	8	1141137	1141144	50 %	50 %	0 %	0 %	378724576
29012	NC_016911	ATCT	2	8	1141162	1141169	25 %	50 %	0 %	25 %	378724576
29013	NC_016911	CTT	2	6	1141170	1141175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724576
29014	NC_016911	TAAA	2	8	1141195	1141202	75 %	25 %	0 %	0 %	378724576
29015	NC_016911	GCTT	2	8	1141291	1141298	0 %	50 %	25 %	25 %	378724576
29016	NC_016911	CAA	2	6	1141353	1141358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724576
29017	NC_016911	AGT	2	6	1141423	1141428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724576
29018	NC_016911	CTA	2	6	1141440	1141445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724576
29019	NC_016911	T	6	6	1141573	1141578	0 %	100 %	0 %	0 %	378724576
29020	NC_016911	AAG	2	6	1141582	1141587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724576
29021	NC_016911	TGC	2	6	1141588	1141593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724576
29022	NC_016911	TGC	2	6	1141639	1141644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724576
29023	NC_016911	T	6	6	1141696	1141701	0 %	100 %	0 %	0 %	378724576
29024	NC_016911	CAT	2	6	1141761	1141766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724576
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29027	NC_016911	TAG	2	6	1142019	1142024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724576
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29032	NC_016911	AACTA	2	10	1142299	1142308	60 %	20 %	0 %	20 %	378724576
29033	NC_016911	TGA	2	6	1142369	1142374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724576
29034	NC_016911	TACCCG	2	12	1142379	1142390	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378724576
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29038	NC_016911	TGAA	2	8	1142487	1142494	50 %	25 %	25 %	0 %	378724576
29039	NC_016911	CCT	2	6	1142579	1142584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724576
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29043	NC_016911	TAAA	2	8	1142715	1142722	75 %	25 %	0 %	0 %	378724576
29044	NC_016911	GCTTT	2	10	1142728	1142737	0 %	60 %	20 %	20 %	378724576
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29050	NC_016911	CAT	3	9	1142934	1142942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29054	NC_016911	CAAA	2	8	1143078	1143085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29055	NC_016911	T	6	6	1143106	1143111	0 %	100 %	0 %	0 %	378724577
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29102	NC_016911	T	6	6	1144993	1144998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29103	NC_016911	TA	3	6	1145006	1145011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29104	NC_016911	A	6	6	1145028	1145033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29109	NC_016911	ATT	2	6	1145181	1145186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724579
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29111	NC_016911	GTA	2	6	1145240	1145245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724579
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29118	NC_016911	TATC	2	8	1145432	1145439	25 %	50 %	0 %	25 %	378724579
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29227	NC_016911	TAC	2	6	1150139	1150144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724583
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29232	NC_016911	CATTT	2	10	1150293	1150302	20 %	60 %	0 %	20 %	378724583
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29234	NC_016911	CTT	2	6	1150381	1150386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724583
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29239	NC_016911	ATT	2	6	1150653	1150658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29241	NC_016911	ATT	2	6	1150667	1150672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29242	NC_016911	TAA	2	6	1150682	1150687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29246	NC_016911	ATT	2	6	1150871	1150876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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