MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26003	NC_016911	T	7	7	1022176	1022182	0 %	100 %	0 %	0 %	378724452
26004	NC_016911	TTGT	2	8	1022192	1022199	0 %	75 %	25 %	0 %	378724452
26005	NC_016911	TTG	2	6	1022221	1022226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26006	NC_016911	ATT	2	6	1022293	1022298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26007	NC_016911	A	7	7	1022313	1022319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26008	NC_016911	T	6	6	1022324	1022329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_016911	ACA	2	6	1022390	1022395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26010	NC_016911	CAA	2	6	1022399	1022404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26011	NC_016911	ATTA	2	8	1022433	1022440	50 %	50 %	0 %	0 %	378724453
26012	NC_016911	AGA	2	6	1022454	1022459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724453
26013	NC_016911	T	6	6	1022479	1022484	0 %	100 %	0 %	0 %	378724453
26014	NC_016911	T	7	7	1022536	1022542	0 %	100 %	0 %	0 %	378724453
26015	NC_016911	A	6	6	1022612	1022617	100 %	0 %	0 %	0 %	378724453
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26017	NC_016911	CGA	2	6	1022768	1022773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26018	NC_016911	A	6	6	1022846	1022851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26021	NC_016911	TTTA	2	8	1022897	1022904	25 %	75 %	0 %	0 %	378724454
26022	NC_016911	T	6	6	1022938	1022943	0 %	100 %	0 %	0 %	378724454
26023	NC_016911	CTT	2	6	1022948	1022953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724454
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26025	NC_016911	T	6	6	1022963	1022968	0 %	100 %	0 %	0 %	378724454
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26031	NC_016911	T	6	6	1023311	1023316	0 %	100 %	0 %	0 %	378724454
26032	NC_016911	ATT	2	6	1023331	1023336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26033	NC_016911	TAT	3	9	1023343	1023351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26034	NC_016911	CTTA	2	8	1023365	1023372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26035	NC_016911	ATC	2	6	1023374	1023379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26037	NC_016911	TCTA	2	8	1023397	1023404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26038	NC_016911	TTC	2	6	1023407	1023412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26041	NC_016911	TAA	2	6	1023589	1023594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26044	NC_016911	TAA	2	6	1023682	1023687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_016911	TAT	2	6	1023702	1023707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26047	NC_016911	AT	3	6	1023765	1023770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26048	NC_016911	AAAT	2	8	1023783	1023790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26049	NC_016911	A	7	7	1023819	1023825	100 %	0 %	0 %	0 %	378724455
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26072	NC_016911	CA	3	6	1025069	1025074	50 %	0 %	0 %	50 %	378724456
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26094	NC_016911	TAG	2	6	1025844	1025849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724457
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26103	NC_016911	TGAC	2	8	1026357	1026364	25 %	25 %	25 %	25 %	378724458
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26107	NC_016911	TGC	2	6	1026487	1026492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724458
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26109	NC_016911	T	6	6	1026533	1026538	0 %	100 %	0 %	0 %	378724458
26110	NC_016911	CTTTT	2	10	1026539	1026548	0 %	80 %	0 %	20 %	378724458
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26116	NC_016911	TAGC	2	8	1026689	1026696	25 %	25 %	25 %	25 %	378724458
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26118	NC_016911	GCT	2	6	1026773	1026778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724458
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26242	NC_016911	TAATT	2	10	1032246	1032255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26493	NC_016911	AT	3	6	1041884	1041889	50 %	50 %	0 %	0 %	378724472
26494	NC_016911	CGT	2	6	1041902	1041907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724472
26495	NC_016911	AAT	2	6	1041956	1041961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724472
26496	NC_016911	CCGGTA	2	12	1042081	1042092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378724473
26497	NC_016911	CGAT	2	8	1042109	1042116	25 %	25 %	25 %	25 %	378724473
26498	NC_016911	TAA	2	6	1042129	1042134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724473
26499	NC_016911	TGC	2	6	1042178	1042183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724473
26500	NC_016911	AGA	2	6	1042253	1042258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724473

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