MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_016911	TCGC	2	8	1003305	1003312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25503	NC_016911	GAC	2	6	1003316	1003321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25504	NC_016911	CAA	2	6	1003334	1003339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25505	NC_016911	AAT	2	6	1003379	1003384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25506	NC_016911	AATT	2	8	1003412	1003419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_016911	ATC	2	6	1003429	1003434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25508	NC_016911	TTA	2	6	1003464	1003469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25509	NC_016911	TAC	2	6	1003528	1003533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724442
25510	NC_016911	ATT	2	6	1003611	1003616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724442
25511	NC_016911	TATTT	2	10	1003646	1003655	20 %	80 %	0 %	0 %	378724442
25512	NC_016911	AAT	2	6	1003668	1003673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724442
25513	NC_016911	ATT	2	6	1003685	1003690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724442
25514	NC_016911	ATC	2	6	1003718	1003723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724442
25515	NC_016911	TA	3	6	1003738	1003743	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25516	NC_016911	GTAG	2	8	1003839	1003846	25 %	25 %	50 %	0 %	378724442
25517	NC_016911	ATTT	2	8	1003855	1003862	25 %	75 %	0 %	0 %	378724442
25518	NC_016911	TTTTG	2	10	1003880	1003889	0 %	80 %	20 %	0 %	378724442
25519	NC_016911	TAG	2	6	1003897	1003902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724442
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25521	NC_016911	TAA	2	6	1003952	1003957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724442
25522	NC_016911	A	7	7	1003956	1003962	100 %	0 %	0 %	0 %	378724442
25523	NC_016911	CTT	2	6	1003969	1003974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724442
25524	NC_016911	AT	3	6	1003982	1003987	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25525	NC_016911	TA	3	6	1004012	1004017	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25526	NC_016911	TA	3	6	1004019	1004024	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25527	NC_016911	TA	3	6	1004083	1004088	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25528	NC_016911	A	6	6	1004187	1004192	100 %	0 %	0 %	0 %	378724442
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25530	NC_016911	TA	3	6	1004269	1004274	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25531	NC_016911	TAA	2	6	1004279	1004284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724442
25532	NC_016911	TAT	3	9	1004311	1004319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724442
25533	NC_016911	AT	3	6	1004331	1004336	50 %	50 %	0 %	0 %	378724442
25534	NC_016911	GATT	2	8	1004419	1004426	25 %	50 %	25 %	0 %	378724442
25535	NC_016911	TAG	2	6	1004449	1004454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724442
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25537	NC_016911	CTC	2	6	1004479	1004484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724442
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25540	NC_016911	GTC	2	6	1004605	1004610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25541	NC_016911	TTA	2	6	1004659	1004664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_016911	CA	3	6	1004679	1004684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25543	NC_016911	A	6	6	1004707	1004712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25544	NC_016911	CA	3	6	1004720	1004725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25545	NC_016911	A	6	6	1004751	1004756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25546	NC_016911	GTTT	2	8	1004829	1004836	0 %	75 %	25 %	0 %	378724443
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25556	NC_016911	AGATT	2	10	1005257	1005266	40 %	40 %	20 %	0 %	378724443
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25601	NC_016911	T	7	7	1006764	1006770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25602	NC_016911	TAA	2	6	1006873	1006878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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