MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_016911	ATATCC	2	12	984108	984119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25002	NC_016911	TAA	2	6	984164	984169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_016911	A	6	6	984209	984214	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25004	NC_016911	A	7	7	984235	984241	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25005	NC_016911	GCA	2	6	984245	984250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724428
25006	NC_016911	AGA	2	6	984299	984304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25007	NC_016911	ATG	2	6	984408	984413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724428
25008	NC_016911	ACCG	2	8	984458	984465	25 %	0 %	25 %	50 %	378724428
25009	NC_016911	TTG	2	6	984472	984477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724428
25010	NC_016911	GTA	2	6	984543	984548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724428
25011	NC_016911	GAA	3	9	984555	984563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25012	NC_016911	AGA	2	6	984683	984688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25013	NC_016911	TTA	2	6	984849	984854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
25014	NC_016911	ACT	2	6	984953	984958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724428
25015	NC_016911	TGG	2	6	985038	985043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724428
25016	NC_016911	TAT	2	6	985070	985075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
25017	NC_016911	A	6	6	985080	985085	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25018	NC_016911	AAG	2	6	985135	985140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25019	NC_016911	ATA	2	6	985152	985157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724428
25020	NC_016911	TTA	2	6	985183	985188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
25021	NC_016911	AAG	2	6	985192	985197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25022	NC_016911	CTC	2	6	985237	985242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724428
25023	NC_016911	AGA	2	6	985292	985297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25024	NC_016911	AGGA	2	8	985453	985460	50 %	0 %	50 %	0 %	378724428
25025	NC_016911	AGA	2	6	985532	985537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25026	NC_016911	CAA	2	6	985573	985578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724428
25027	NC_016911	TAA	2	6	985631	985636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724428
25028	NC_016911	ATT	2	6	985652	985657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
25029	NC_016911	CAT	2	6	985760	985765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724428
25030	NC_016911	A	6	6	986016	986021	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25031	NC_016911	A	6	6	986044	986049	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25032	NC_016911	ATGG	2	8	986069	986076	25 %	25 %	50 %	0 %	378724428
25033	NC_016911	TAA	2	6	986078	986083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724428
25034	NC_016911	AGCT	2	8	986101	986108	25 %	25 %	25 %	25 %	378724428
25035	NC_016911	GGT	2	6	986171	986176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724428
25036	NC_016911	ATT	2	6	986188	986193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
25037	NC_016911	AAG	2	6	986210	986215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25038	NC_016911	ATG	2	6	986218	986223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724428
25039	NC_016911	TAG	2	6	986252	986257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724428
25040	NC_016911	GAA	2	6	986328	986333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25041	NC_016911	TA	3	6	986347	986352	50 %	50 %	0 %	0 %	378724428
25042	NC_016911	GCT	2	6	986435	986440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724428
25043	NC_016911	GAA	2	6	986477	986482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724428
25044	NC_016911	TCTA	2	8	986483	986490	25 %	50 %	0 %	25 %	378724428
25045	NC_016911	TAT	2	6	986530	986535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724428
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25047	NC_016911	A	6	6	986558	986563	100 %	0 %	0 %	0 %	378724428
25048	NC_016911	GAT	2	6	986601	986606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724428
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25050	NC_016911	T	7	7	986674	986680	0 %	100 %	0 %	0 %	378724429
25051	NC_016911	TA	3	6	986686	986691	50 %	50 %	0 %	0 %	378724429
25052	NC_016911	TGA	2	6	986724	986729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724429
25053	NC_016911	A	7	7	986736	986742	100 %	0 %	0 %	0 %	378724429
25054	NC_016911	A	6	6	986758	986763	100 %	0 %	0 %	0 %	378724429
25055	NC_016911	AAT	2	6	986815	986820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724429
25056	NC_016911	ATTA	2	8	986821	986828	50 %	50 %	0 %	0 %	378724429
25057	NC_016911	GAT	2	6	986890	986895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724429
25058	NC_016911	TATG	2	8	986910	986917	25 %	50 %	25 %	0 %	378724429
25059	NC_016911	CAA	2	6	986935	986940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724429
25060	NC_016911	AAC	2	6	986957	986962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724429
25061	NC_016911	AG	3	6	986984	986989	50 %	0 %	50 %	0 %	378724429
25062	NC_016911	AT	3	6	986996	987001	50 %	50 %	0 %	0 %	378724429
25063	NC_016911	AACAA	2	10	987041	987050	80 %	0 %	0 %	20 %	378724429
25064	NC_016911	TA	4	8	987054	987061	50 %	50 %	0 %	0 %	378724429
25065	NC_016911	A	7	7	987126	987132	100 %	0 %	0 %	0 %	378724429
25066	NC_016911	GTA	2	6	987143	987148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724429
25067	NC_016911	AAT	2	6	987219	987224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724429
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25069	NC_016911	A	7	7	987271	987277	100 %	0 %	0 %	0 %	378724429
25070	NC_016911	A	6	6	987367	987372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25071	NC_016911	GTT	2	6	987383	987388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_016911	TA	3	6	987390	987395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25073	NC_016911	TCG	2	6	987481	987486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724430
25074	NC_016911	CTA	2	6	987507	987512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724430
25075	NC_016911	TGA	2	6	987542	987547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724430
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25077	NC_016911	A	6	6	987576	987581	100 %	0 %	0 %	0 %	378724430
25078	NC_016911	AAT	2	6	987633	987638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724430
25079	NC_016911	ATTA	2	8	987639	987646	50 %	50 %	0 %	0 %	378724430
25080	NC_016911	CGG	2	6	987656	987661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724430
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25088	NC_016911	GTA	2	6	987961	987966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724430
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25090	NC_016911	T	6	6	988070	988075	0 %	100 %	0 %	0 %	378724430
25091	NC_016911	A	7	7	988089	988095	100 %	0 %	0 %	0 %	378724430
25092	NC_016911	AGA	2	6	988151	988156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724430
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25094	NC_016911	AAACT	2	10	988413	988422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25095	NC_016911	GAA	2	6	988458	988463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25096	NC_016911	ACTT	2	8	988475	988482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25097	NC_016911	GGTT	2	8	988503	988510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25098	NC_016911	TTA	2	6	988519	988524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25099	NC_016911	ACA	2	6	988713	988718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25100	NC_016911	AAT	3	9	988747	988755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25101	NC_016911	AG	3	6	988769	988774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25102	NC_016911	TCT	2	6	988778	988783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25103	NC_016911	TTA	2	6	988831	988836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25104	NC_016911	TTG	2	6	988892	988897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25105	NC_016911	TCT	2	6	988919	988924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25106	NC_016911	AAT	2	6	988928	988933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25107	NC_016911	TCC	2	6	989002	989007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25108	NC_016911	TTA	2	6	989013	989018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25109	NC_016911	TA	3	6	989059	989064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25110	NC_016911	TA	3	6	989128	989133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25111	NC_016911	T	6	6	989158	989163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25112	NC_016911	AT	4	8	989164	989171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25113	NC_016911	TAA	2	6	989193	989198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_016911	TAG	2	6	989304	989309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25115	NC_016911	GT	3	6	989333	989338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25116	NC_016911	TCT	2	6	989360	989365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25117	NC_016911	ATTAGG	2	12	989392	989403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25119	NC_016911	TA	3	6	989502	989507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25120	NC_016911	GTA	2	6	989577	989582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25121	NC_016911	GTT	2	6	989609	989614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25122	NC_016911	TTG	2	6	989661	989666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25123	NC_016911	CA	3	6	989805	989810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25124	NC_016911	CAA	2	6	989848	989853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25126	NC_016911	TAT	2	6	989936	989941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25254	NC_016911	TA	4	8	994595	994602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25255	NC_016911	ATT	2	6	994620	994625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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