MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_016911	AAT	2	6	965481	965486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724408
24503	NC_016911	ATTG	2	8	965495	965502	25 %	50 %	25 %	0 %	378724408
24504	NC_016911	CTA	2	6	965527	965532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724408
24505	NC_016911	TGAT	2	8	965608	965615	25 %	50 %	25 %	0 %	378724408
24506	NC_016911	GAAG	2	8	965670	965677	50 %	0 %	50 %	0 %	378724408
24507	NC_016911	TATAGT	2	12	965681	965692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378724408
24508	NC_016911	AAG	2	6	965728	965733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724408
24509	NC_016911	GAA	2	6	965742	965747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724408
24510	NC_016911	TAT	2	6	965751	965756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724408
24511	NC_016911	AATA	2	8	965813	965820	75 %	25 %	0 %	0 %	378724408
24512	NC_016911	ACT	2	6	965886	965891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724408
24513	NC_016911	AATG	2	8	965901	965908	50 %	25 %	25 %	0 %	378724408
24514	NC_016911	TAC	2	6	965918	965923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724408
24515	NC_016911	CTG	2	6	965934	965939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724408
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24517	NC_016911	AGA	2	6	965958	965963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724408
24518	NC_016911	AT	3	6	965975	965980	50 %	50 %	0 %	0 %	378724408
24519	NC_016911	CAAA	2	8	965985	965992	75 %	0 %	0 %	25 %	378724408
24520	NC_016911	C	6	6	965999	966004	0 %	0 %	0 %	100 %	378724408
24521	NC_016911	AAT	2	6	966024	966029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724408
24522	NC_016911	A	6	6	966034	966039	100 %	0 %	0 %	0 %	378724408
24523	NC_016911	ATTA	2	8	966156	966163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24524	NC_016911	TTA	2	6	966176	966181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24525	NC_016911	AT	3	6	966203	966208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24526	NC_016911	ATA	2	6	966215	966220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724409
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24529	NC_016911	T	6	6	966277	966282	0 %	100 %	0 %	0 %	378724409
24530	NC_016911	TCA	2	6	966341	966346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724409
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24533	NC_016911	TCT	2	6	966446	966451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724409
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24536	NC_016911	ATC	2	6	966575	966580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24537	NC_016911	ATA	2	6	966630	966635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24538	NC_016911	ATT	2	6	966680	966685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24539	NC_016911	TAA	2	6	966706	966711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_016911	A	7	7	966742	966748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24541	NC_016911	ATT	2	6	966785	966790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24542	NC_016911	CTC	2	6	966816	966821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24543	NC_016911	TC	3	6	966837	966842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24544	NC_016911	TCTT	2	8	966847	966854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24545	NC_016911	CTA	2	6	966936	966941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24547	NC_016911	AAT	3	9	966983	966991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24548	NC_016911	AATT	2	8	967031	967038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24549	NC_016911	TTAC	2	8	967050	967057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24550	NC_016911	TAATTT	2	12	967086	967097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24551	NC_016911	ACT	2	6	967146	967151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24552	NC_016911	ATT	2	6	967189	967194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24553	NC_016911	TCA	2	6	967238	967243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24554	NC_016911	TCT	2	6	967267	967272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24555	NC_016911	TTAA	2	8	967300	967307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24556	NC_016911	TAT	2	6	967320	967325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24557	NC_016911	A	6	6	967396	967401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24558	NC_016911	ATTCT	2	10	967454	967463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24559	NC_016911	AT	3	6	967496	967501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24560	NC_016911	TTA	2	6	967507	967512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24563	NC_016911	T	7	7	967567	967573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24564	NC_016911	T	6	6	967598	967603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24565	NC_016911	TAA	2	6	967610	967615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24568	NC_016911	T	6	6	967730	967735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24572	NC_016911	T	7	7	967845	967851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24573	NC_016911	TA	3	6	967864	967869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24574	NC_016911	ATTT	2	8	967976	967983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24575	NC_016911	T	6	6	967981	967986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24576	NC_016911	T	8	8	968132	968139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24581	NC_016911	TTA	2	6	968341	968346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24582	NC_016911	TTTA	2	8	968361	968368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24583	NC_016911	TCA	2	6	968371	968376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24588	NC_016911	AATTT	2	10	968544	968553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24595	NC_016911	TACT	2	8	968964	968971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24600	NC_016911	A	6	6	969181	969186	100 %	0 %	0 %	0 %	378724411
24601	NC_016911	AT	3	6	969194	969199	50 %	50 %	0 %	0 %	378724411
24602	NC_016911	T	6	6	969208	969213	0 %	100 %	0 %	0 %	378724411
24603	NC_016911	ATA	2	6	969223	969228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724412
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24612	NC_016911	CTA	2	6	969494	969499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724412
24613	NC_016911	ATA	2	6	969667	969672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724412
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24615	NC_016911	A	6	6	969741	969746	100 %	0 %	0 %	0 %	378724412
24616	NC_016911	TTGA	2	8	969762	969769	25 %	50 %	25 %	0 %	378724412
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24619	NC_016911	GGT	2	6	969867	969872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724412
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