MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_016911	ACTT	2	8	926692	926699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23502	NC_016911	TTGG	2	8	926756	926763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23503	NC_016911	TTA	2	6	926795	926800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23504	NC_016911	TAT	2	6	926811	926816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23505	NC_016911	GCT	2	6	926866	926871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23506	NC_016911	CCT	2	6	926966	926971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724356
23507	NC_016911	AGG	2	6	927016	927021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378724356
23508	NC_016911	GCA	2	6	927026	927031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724356
23509	NC_016911	ACT	2	6	927128	927133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23510	NC_016911	A	6	6	927221	927226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23511	NC_016911	A	6	6	927229	927234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23512	NC_016911	A	7	7	927263	927269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_016911	T	6	6	927283	927288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23514	NC_016911	ATTTT	2	10	927315	927324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23515	NC_016911	GTA	2	6	927338	927343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23516	NC_016911	AT	3	6	927344	927349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23517	NC_016911	A	6	6	927351	927356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23518	NC_016911	CATA	2	8	927384	927391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23519	NC_016911	AT	3	6	927426	927431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23520	NC_016911	AT	3	6	927457	927462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23521	NC_016911	TTA	2	6	927487	927492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23522	NC_016911	TTTTC	2	10	927533	927542	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23523	NC_016911	TAT	2	6	927571	927576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23524	NC_016911	A	6	6	927587	927592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23525	NC_016911	TAT	2	6	927607	927612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23526	NC_016911	TAAT	2	8	927625	927632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23527	NC_016911	CAG	2	6	927649	927654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23532	NC_016911	AAC	2	6	927804	927809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23533	NC_016911	GCT	2	6	927828	927833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23535	NC_016911	T	9	9	927871	927879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23536	NC_016911	TAA	2	6	927908	927913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23537	NC_016911	GCGA	2	8	927973	927980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23538	NC_016911	AT	3	6	927988	927993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23539	NC_016911	TTG	2	6	928117	928122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23540	NC_016911	ATT	2	6	928136	928141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23541	NC_016911	A	6	6	928251	928256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_016911	TTTA	2	8	928362	928369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23543	NC_016911	TCT	2	6	928388	928393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23544	NC_016911	TCT	2	6	928399	928404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23545	NC_016911	CTT	2	6	928435	928440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23547	NC_016911	CATA	2	8	928496	928503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23548	NC_016911	A	6	6	928614	928619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23549	NC_016911	CTATAA	2	12	928620	928631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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23551	NC_016911	ATT	2	6	928692	928697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23552	NC_016911	ATT	2	6	928736	928741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23553	NC_016911	AT	3	6	928747	928752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23554	NC_016911	TTCA	2	8	928845	928852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23555	NC_016911	TGG	2	6	928887	928892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23558	NC_016911	ATTA	2	8	928972	928979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23559	NC_016911	CAT	2	6	928989	928994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23561	NC_016911	TA	3	6	929012	929017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23563	NC_016911	TTA	2	6	929035	929040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_016911	CTG	2	6	929105	929110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724358
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23567	NC_016911	TTA	2	6	929207	929212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724358
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23593	NC_016911	TAAA	2	8	930265	930272	75 %	25 %	0 %	0 %	378724360
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23623	NC_016911	ATTT	2	8	931665	931672	25 %	75 %	0 %	0 %	378724363
23624	NC_016911	TA	3	6	931728	931733	50 %	50 %	0 %	0 %	378724363
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