MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_016911	AAT	2	6	847393	847398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724276
21503	NC_016911	GAT	2	6	847451	847456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724276
21504	NC_016911	AAAT	2	8	847549	847556	75 %	25 %	0 %	0 %	378724276
21505	NC_016911	ATAG	2	8	847586	847593	50 %	25 %	25 %	0 %	378724276
21506	NC_016911	TTGC	2	8	847622	847629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21507	NC_016911	ATTA	2	8	847703	847710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21508	NC_016911	AAG	2	6	847729	847734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_016911	T	6	6	847741	847746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_016911	A	6	6	847800	847805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21511	NC_016911	CTT	2	6	847820	847825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724277
21512	NC_016911	TAA	2	6	847838	847843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21513	NC_016911	AAG	2	6	847952	847957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724277
21514	NC_016911	ATT	2	6	847961	847966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21515	NC_016911	GTA	2	6	847980	847985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724277
21516	NC_016911	CAT	2	6	848041	848046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724277
21517	NC_016911	AGA	2	6	848109	848114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724277
21518	NC_016911	ATTC	2	8	848144	848151	25 %	50 %	0 %	25 %	378724277
21519	NC_016911	A	6	6	848164	848169	100 %	0 %	0 %	0 %	378724277
21520	NC_016911	GCT	2	6	848187	848192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724277
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21522	NC_016911	TAA	2	6	848242	848247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21523	NC_016911	A	6	6	848310	848315	100 %	0 %	0 %	0 %	378724277
21524	NC_016911	A	7	7	848414	848420	100 %	0 %	0 %	0 %	378724277
21525	NC_016911	TAA	2	6	848464	848469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21526	NC_016911	TA	3	6	848493	848498	50 %	50 %	0 %	0 %	378724277
21527	NC_016911	CTA	2	6	848503	848508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724277
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21529	NC_016911	TG	3	6	848568	848573	0 %	50 %	50 %	0 %	378724277
21530	NC_016911	A	6	6	848627	848632	100 %	0 %	0 %	0 %	378724277
21531	NC_016911	AT	3	6	848757	848762	50 %	50 %	0 %	0 %	378724277
21532	NC_016911	AAT	2	6	848777	848782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21533	NC_016911	CTA	2	6	848797	848802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724277
21534	NC_016911	TAG	2	6	848845	848850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724277
21535	NC_016911	A	8	8	848855	848862	100 %	0 %	0 %	0 %	378724277
21536	NC_016911	AAT	2	6	848868	848873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21537	NC_016911	ATT	3	9	848888	848896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21538	NC_016911	TAT	2	6	848918	848923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21539	NC_016911	ATT	2	6	848940	848945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21540	NC_016911	TAC	2	6	848984	848989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724277
21541	NC_016911	T	6	6	849064	849069	0 %	100 %	0 %	0 %	378724277
21542	NC_016911	AAT	3	9	849116	849124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21543	NC_016911	TAT	2	6	849142	849147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21544	NC_016911	TAT	2	6	849217	849222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21545	NC_016911	TAC	2	6	849230	849235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724277
21546	NC_016911	TAT	2	6	849314	849319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21547	NC_016911	TAA	2	6	849328	849333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
21548	NC_016911	ATT	3	9	849337	849345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724277
21549	NC_016911	GTA	2	6	849394	849399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724277
21550	NC_016911	CGGCA	2	10	849428	849437	20 %	0 %	40 %	40 %	378724277
21551	NC_016911	TATT	2	8	849438	849445	25 %	75 %	0 %	0 %	378724277
21552	NC_016911	ATA	2	6	849463	849468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724277
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21554	NC_016911	TAT	2	6	849519	849524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724278
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21557	NC_016911	ATA	3	9	849658	849666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724278
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21559	NC_016911	AT	3	6	849685	849690	50 %	50 %	0 %	0 %	378724278
21560	NC_016911	TAC	2	6	849717	849722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724278
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21562	NC_016911	TATT	2	8	849759	849766	25 %	75 %	0 %	0 %	378724278
21563	NC_016911	TGAT	2	8	849854	849861	25 %	50 %	25 %	0 %	378724278
21564	NC_016911	ATTT	2	8	849897	849904	25 %	75 %	0 %	0 %	378724278
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21572	NC_016911	TAATT	2	10	850239	850248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21573	NC_016911	AT	3	6	850256	850261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21574	NC_016911	AT	3	6	850266	850271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21575	NC_016911	ATA	2	6	850276	850281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21576	NC_016911	TTAATA	2	12	850296	850307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21578	NC_016911	ATA	2	6	850325	850330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724279
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21590	NC_016911	T	6	6	850733	850738	0 %	100 %	0 %	0 %	378724279
21591	NC_016911	AGC	2	6	850747	850752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724279
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21594	NC_016911	ATG	2	6	850833	850838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724279
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21596	NC_016911	A	8	8	850857	850864	100 %	0 %	0 %	0 %	378724279
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21598	NC_016911	TTAACT	2	12	850918	850929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378724279
21599	NC_016911	A	6	6	850950	850955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_016911	GCTT	2	8	850956	850963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21601	NC_016911	ACGGT	2	10	850966	850975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21602	NC_016911	TCA	2	6	850979	850984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21604	NC_016911	CAA	2	6	851091	851096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21605	NC_016911	AAG	2	6	851231	851236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724280
21606	NC_016911	GAA	2	6	851264	851269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724280
21607	NC_016911	TA	3	6	851342	851347	50 %	50 %	0 %	0 %	378724280
21608	NC_016911	CAT	2	6	851353	851358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724280
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21610	NC_016911	ACCT	2	8	851380	851387	25 %	25 %	0 %	50 %	378724280
21611	NC_016911	TGA	2	6	851472	851477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724280
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21617	NC_016911	GATA	2	8	851662	851669	50 %	25 %	25 %	0 %	378724280
21618	NC_016911	TCA	2	6	851692	851697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724280
21619	NC_016911	CATC	2	8	851698	851705	25 %	25 %	0 %	50 %	378724280
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21621	NC_016911	CTT	2	6	851789	851794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724280
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