MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016911	TTA	2	6	825734	825739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_016911	TTC	2	6	825774	825779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724253
21004	NC_016911	CAA	2	6	825831	825836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724253
21005	NC_016911	GTA	2	6	825937	825942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_016911	A	6	6	825947	825952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_016911	A	6	6	825974	825979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_016911	TCT	2	6	825987	825992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_016911	TCT	2	6	825996	826001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21010	NC_016911	T	7	7	826122	826128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_016911	A	6	6	826139	826144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21012	NC_016911	TAA	2	6	826156	826161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_016911	TAT	2	6	826164	826169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_016911	TTTC	2	8	826215	826222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21015	NC_016911	ATT	3	9	826259	826267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_016911	CTG	2	6	826280	826285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_016911	AAT	2	6	826307	826312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_016911	T	7	7	826328	826334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_016911	GTG	2	6	826420	826425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_016911	ATT	2	6	826497	826502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21023	NC_016911	AAGC	2	8	826895	826902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21024	NC_016911	TAT	2	6	826924	826929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_016911	TCGC	2	8	826957	826964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21026	NC_016911	ATT	2	6	827074	827079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21027	NC_016911	TTA	2	6	827086	827091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724255
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21029	NC_016911	TCA	2	6	827177	827182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724255
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21031	NC_016911	CTG	2	6	827309	827314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724255
21032	NC_016911	CTC	2	6	827339	827344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21035	NC_016911	ATT	2	6	827500	827505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_016911	AGT	2	6	827527	827532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_016911	ACT	3	9	827650	827658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21039	NC_016911	GCTT	2	8	827778	827785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21040	NC_016911	AGC	2	6	827808	827813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21041	NC_016911	ATA	2	6	827840	827845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21042	NC_016911	TTA	2	6	827936	827941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_016911	GAA	2	6	828216	828221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_016911	T	6	6	828278	828283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_016911	TAT	2	6	828340	828345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21046	NC_016911	ATATTT	2	12	828377	828388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724256
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21052	NC_016911	TCT	2	6	828597	828602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724256
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21054	NC_016911	AATA	2	8	828647	828654	75 %	25 %	0 %	0 %	378724256
21055	NC_016911	ATT	2	6	828665	828670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724256
21056	NC_016911	TA	3	6	828775	828780	50 %	50 %	0 %	0 %	378724256
21057	NC_016911	TAA	2	6	828812	828817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724256
21058	NC_016911	AT	3	6	828819	828824	50 %	50 %	0 %	0 %	378724256
21059	NC_016911	CTA	2	6	828849	828854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724256
21060	NC_016911	CTT	3	9	828859	828867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724256
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21062	NC_016911	TCT	2	6	828915	828920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724256
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21065	NC_016911	A	6	6	828967	828972	100 %	0 %	0 %	0 %	378724256
21066	NC_016911	TCT	2	6	829011	829016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724256
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21107	NC_016911	T	6	6	831124	831129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_016911	TTTA	2	8	831153	831160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_016911	AAT	2	6	831165	831170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_016911	T	7	7	831170	831176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21112	NC_016911	AATA	2	8	831203	831210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_016911	TA	3	6	831238	831243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21497	NC_016911	AAT	2	6	847112	847117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724276
21498	NC_016911	TTG	2	6	847200	847205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724276
21499	NC_016911	TCA	2	6	847306	847311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724276
21500	NC_016911	TGA	2	6	847359	847364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724276

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