MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016911	A	6	6	728799	728804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_016911	ATA	2	6	728856	728861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_016911	TAAA	2	8	728895	728902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_016911	T	6	6	728925	728930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_016911	A	7	7	728975	728981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_016911	GCA	2	6	728993	728998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_016911	A	6	6	728998	729003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_016911	AATTA	2	10	729005	729014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_016911	ATTT	2	8	729024	729031	25 %	75 %	0 %	0 %	378724147
18510	NC_016911	CAT	2	6	729047	729052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724147
18511	NC_016911	AGC	2	6	729338	729343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724147
18512	NC_016911	GAT	2	6	729418	729423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724147
18513	NC_016911	AGCAT	2	10	729444	729453	40 %	20 %	20 %	20 %	378724147
18514	NC_016911	ATC	2	6	729455	729460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724147
18515	NC_016911	TTG	2	6	729583	729588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724147
18516	NC_016911	T	6	6	729612	729617	0 %	100 %	0 %	0 %	378724147
18517	NC_016911	T	6	6	729670	729675	0 %	100 %	0 %	0 %	378724147
18518	NC_016911	TTC	2	6	729688	729693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724147
18519	NC_016911	ACAA	2	8	729755	729762	75 %	0 %	0 %	25 %	378724147
18520	NC_016911	CAG	2	6	729793	729798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724147
18521	NC_016911	T	7	7	729862	729868	0 %	100 %	0 %	0 %	378724147
18522	NC_016911	CAAG	2	8	729871	729878	50 %	0 %	25 %	25 %	378724147
18523	NC_016911	ACC	2	6	729911	729916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724147
18524	NC_016911	TAA	2	6	729958	729963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724147
18525	NC_016911	A	6	6	729992	729997	100 %	0 %	0 %	0 %	378724147
18526	NC_016911	GT	3	6	730026	730031	0 %	50 %	50 %	0 %	378724147
18527	NC_016911	CTA	2	6	730089	730094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724148
18528	NC_016911	ATA	2	6	730151	730156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724148
18529	NC_016911	GAT	2	6	730161	730166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724148
18530	NC_016911	CTG	2	6	730188	730193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724148
18531	NC_016911	TAAA	2	8	730225	730232	75 %	25 %	0 %	0 %	378724148
18532	NC_016911	ATT	2	6	730286	730291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724148
18533	NC_016911	T	6	6	730319	730324	0 %	100 %	0 %	0 %	378724148
18534	NC_016911	TAT	2	6	730420	730425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724148
18535	NC_016911	T	6	6	730425	730430	0 %	100 %	0 %	0 %	378724148
18536	NC_016911	AAG	2	6	730461	730466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724148
18537	NC_016911	GAATGA	2	12	730472	730483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378724148
18538	NC_016911	TAT	2	6	730618	730623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724148
18539	NC_016911	ATA	2	6	730628	730633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724148
18540	NC_016911	TAG	2	6	730641	730646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724148
18541	NC_016911	GTA	2	6	730650	730655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724148
18542	NC_016911	TAA	2	6	730708	730713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724148
18543	NC_016911	TCT	2	6	730781	730786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724148
18544	NC_016911	ATT	2	6	730826	730831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724148
18545	NC_016911	AGC	2	6	730885	730890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724148
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18547	NC_016911	A	6	6	730914	730919	100 %	0 %	0 %	0 %	378724148
18548	NC_016911	ATC	2	6	730924	730929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724148
18549	NC_016911	TTG	2	6	731035	731040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724148
18550	NC_016911	TTA	2	6	731042	731047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724148
18551	NC_016911	T	7	7	731055	731061	0 %	100 %	0 %	0 %	378724148
18552	NC_016911	ATA	2	6	731063	731068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724148
18553	NC_016911	A	6	6	731111	731116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_016911	GTT	2	6	731129	731134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_016911	T	6	6	731133	731138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_016911	AGT	2	6	731236	731241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_016911	CCT	2	6	731327	731332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724149
18558	NC_016911	ATT	2	6	731434	731439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724149
18559	NC_016911	TAT	2	6	731464	731469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_016911	TAT	2	6	731497	731502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724150
18561	NC_016911	TG	3	6	731515	731520	0 %	50 %	50 %	0 %	378724150
18562	NC_016911	ATT	2	6	731563	731568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724150
18563	NC_016911	T	6	6	731673	731678	0 %	100 %	0 %	0 %	378724150
18564	NC_016911	CAT	2	6	731687	731692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724150
18565	NC_016911	ATT	2	6	731724	731729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724150
18566	NC_016911	ATTTA	2	10	731739	731748	40 %	60 %	0 %	0 %	378724150
18567	NC_016911	TAA	2	6	731837	731842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724150
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18569	NC_016911	CT	3	6	731925	731930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18570	NC_016911	T	6	6	731959	731964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_016911	CTA	2	6	732019	732024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18572	NC_016911	TAC	2	6	732041	732046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18573	NC_016911	TTGAA	2	10	732048	732057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18574	NC_016911	TAAT	2	8	732070	732077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18575	NC_016911	AGT	2	6	732135	732140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18576	NC_016911	AACT	2	8	732217	732224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18577	NC_016911	AAGATA	2	12	732281	732292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_016911	TAAT	2	8	732335	732342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18579	NC_016911	GCA	2	6	732346	732351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18580	NC_016911	TGGTA	2	10	732362	732371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_016911	AAT	2	6	732372	732377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_016911	TA	3	6	732380	732385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18583	NC_016911	ATT	2	6	732400	732405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_016911	AT	3	6	732421	732426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_016911	AAAT	2	8	732449	732456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_016911	TC	4	8	732562	732569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18587	NC_016911	ATT	2	6	732577	732582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18588	NC_016911	A	6	6	732651	732656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_016911	ATA	2	6	732733	732738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_016911	A	7	7	732765	732771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18591	NC_016911	AAT	2	6	732847	732852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_016911	TTA	2	6	732863	732868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_016911	ATA	2	6	732889	732894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_016911	TA	3	6	732924	732929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_016911	T	6	6	732948	732953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_016911	ATA	2	6	733024	733029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_016911	TA	3	6	733056	733061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_016911	AAT	3	9	733117	733125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_016911	TAA	2	6	733149	733154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_016911	AAT	2	6	733159	733164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_016911	CCGT	2	8	733165	733172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18602	NC_016911	AT	3	6	733173	733178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_016911	A	6	6	733195	733200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_016911	T	6	6	733288	733293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_016911	ATA	3	9	733404	733412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_016911	A	7	7	733418	733424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_016911	AAAC	2	8	733426	733433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18608	NC_016911	A	6	6	733451	733456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18609	NC_016911	T	8	8	733550	733557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_016911	GACAT	2	10	733593	733602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18611	NC_016911	ACA	2	6	733646	733651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18612	NC_016911	ATG	2	6	733696	733701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_016911	TTA	2	6	733716	733721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_016911	TCA	2	6	733737	733742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18615	NC_016911	TCA	2	6	733764	733769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18616	NC_016911	T	7	7	733780	733786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_016911	CTG	2	6	733801	733806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18618	NC_016911	TACC	2	8	733817	733824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18619	NC_016911	TTTA	2	8	733860	733867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_016911	ATT	2	6	733918	733923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724151
18621	NC_016911	AAT	2	6	733928	733933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724151
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18624	NC_016911	TAG	2	6	734013	734018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724151
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