MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_016911	A	7	7	670555	670561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_016911	TCC	2	6	670678	670683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724073
17003	NC_016911	CATA	2	8	670687	670694	50 %	25 %	0 %	25 %	378724073
17004	NC_016911	AGT	2	6	670721	670726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724073
17005	NC_016911	TTA	2	6	670790	670795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724073
17006	NC_016911	GTA	2	6	670814	670819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724073
17007	NC_016911	CTT	2	6	670906	670911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724073
17008	NC_016911	TAC	2	6	670918	670923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724073
17009	NC_016911	GCA	2	6	670925	670930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724073
17010	NC_016911	AT	3	6	670962	670967	50 %	50 %	0 %	0 %	378724073
17011	NC_016911	CGGT	2	8	670990	670997	0 %	25 %	50 %	25 %	378724073
17012	NC_016911	CAA	2	6	671004	671009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724073
17013	NC_016911	TAG	2	6	671013	671018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724073
17014	NC_016911	AAC	2	6	671019	671024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724073
17015	NC_016911	ATTA	2	8	671026	671033	50 %	50 %	0 %	0 %	378724073
17016	NC_016911	CATATG	2	12	671060	671071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378724073
17017	NC_016911	TAT	2	6	671113	671118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724073
17018	NC_016911	ATT	2	6	671173	671178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724073
17019	NC_016911	ATTT	2	8	671254	671261	25 %	75 %	0 %	0 %	378724073
17020	NC_016911	TCA	2	6	671264	671269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724073
17021	NC_016911	ATC	2	6	671313	671318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724073
17022	NC_016911	TAA	2	6	671322	671327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17023	NC_016911	TGC	2	6	671329	671334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724073
17024	NC_016911	TAA	2	6	671349	671354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17025	NC_016911	TTA	2	6	671358	671363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724073
17026	NC_016911	ACAA	2	8	671364	671371	75 %	0 %	0 %	25 %	378724073
17027	NC_016911	TAA	2	6	671380	671385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17028	NC_016911	A	6	6	671436	671441	100 %	0 %	0 %	0 %	378724073
17029	NC_016911	GAA	2	6	671449	671454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724073
17030	NC_016911	AAT	2	6	671507	671512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17031	NC_016911	ATC	2	6	671557	671562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724073
17032	NC_016911	AT	3	6	671564	671569	50 %	50 %	0 %	0 %	378724073
17033	NC_016911	ACTC	2	8	671739	671746	25 %	25 %	0 %	50 %	378724073
17034	NC_016911	GAA	2	6	671747	671752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724073
17035	NC_016911	AGA	2	6	671769	671774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724073
17036	NC_016911	ATA	2	6	671784	671789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17037	NC_016911	TAA	2	6	671802	671807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724073
17038	NC_016911	TTTA	2	8	671817	671824	25 %	75 %	0 %	0 %	378724073
17039	NC_016911	ATG	2	6	671848	671853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724073
17040	NC_016911	GCAA	2	8	671884	671891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17041	NC_016911	AT	3	6	671993	671998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_016911	CAA	2	6	672035	672040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724074
17043	NC_016911	GAAA	2	8	672089	672096	75 %	0 %	25 %	0 %	378724074
17044	NC_016911	ATC	2	6	672133	672138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724074
17045	NC_016911	CAT	2	6	672147	672152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724074
17046	NC_016911	AGA	2	6	672194	672199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724074
17047	NC_016911	A	8	8	672205	672212	100 %	0 %	0 %	0 %	378724074
17048	NC_016911	AGA	2	6	672218	672223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724074
17049	NC_016911	AAT	2	6	672224	672229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724074
17050	NC_016911	TCA	2	6	672237	672242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724074
17051	NC_016911	TAA	2	6	672266	672271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724074
17052	NC_016911	T	7	7	672297	672303	0 %	100 %	0 %	0 %	378724074
17053	NC_016911	TAA	2	6	672362	672367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724074
17054	NC_016911	ATA	2	6	672460	672465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724074
17055	NC_016911	CTT	2	6	672525	672530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724074
17056	NC_016911	TTA	2	6	672554	672559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724074
17057	NC_016911	TTA	2	6	672601	672606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724074
17058	NC_016911	AGA	2	6	672632	672637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724074
17059	NC_016911	TAA	2	6	672643	672648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724074
17060	NC_016911	TA	3	6	672664	672669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_016911	TAT	2	6	672687	672692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_016911	TAA	2	6	672693	672698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_016911	AT	3	6	672743	672748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_016911	A	7	7	672768	672774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_016911	CAA	2	6	672777	672782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_016911	TCT	2	6	672783	672788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17067	NC_016911	CAAA	2	8	672795	672802	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17068	NC_016911	AGCA	2	8	672820	672827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17069	NC_016911	AT	3	6	672845	672850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_016911	GGA	3	9	672861	672869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_016911	AT	3	6	672882	672887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_016911	A	6	6	672908	672913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_016911	TTC	2	6	672949	672954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17074	NC_016911	GAA	2	6	673011	673016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17075	NC_016911	A	7	7	673052	673058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17076	NC_016911	TAAA	2	8	673084	673091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_016911	TTA	2	6	673126	673131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_016911	T	6	6	673148	673153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_016911	GAT	2	6	673182	673187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_016911	TGA	2	6	673196	673201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_016911	AT	3	6	673236	673241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_016911	AACT	2	8	673327	673334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17083	NC_016911	TGCTTC	2	12	673385	673396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_016911	A	6	6	673434	673439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_016911	TA	3	6	673440	673445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_016911	ATA	2	6	673462	673467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17087	NC_016911	ATA	2	6	673525	673530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_016911	GGA	2	6	673532	673537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_016911	A	6	6	673551	673556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17090	NC_016911	TA	4	8	673616	673623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_016911	A	7	7	673628	673634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_016911	AT	3	6	673672	673677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_016911	AGG	2	6	673700	673705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_016911	CTG	2	6	673771	673776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17095	NC_016911	TAC	2	6	673784	673789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17096	NC_016911	ATT	2	6	673834	673839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_016911	AAT	2	6	673878	673883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_016911	AAG	2	6	673897	673902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_016911	CTA	2	6	673932	673937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_016911	ATA	2	6	673958	673963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_016911	ATA	2	6	674024	674029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_016911	AAG	2	6	674042	674047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_016911	ATA	2	6	674066	674071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_016911	TTA	2	6	674083	674088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_016911	ATT	2	6	674152	674157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_016911	TAA	2	6	674172	674177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_016911	CTG	2	6	674234	674239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_016911	TAAAA	2	10	674247	674256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_016911	TAAAAC	2	12	674310	674321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17110	NC_016911	TGA	2	6	674325	674330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_016911	AGG	2	6	674446	674451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_016911	A	7	7	674557	674563	100 %	0 %	0 %	0 %	378724075
17113	NC_016911	TAA	2	6	674753	674758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724075
17114	NC_016911	ATG	2	6	674927	674932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724075
17115	NC_016911	ATTA	2	8	674934	674941	50 %	50 %	0 %	0 %	378724075
17116	NC_016911	CTT	2	6	674965	674970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724075
17117	NC_016911	ATT	2	6	674993	674998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724075
17118	NC_016911	TTA	2	6	675002	675007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724075
17119	NC_016911	ATA	2	6	675041	675046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724075
17120	NC_016911	CTA	3	9	675056	675064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724075
17121	NC_016911	TAA	2	6	675068	675073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724075
17122	NC_016911	ACC	2	6	675084	675089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724075
17123	NC_016911	GAA	2	6	675133	675138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724075
17124	NC_016911	TAT	2	6	675139	675144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724075
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