MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_016911	TAAT	2	8	650072	650079	50 %	50 %	0 %	0 %	378724055
16502	NC_016911	GAA	2	6	650088	650093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724055
16503	NC_016911	CTA	2	6	650121	650126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724055
16504	NC_016911	ATA	2	6	650136	650141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724055
16505	NC_016911	CTTGC	2	10	650181	650190	0 %	40 %	20 %	40 %	378724055
16506	NC_016911	ATCTC	2	10	650266	650275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16507	NC_016911	CGA	2	6	650334	650339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_016911	GCT	2	6	650382	650387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_016911	ACT	2	6	650406	650411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724056
16510	NC_016911	CTTA	2	8	650431	650438	25 %	50 %	0 %	25 %	378724056
16511	NC_016911	ATT	2	6	650461	650466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724056
16512	NC_016911	GCG	3	9	650491	650499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724056
16513	NC_016911	TAA	2	6	650512	650517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724056
16514	NC_016911	ATT	2	6	650569	650574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724056
16515	NC_016911	TGCAC	2	10	650600	650609	20 %	20 %	20 %	40 %	378724056
16516	NC_016911	TAAT	2	8	650646	650653	50 %	50 %	0 %	0 %	378724056
16517	NC_016911	TGT	2	6	650654	650659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724056
16518	NC_016911	GTA	2	6	650669	650674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724056
16519	NC_016911	AT	3	6	650700	650705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_016911	AAG	2	6	650722	650727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724057
16521	NC_016911	TTAAA	2	10	650735	650744	60 %	40 %	0 %	0 %	378724057
16522	NC_016911	GCAA	2	8	650788	650795	50 %	0 %	25 %	25 %	378724057
16523	NC_016911	TGC	2	6	650915	650920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724057
16524	NC_016911	CT	3	6	650943	650948	0 %	50 %	0 %	50 %	378724057
16525	NC_016911	TAAA	2	8	650990	650997	75 %	25 %	0 %	0 %	378724057
16526	NC_016911	GTC	2	6	651057	651062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724057
16527	NC_016911	TCT	2	6	651145	651150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724057
16528	NC_016911	TCT	2	6	651220	651225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724057
16529	NC_016911	TA	3	6	651237	651242	50 %	50 %	0 %	0 %	378724057
16530	NC_016911	TCA	2	6	651289	651294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724057
16531	NC_016911	T	8	8	651348	651355	0 %	100 %	0 %	0 %	378724057
16532	NC_016911	CT	3	6	651357	651362	0 %	50 %	0 %	50 %	378724057
16533	NC_016911	CGG	2	6	651411	651416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724057
16534	NC_016911	CTT	3	9	651461	651469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724057
16535	NC_016911	CGC	2	6	651515	651520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378724057
16536	NC_016911	TTCC	2	8	651623	651630	0 %	50 %	0 %	50 %	378724057
16537	NC_016911	T	8	8	651680	651687	0 %	100 %	0 %	0 %	378724057
16538	NC_016911	AAT	2	6	651743	651748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724057
16539	NC_016911	AT	3	6	651798	651803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_016911	AAT	2	6	651836	651841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16541	NC_016911	TTC	2	6	651869	651874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724058
16542	NC_016911	TCA	2	6	651955	651960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724058
16543	NC_016911	TTA	2	6	651963	651968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724058
16544	NC_016911	TATTT	2	10	651977	651986	20 %	80 %	0 %	0 %	378724058
16545	NC_016911	TAC	2	6	652025	652030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724058
16546	NC_016911	T	6	6	652088	652093	0 %	100 %	0 %	0 %	378724058
16547	NC_016911	TA	3	6	652103	652108	50 %	50 %	0 %	0 %	378724058
16548	NC_016911	TAA	2	6	652121	652126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16549	NC_016911	AT	3	6	652141	652146	50 %	50 %	0 %	0 %	378724058
16550	NC_016911	TTA	2	6	652153	652158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724058
16551	NC_016911	TGC	2	6	652219	652224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724058
16552	NC_016911	TA	3	6	652320	652325	50 %	50 %	0 %	0 %	378724058
16553	NC_016911	T	6	6	652363	652368	0 %	100 %	0 %	0 %	378724058
16554	NC_016911	TAA	2	6	652379	652384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16555	NC_016911	TAC	2	6	652388	652393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724058
16556	NC_016911	AGA	2	6	652397	652402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724058
16557	NC_016911	TATT	2	8	652448	652455	25 %	75 %	0 %	0 %	378724058
16558	NC_016911	TAA	2	6	652505	652510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16559	NC_016911	TTGCA	2	10	652513	652522	20 %	40 %	20 %	20 %	378724058
16560	NC_016911	ACTA	2	8	652556	652563	50 %	25 %	0 %	25 %	378724058
16561	NC_016911	AAT	2	6	652580	652585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16562	NC_016911	A	6	6	652665	652670	100 %	0 %	0 %	0 %	378724058
16563	NC_016911	TAG	2	6	652768	652773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724058
16564	NC_016911	AGC	3	9	652787	652795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724058
16565	NC_016911	TATTT	2	10	652871	652880	20 %	80 %	0 %	0 %	378724058
16566	NC_016911	AGA	2	6	652905	652910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724058
16567	NC_016911	CGG	2	6	652924	652929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724058
16568	NC_016911	TTA	2	6	652954	652959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724058
16569	NC_016911	TAT	2	6	652966	652971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724058
16570	NC_016911	T	6	6	652971	652976	0 %	100 %	0 %	0 %	378724058
16571	NC_016911	TAA	2	6	652982	652987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16572	NC_016911	TAA	2	6	653008	653013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16573	NC_016911	CAA	2	6	653113	653118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724058
16574	NC_016911	AAATAA	2	12	653149	653160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378724058
16575	NC_016911	GCT	2	6	653169	653174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724058
16576	NC_016911	AAT	2	6	653371	653376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724058
16577	NC_016911	TA	3	6	653408	653413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16578	NC_016911	A	6	6	653443	653448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_016911	A	7	7	653487	653493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16580	NC_016911	AAAT	2	8	653496	653503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16581	NC_016911	TTTAA	2	10	653510	653519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_016911	AAC	2	6	653598	653603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16583	NC_016911	TAAT	2	8	653638	653645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_016911	AGA	2	6	653730	653735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724059
16585	NC_016911	TCT	2	6	653833	653838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724059
16586	NC_016911	TC	3	6	653879	653884	0 %	50 %	0 %	50 %	378724059
16587	NC_016911	A	6	6	654014	654019	100 %	0 %	0 %	0 %	378724059
16588	NC_016911	AGA	3	9	654030	654038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724059
16589	NC_016911	AAAAGA	2	12	654039	654050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378724059
16590	NC_016911	T	6	6	654066	654071	0 %	100 %	0 %	0 %	378724059
16591	NC_016911	ATA	2	6	654173	654178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724059
16592	NC_016911	TGG	2	6	654204	654209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724059
16593	NC_016911	AGT	2	6	654264	654269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724059
16594	NC_016911	ATG	2	6	654275	654280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724059
16595	NC_016911	TGA	2	6	654285	654290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724059
16596	NC_016911	AAC	2	6	654309	654314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724059
16597	NC_016911	GAA	2	6	654505	654510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724059
16598	NC_016911	TA	3	6	654595	654600	50 %	50 %	0 %	0 %	378724059
16599	NC_016911	TGG	2	6	654606	654611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724059
16600	NC_016911	ATG	2	6	654655	654660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724059
16601	NC_016911	AGG	2	6	654662	654667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378724059
16602	NC_016911	AGGACA	2	12	654723	654734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378724059
16603	NC_016911	AAC	2	6	654743	654748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724059
16604	NC_016911	TAA	2	6	654752	654757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724059
16605	NC_016911	ACA	2	6	654769	654774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724059
16606	NC_016911	ACC	2	6	654789	654794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724059
16607	NC_016911	ACA	2	6	654804	654809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724059
16608	NC_016911	CTA	2	6	654827	654832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724059
16609	NC_016911	ACCA	2	8	654833	654840	50 %	0 %	0 %	50 %	378724059
16610	NC_016911	TCT	2	6	654891	654896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724059
16611	NC_016911	GCA	2	6	654920	654925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724059
16612	NC_016911	TTA	2	6	654934	654939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724059
16613	NC_016911	CAAC	2	8	654978	654985	50 %	0 %	0 %	50 %	378724059
16614	NC_016911	AGC	2	6	655005	655010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724059
16615	NC_016911	TAA	2	6	655023	655028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724059
16616	NC_016911	AAT	2	6	655090	655095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724059
16617	NC_016911	A	6	6	655152	655157	100 %	0 %	0 %	0 %	378724059
16618	NC_016911	CAG	2	6	655252	655257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724059
16619	NC_016911	GAT	2	6	655297	655302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724059
16620	NC_016911	GCA	2	6	655315	655320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724059
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