MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_016911	AGT	2	6	610056	610061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724020
15503	NC_016911	AGA	2	6	610131	610136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724020
15504	NC_016911	TA	3	6	610140	610145	50 %	50 %	0 %	0 %	378724020
15505	NC_016911	TTAA	2	8	610231	610238	50 %	50 %	0 %	0 %	378724020
15506	NC_016911	CTG	2	6	610241	610246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724020
15507	NC_016911	A	6	6	610253	610258	100 %	0 %	0 %	0 %	378724020
15508	NC_016911	GCG	2	6	610307	610312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724020
15509	NC_016911	CTA	2	6	610340	610345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724020
15510	NC_016911	TTA	2	6	610346	610351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724020
15511	NC_016911	ATA	2	6	610364	610369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724020
15512	NC_016911	TAGAA	2	10	610380	610389	60 %	20 %	20 %	0 %	378724020
15513	NC_016911	ATA	2	6	610454	610459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724020
15514	NC_016911	ATA	2	6	610493	610498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724020
15515	NC_016911	TGGTA	2	10	610536	610545	20 %	40 %	40 %	0 %	378724020
15516	NC_016911	TGCAAA	2	12	610566	610577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378724020
15517	NC_016911	AT	3	6	610659	610664	50 %	50 %	0 %	0 %	378724020
15518	NC_016911	GCCC	2	8	610685	610692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15519	NC_016911	TAA	2	6	610709	610714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_016911	ATT	2	6	610744	610749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_016911	T	6	6	610748	610753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_016911	ATA	2	6	610790	610795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_016911	ATT	2	6	610811	610816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_016911	ATA	2	6	610830	610835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_016911	A	6	6	610851	610856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_016911	TAA	2	6	611037	611042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_016911	AT	3	6	611054	611059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_016911	GATG	2	8	611074	611081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_016911	GAA	2	6	611089	611094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_016911	TAAT	2	8	611114	611121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_016911	AGG	2	6	611145	611150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_016911	AGAA	2	8	611201	611208	75 %	0 %	25 %	0 %	378724021
15533	NC_016911	TTA	3	9	611265	611273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724021
15534	NC_016911	TGA	2	6	611275	611280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724021
15535	NC_016911	ATA	2	6	611292	611297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724021
15536	NC_016911	TAG	2	6	611304	611309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724021
15537	NC_016911	GAT	2	6	611435	611440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724021
15538	NC_016911	A	6	6	611466	611471	100 %	0 %	0 %	0 %	378724021
15539	NC_016911	TA	3	6	611511	611516	50 %	50 %	0 %	0 %	378724021
15540	NC_016911	GAA	2	6	611553	611558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724021
15541	NC_016911	CCT	2	6	611573	611578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724021
15542	NC_016911	TA	3	6	611619	611624	50 %	50 %	0 %	0 %	378724021
15543	NC_016911	GCAAG	2	10	611636	611645	40 %	0 %	40 %	20 %	378724021
15544	NC_016911	GAT	2	6	611678	611683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724021
15545	NC_016911	ATT	2	6	611824	611829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724021
15546	NC_016911	AT	3	6	611839	611844	50 %	50 %	0 %	0 %	378724021
15547	NC_016911	CTG	2	6	611850	611855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724021
15548	NC_016911	TA	3	6	611877	611882	50 %	50 %	0 %	0 %	378724021
15549	NC_016911	ATT	2	6	611936	611941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724021
15550	NC_016911	TAT	2	6	611968	611973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724021
15551	NC_016911	AAG	2	6	611983	611988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724021
15552	NC_016911	TAG	2	6	612043	612048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_016911	AAAT	2	8	612067	612074	75 %	25 %	0 %	0 %	378724022
15554	NC_016911	CATA	2	8	612090	612097	50 %	25 %	0 %	25 %	378724022
15555	NC_016911	TTC	2	6	612125	612130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724022
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15557	NC_016911	ATT	2	6	612208	612213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724022
15558	NC_016911	CCTCA	2	10	612227	612236	20 %	20 %	0 %	60 %	378724022
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15560	NC_016911	GCT	2	6	612268	612273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724022
15561	NC_016911	TAAT	2	8	612302	612309	50 %	50 %	0 %	0 %	378724022
15562	NC_016911	ATA	2	6	612395	612400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724022
15563	NC_016911	TAT	2	6	612408	612413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724022
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15583	NC_016911	AAG	2	6	613161	613166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724022
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15591	NC_016911	GAA	2	6	613579	613584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724022
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15594	NC_016911	A	6	6	613882	613887	100 %	0 %	0 %	0 %	378724022
15595	NC_016911	TGA	2	6	613974	613979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724022
15596	NC_016911	A	6	6	614005	614010	100 %	0 %	0 %	0 %	378724022
15597	NC_016911	TCAT	2	8	614042	614049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15598	NC_016911	ACG	2	6	614104	614109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15600	NC_016911	A	6	6	614191	614196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_016911	AG	3	6	614214	614219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_016911	ACA	2	6	614268	614273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_016911	TAC	2	6	614306	614311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15605	NC_016911	CAAA	2	8	614411	614418	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15606	NC_016911	AAG	2	6	614424	614429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_016911	TTA	2	6	614489	614494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_016911	A	6	6	614520	614525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_016911	AGC	2	6	614576	614581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_016911	AC	3	6	614646	614651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15611	NC_016911	G	6	6	614656	614661	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_016911	TAG	2	6	614719	614724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724023
15613	NC_016911	A	6	6	614752	614757	100 %	0 %	0 %	0 %	378724023
15614	NC_016911	A	6	6	614784	614789	100 %	0 %	0 %	0 %	378724023
15615	NC_016911	GAA	2	6	614825	614830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724023
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15620	NC_016911	AGTA	2	8	614971	614978	50 %	25 %	25 %	0 %	378724023
15621	NC_016911	ATA	2	6	614991	614996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724023
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15623	NC_016911	TAA	2	6	615048	615053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15625	NC_016911	GAT	2	6	615088	615093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724024
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