MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016911	GCT	2	6	590683	590688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723994
15003	NC_016911	TCT	2	6	590704	590709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723994
15004	NC_016911	TCA	2	6	590710	590715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723994
15005	NC_016911	TAA	2	6	590790	590795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723994
15006	NC_016911	TGC	2	6	590838	590843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723994
15007	NC_016911	TTTC	2	8	590882	590889	0 %	75 %	0 %	25 %	378723994
15008	NC_016911	TAA	2	6	590984	590989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723994
15009	NC_016911	T	6	6	590990	590995	0 %	100 %	0 %	0 %	378723994
15010	NC_016911	T	6	6	591002	591007	0 %	100 %	0 %	0 %	378723994
15011	NC_016911	CTC	2	6	591029	591034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723994
15012	NC_016911	ATACT	2	10	591080	591089	40 %	40 %	0 %	20 %	378723994
15013	NC_016911	ATA	2	6	591093	591098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723994
15014	NC_016911	T	6	6	591207	591212	0 %	100 %	0 %	0 %	378723994
15015	NC_016911	CTT	3	9	591215	591223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723994
15016	NC_016911	AAC	2	6	591231	591236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723994
15017	NC_016911	CCG	2	6	591262	591267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723994
15018	NC_016911	ATTTA	2	10	591303	591312	40 %	60 %	0 %	0 %	378723994
15019	NC_016911	AAC	2	6	591345	591350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723994
15020	NC_016911	AAT	2	6	591424	591429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_016911	TTA	2	6	591430	591435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_016911	TTA	2	6	591509	591514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_016911	AAT	2	6	591538	591543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_016911	AT	3	6	591575	591580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_016911	AT	3	6	591594	591599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_016911	ATTA	2	8	591639	591646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_016911	ATTT	2	8	591674	591681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016911	ATG	2	6	591716	591721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_016911	TTA	2	6	591733	591738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_016911	ATGTT	2	10	591742	591751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_016911	GCT	2	6	591766	591771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_016911	TCA	2	6	591784	591789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_016911	TTTACC	2	12	591898	591909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378723995
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15035	NC_016911	T	7	7	591928	591934	0 %	100 %	0 %	0 %	378723995
15036	NC_016911	T	8	8	591959	591966	0 %	100 %	0 %	0 %	378723995
15037	NC_016911	TA	3	6	592015	592020	50 %	50 %	0 %	0 %	378723995
15038	NC_016911	TAC	2	6	592054	592059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723995
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15040	NC_016911	TA	3	6	592113	592118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_016911	TAT	2	6	592129	592134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_016911	TAA	2	6	592195	592200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_016911	TGA	2	6	592203	592208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_016911	AAT	2	6	592231	592236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_016911	AGC	2	6	592251	592256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_016911	T	8	8	592268	592275	0 %	100 %	0 %	0 %	378723996
15047	NC_016911	AAAC	2	8	592321	592328	75 %	0 %	0 %	25 %	378723996
15048	NC_016911	ATG	2	6	592342	592347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723996
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15053	NC_016911	ACTATA	2	12	592612	592623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378723997
15054	NC_016911	ACTT	2	8	592704	592711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_016911	A	6	6	592761	592766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_016911	A	6	6	592771	592776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_016911	ATT	2	6	592784	592789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_016911	TCT	2	6	592853	592858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723998
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15060	NC_016911	TGCTT	2	10	593087	593096	0 %	60 %	20 %	20 %	378723998
15061	NC_016911	CTGC	2	8	593124	593131	0 %	25 %	25 %	50 %	378723998
15062	NC_016911	TAAA	2	8	593163	593170	75 %	25 %	0 %	0 %	378723998
15063	NC_016911	CAA	2	6	593187	593192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723998
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15072	NC_016911	CAT	2	6	593703	593708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723998
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15091	NC_016911	TAT	3	9	594597	594605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723998
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15097	NC_016911	GACAT	2	10	594945	594954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15099	NC_016911	CTT	2	6	595011	595016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723999
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15104	NC_016911	T	6	6	595191	595196	0 %	100 %	0 %	0 %	378723999
15105	NC_016911	TTC	2	6	595201	595206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723999
15106	NC_016911	TATC	2	8	595218	595225	25 %	50 %	0 %	25 %	378723999
15107	NC_016911	T	6	6	595249	595254	0 %	100 %	0 %	0 %	378723999
15108	NC_016911	AGC	2	6	595258	595263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723999
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15111	NC_016911	TAT	2	6	595371	595376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723999
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15113	NC_016911	T	7	7	595427	595433	0 %	100 %	0 %	0 %	378723999
15114	NC_016911	CTT	2	6	595434	595439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723999
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15119	NC_016911	TAT	2	6	595594	595599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723999
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15122	NC_016911	TTA	2	6	595625	595630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_016911	ATT	2	6	595635	595640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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