MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016911	T	6	6	531288	531293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_016911	AAT	2	6	531363	531368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_016911	TATT	2	8	531373	531380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_016911	TTA	2	6	531400	531405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723933
13505	NC_016911	A	7	7	531453	531459	100 %	0 %	0 %	0 %	378723933
13506	NC_016911	CCT	2	6	531481	531486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723933
13507	NC_016911	CTT	2	6	531566	531571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723933
13508	NC_016911	A	6	6	531637	531642	100 %	0 %	0 %	0 %	378723933
13509	NC_016911	ATTA	2	8	531735	531742	50 %	50 %	0 %	0 %	378723933
13510	NC_016911	ATG	2	6	531755	531760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723933
13511	NC_016911	CTG	2	6	531761	531766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723933
13512	NC_016911	AATG	2	8	531816	531823	50 %	25 %	25 %	0 %	378723933
13513	NC_016911	GAA	2	6	531846	531851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723933
13514	NC_016911	GCA	2	6	531891	531896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723933
13515	NC_016911	AG	3	6	531938	531943	50 %	0 %	50 %	0 %	378723933
13516	NC_016911	GTA	2	6	532000	532005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723933
13517	NC_016911	ATA	2	6	532013	532018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723933
13518	NC_016911	ACT	2	6	532093	532098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723933
13519	NC_016911	ATTG	2	8	532119	532126	25 %	50 %	25 %	0 %	378723933
13520	NC_016911	GTT	2	6	532129	532134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723933
13521	NC_016911	GAT	2	6	532170	532175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723933
13522	NC_016911	TAA	3	9	532242	532250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723933
13523	NC_016911	CTA	2	6	532253	532258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723933
13524	NC_016911	ATA	2	6	532276	532281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723933
13525	NC_016911	TTAC	2	8	532388	532395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13526	NC_016911	CAA	2	6	532433	532438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_016911	CA	3	6	532467	532472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13528	NC_016911	TTG	2	6	532544	532549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723934
13529	NC_016911	TTA	2	6	532559	532564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13530	NC_016911	T	6	6	532573	532578	0 %	100 %	0 %	0 %	378723934
13531	NC_016911	T	7	7	532609	532615	0 %	100 %	0 %	0 %	378723934
13532	NC_016911	T	6	6	532625	532630	0 %	100 %	0 %	0 %	378723934
13533	NC_016911	TAT	2	6	532729	532734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13534	NC_016911	TAT	2	6	532785	532790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13535	NC_016911	TTG	2	6	532796	532801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723934
13536	NC_016911	GCA	2	6	532841	532846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723934
13537	NC_016911	TAA	2	6	532849	532854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723934
13538	NC_016911	T	7	7	532884	532890	0 %	100 %	0 %	0 %	378723934
13539	NC_016911	ATC	2	6	533038	533043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723934
13540	NC_016911	CAAAA	2	10	533115	533124	80 %	0 %	0 %	20 %	378723934
13541	NC_016911	A	6	6	533121	533126	100 %	0 %	0 %	0 %	378723934
13542	NC_016911	TAA	2	6	533137	533142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723934
13543	NC_016911	CAC	2	6	533259	533264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723934
13544	NC_016911	TGC	2	6	533341	533346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723934
13545	NC_016911	TTA	2	6	533381	533386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13546	NC_016911	TTC	2	6	533423	533428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723934
13547	NC_016911	TAT	2	6	533431	533436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13548	NC_016911	ATT	2	6	533438	533443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723934
13549	NC_016911	ATT	2	6	533460	533465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723935
13550	NC_016911	AC	3	6	533474	533479	50 %	0 %	0 %	50 %	378723935
13551	NC_016911	AAGC	2	8	533515	533522	50 %	0 %	25 %	25 %	378723935
13552	NC_016911	CTT	2	6	533533	533538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723935
13553	NC_016911	AAAT	2	8	533555	533562	75 %	25 %	0 %	0 %	378723935
13554	NC_016911	TG	3	6	533640	533645	0 %	50 %	50 %	0 %	378723935
13555	NC_016911	TTTA	2	8	533696	533703	25 %	75 %	0 %	0 %	378723935
13556	NC_016911	TAA	2	6	533716	533721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723935
13557	NC_016911	CTT	2	6	533722	533727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723935
13558	NC_016911	T	6	6	533734	533739	0 %	100 %	0 %	0 %	378723935
13559	NC_016911	TAA	2	6	533798	533803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723935
13560	NC_016911	ATT	2	6	533855	533860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723935
13561	NC_016911	T	6	6	533859	533864	0 %	100 %	0 %	0 %	378723935
13562	NC_016911	CAT	2	6	533899	533904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723935
13563	NC_016911	CAA	2	6	533938	533943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723935
13564	NC_016911	TGC	2	6	533957	533962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723935
13565	NC_016911	AAAG	2	8	533997	534004	75 %	0 %	25 %	0 %	378723935
13566	NC_016911	TGTT	2	8	534087	534094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_016911	TAT	2	6	534095	534100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_016911	TACTAG	2	12	534197	534208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13569	NC_016911	TTGT	2	8	534218	534225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_016911	C	6	6	534231	534236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13571	NC_016911	GTC	2	6	534237	534242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13572	NC_016911	CAA	2	6	534281	534286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_016911	TAT	2	6	534325	534330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_016911	ATATC	2	10	534331	534340	40 %	40 %	0 %	20 %	378723936
13575	NC_016911	TAA	2	6	534364	534369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723936
13576	NC_016911	AAAT	2	8	534387	534394	75 %	25 %	0 %	0 %	378723936
13577	NC_016911	ACT	2	6	534464	534469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723936
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13579	NC_016911	A	6	6	534494	534499	100 %	0 %	0 %	0 %	378723936
13580	NC_016911	TCT	2	6	534533	534538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723936
13581	NC_016911	CT	3	6	534554	534559	0 %	50 %	0 %	50 %	378723936
13582	NC_016911	T	6	6	534581	534586	0 %	100 %	0 %	0 %	378723936
13583	NC_016911	ATT	2	6	534608	534613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723936
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13585	NC_016911	TA	3	6	534649	534654	50 %	50 %	0 %	0 %	378723936
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13589	NC_016911	TAACA	2	10	534744	534753	60 %	20 %	0 %	20 %	378723936
13590	NC_016911	TAA	2	6	534777	534782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723936
13591	NC_016911	A	7	7	534819	534825	100 %	0 %	0 %	0 %	378723936
13592	NC_016911	A	6	6	534832	534837	100 %	0 %	0 %	0 %	378723936
13593	NC_016911	ATTTA	2	10	534877	534886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_016911	AATT	2	8	534904	534911	50 %	50 %	0 %	0 %	378723937
13595	NC_016911	T	7	7	534919	534925	0 %	100 %	0 %	0 %	378723937
13596	NC_016911	TAG	2	6	534992	534997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723937
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13599	NC_016911	TGC	2	6	535164	535169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723937
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13601	NC_016911	AT	3	6	535216	535221	50 %	50 %	0 %	0 %	378723937
13602	NC_016911	AT	3	6	535251	535256	50 %	50 %	0 %	0 %	378723937
13603	NC_016911	AAG	2	6	535270	535275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723937
13604	NC_016911	TAT	2	6	535290	535295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723937
13605	NC_016911	TA	3	6	535346	535351	50 %	50 %	0 %	0 %	378723937
13606	NC_016911	ATA	2	6	535357	535362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723937
13607	NC_016911	TAG	2	6	535385	535390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723937
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13612	NC_016911	A	6	6	535596	535601	100 %	0 %	0 %	0 %	378723937
13613	NC_016911	TAC	2	6	535620	535625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723937
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13615	NC_016911	TTTGT	2	10	535670	535679	0 %	80 %	20 %	0 %	378723937
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13621	NC_016911	TGA	2	6	535801	535806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723938
13622	NC_016911	A	6	6	535815	535820	100 %	0 %	0 %	0 %	378723938
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13995	NC_016911	AAT	2	6	549566	549571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723950
13996	NC_016911	ATA	2	6	549572	549577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723950
13997	NC_016911	ACC	2	6	549619	549624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723950
13998	NC_016911	ATC	2	6	549677	549682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723950
13999	NC_016911	AT	3	6	549697	549702	50 %	50 %	0 %	0 %	378723950
14000	NC_016911	CAA	2	6	549759	549764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723950

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