MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016911	TTC	2	6	510867	510872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_016911	AGA	3	9	510900	510908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_016911	TGT	2	6	510946	510951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_016911	TGAA	2	8	511007	511014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016911	GTA	2	6	511135	511140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723911
13006	NC_016911	ATTT	2	8	511174	511181	25 %	75 %	0 %	0 %	378723911
13007	NC_016911	ATA	2	6	511195	511200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723911
13008	NC_016911	TTGTTA	2	12	511209	511220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378723911
13009	NC_016911	CCT	2	6	511246	511251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723911
13010	NC_016911	TAT	2	6	511267	511272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723911
13011	NC_016911	AAC	2	6	511276	511281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723911
13012	NC_016911	ATT	2	6	511311	511316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016911	TA	3	6	511345	511350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_016911	CTT	2	6	511403	511408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_016911	T	6	6	511411	511416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016911	AAAT	2	8	511425	511432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_016911	CTT	2	6	511483	511488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_016911	CAT	2	6	511559	511564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_016911	TTTCA	2	10	511572	511581	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13020	NC_016911	T	6	6	511607	511612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_016911	TC	3	6	511617	511622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_016911	TGT	2	6	511652	511657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_016911	A	6	6	511663	511668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016911	TGA	2	6	511751	511756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016911	ATT	2	6	511765	511770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016911	TTA	2	6	511799	511804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_016911	TTC	2	6	511807	511812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_016911	ATT	2	6	511813	511818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016911	ATT	2	6	511862	511867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016911	TCT	2	6	511868	511873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_016911	TTG	2	6	511894	511899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016911	GT	3	6	511903	511908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016911	T	6	6	511922	511927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016911	T	6	6	511941	511946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_016911	AAC	2	6	511986	511991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_016911	TTC	2	6	511992	511997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_016911	T	6	6	512188	512193	0 %	100 %	0 %	0 %	378723912
13038	NC_016911	AAAT	2	8	512194	512201	75 %	25 %	0 %	0 %	378723912
13039	NC_016911	TTG	3	9	512253	512261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723912
13040	NC_016911	TTA	2	6	512300	512305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723912
13041	NC_016911	ATT	2	6	512361	512366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723912
13042	NC_016911	T	6	6	512377	512382	0 %	100 %	0 %	0 %	378723912
13043	NC_016911	TAAA	2	8	512385	512392	75 %	25 %	0 %	0 %	378723912
13044	NC_016911	TTA	2	6	512399	512404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723912
13045	NC_016911	ATTC	2	8	512414	512421	25 %	50 %	0 %	25 %	378723912
13046	NC_016911	TAA	2	6	512446	512451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_016911	TAA	2	6	512496	512501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_016911	AAT	2	6	512546	512551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_016911	ATTT	2	8	512563	512570	25 %	75 %	0 %	0 %	378723913
13050	NC_016911	T	6	6	512586	512591	0 %	100 %	0 %	0 %	378723913
13051	NC_016911	CTT	2	6	512666	512671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723913
13052	NC_016911	ATA	2	6	512680	512685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723913
13053	NC_016911	ATA	2	6	512808	512813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723913
13054	NC_016911	CAA	2	6	512837	512842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723913
13055	NC_016911	CCG	3	9	512848	512856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723913
13056	NC_016911	ATT	2	6	512872	512877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723913
13057	NC_016911	T	6	6	512876	512881	0 %	100 %	0 %	0 %	378723913
13058	NC_016911	CCG	2	6	512983	512988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723913
13059	NC_016911	TGA	2	6	513054	513059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723913
13060	NC_016911	CTTT	2	8	513106	513113	0 %	75 %	0 %	25 %	378723913
13061	NC_016911	T	6	6	513180	513185	0 %	100 %	0 %	0 %	378723913
13062	NC_016911	TGC	2	6	513192	513197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723913
13063	NC_016911	ATA	2	6	513208	513213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723913
13064	NC_016911	TAA	2	6	513275	513280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723913
13065	NC_016911	ACC	2	6	513459	513464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723913
13066	NC_016911	TGT	2	6	513499	513504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723913
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13068	NC_016911	AT	3	6	513639	513644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016911	TAA	2	6	513687	513692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_016911	A	8	8	513700	513707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_016911	TAA	2	6	513732	513737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_016911	A	6	6	514011	514016	100 %	0 %	0 %	0 %	378723914
13073	NC_016911	TAG	2	6	514047	514052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723914
13074	NC_016911	ATT	2	6	514061	514066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_016911	TAA	2	6	514161	514166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723915
13076	NC_016911	A	6	6	514176	514181	100 %	0 %	0 %	0 %	378723915
13077	NC_016911	AG	3	6	514183	514188	50 %	0 %	50 %	0 %	378723915
13078	NC_016911	AT	3	6	514193	514198	50 %	50 %	0 %	0 %	378723915
13079	NC_016911	AAG	2	6	514206	514211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723915
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13081	NC_016911	A	6	6	514252	514257	100 %	0 %	0 %	0 %	378723915
13082	NC_016911	TAG	2	6	514279	514284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723915
13083	NC_016911	ATA	2	6	514301	514306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723915
13084	NC_016911	TTA	2	6	514356	514361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016911	ATT	2	6	514388	514393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723916
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13087	NC_016911	AGT	2	6	514488	514493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723916
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13089	NC_016911	T	7	7	514617	514623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_016911	T	7	7	514631	514637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_016911	AATA	2	8	514638	514645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_016911	TTG	2	6	514697	514702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016911	ATT	3	9	514767	514775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016911	CAA	2	6	514842	514847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016911	GCAA	2	8	514931	514938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13096	NC_016911	ATC	2	6	514974	514979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723917
13097	NC_016911	TTA	2	6	514980	514985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723917
13098	NC_016911	ATA	2	6	515020	515025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13099	NC_016911	ATA	2	6	515034	515039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13100	NC_016911	TATG	2	8	515071	515078	25 %	50 %	25 %	0 %	378723917
13101	NC_016911	TGAAT	2	10	515104	515113	40 %	40 %	20 %	0 %	378723917
13102	NC_016911	AT	3	6	515199	515204	50 %	50 %	0 %	0 %	378723917
13103	NC_016911	CCG	2	6	515268	515273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723917
13104	NC_016911	TGAA	2	8	515350	515357	50 %	25 %	25 %	0 %	378723917
13105	NC_016911	CAT	2	6	515381	515386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723917
13106	NC_016911	ACT	2	6	515435	515440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723917
13107	NC_016911	ACTA	2	8	515453	515460	50 %	25 %	0 %	25 %	378723917
13108	NC_016911	A	7	7	515479	515485	100 %	0 %	0 %	0 %	378723917
13109	NC_016911	AAG	2	6	515594	515599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723917
13110	NC_016911	ATT	2	6	515631	515636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723917
13111	NC_016911	AT	3	6	515665	515670	50 %	50 %	0 %	0 %	378723917
13112	NC_016911	TAA	2	6	515776	515781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13113	NC_016911	TAA	2	6	515831	515836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13114	NC_016911	ATAA	2	8	515858	515865	75 %	25 %	0 %	0 %	378723917
13115	NC_016911	A	6	6	515909	515914	100 %	0 %	0 %	0 %	378723917
13116	NC_016911	CTT	2	6	515932	515937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723917
13117	NC_016911	ATA	2	6	516009	516014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13118	NC_016911	ATA	2	6	516019	516024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723917
13119	NC_016911	ATT	2	6	516045	516050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723917
13120	NC_016911	GAA	2	6	516070	516075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723917
13121	NC_016911	TTAA	2	8	516090	516097	50 %	50 %	0 %	0 %	378723917
13122	NC_016911	TCGGGA	2	12	516099	516110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378723917
13123	NC_016911	A	6	6	516113	516118	100 %	0 %	0 %	0 %	378723917
13124	NC_016911	AAATA	2	10	516131	516140	80 %	20 %	0 %	0 %	378723917
13125	NC_016911	GAA	2	6	516155	516160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723917
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13127	NC_016911	TGT	2	6	516200	516205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723917
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