MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016911	TA	4	8	452214	452221	50 %	50 %	0 %	0 %	378723846
11503	NC_016911	CTC	2	6	452246	452251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723846
11504	NC_016911	GTA	2	6	452276	452281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723846
11505	NC_016911	CTA	2	6	452327	452332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723846
11506	NC_016911	ACG	2	6	452367	452372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723846
11507	NC_016911	AGA	3	9	452395	452403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723846
11508	NC_016911	GAAA	2	8	452413	452420	75 %	0 %	25 %	0 %	378723846
11509	NC_016911	AGT	2	6	452431	452436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723846
11510	NC_016911	TAAG	2	8	452440	452447	50 %	25 %	25 %	0 %	378723846
11511	NC_016911	ATA	2	6	452522	452527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723846
11512	NC_016911	T	7	7	452585	452591	0 %	100 %	0 %	0 %	378723846
11513	NC_016911	TAT	2	6	452622	452627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723846
11514	NC_016911	T	6	6	452651	452656	0 %	100 %	0 %	0 %	378723846
11515	NC_016911	TAA	2	6	452676	452681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723846
11516	NC_016911	TAT	2	6	452682	452687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723846
11517	NC_016911	TAAG	2	8	452697	452704	50 %	25 %	25 %	0 %	378723846
11518	NC_016911	ATA	2	6	452715	452720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723846
11519	NC_016911	CGG	2	6	452748	452753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723846
11520	NC_016911	A	6	6	452790	452795	100 %	0 %	0 %	0 %	378723846
11521	NC_016911	ATT	2	6	452804	452809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723846
11522	NC_016911	A	8	8	452853	452860	100 %	0 %	0 %	0 %	378723846
11523	NC_016911	TAG	2	6	452877	452882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723846
11524	NC_016911	GATT	2	8	452883	452890	25 %	50 %	25 %	0 %	378723846
11525	NC_016911	GAA	2	6	452893	452898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723846
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11527	NC_016911	TAAA	2	8	452931	452938	75 %	25 %	0 %	0 %	378723846
11528	NC_016911	AAAAG	2	10	452995	453004	80 %	0 %	20 %	0 %	378723846
11529	NC_016911	TTG	2	6	453054	453059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723846
11530	NC_016911	TAA	2	6	453065	453070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723846
11531	NC_016911	AATA	2	8	453111	453118	75 %	25 %	0 %	0 %	378723846
11532	NC_016911	TAATT	2	10	453136	453145	40 %	60 %	0 %	0 %	378723846
11533	NC_016911	ATAA	2	8	453182	453189	75 %	25 %	0 %	0 %	378723846
11534	NC_016911	TAAT	2	8	453190	453197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016911	A	6	6	453227	453232	100 %	0 %	0 %	0 %	378723847
11536	NC_016911	A	6	6	453297	453302	100 %	0 %	0 %	0 %	378723847
11537	NC_016911	TTA	2	6	453382	453387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723847
11538	NC_016911	ATC	2	6	453402	453407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723847
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11540	NC_016911	TGA	2	6	453487	453492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723847
11541	NC_016911	TA	3	6	453530	453535	50 %	50 %	0 %	0 %	378723847
11542	NC_016911	AAT	2	6	453570	453575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723847
11543	NC_016911	GAAAA	2	10	453596	453605	80 %	0 %	20 %	0 %	378723847
11544	NC_016911	TAA	3	9	453611	453619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723847
11545	NC_016911	GAT	2	6	453621	453626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723847
11546	NC_016911	GCT	2	6	453633	453638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723847
11547	NC_016911	A	6	6	453671	453676	100 %	0 %	0 %	0 %	378723847
11548	NC_016911	GAG	2	6	453697	453702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016911	TTG	2	6	453703	453708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_016911	CAA	2	6	453880	453885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_016911	CCT	2	6	453902	453907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11552	NC_016911	AAT	2	6	454007	454012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723848
11553	NC_016911	CAT	2	6	454022	454027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723848
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11555	NC_016911	AGA	2	6	454148	454153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723849
11556	NC_016911	AT	3	6	454232	454237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_016911	ATAA	2	8	454266	454273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_016911	AGT	2	6	454342	454347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723850
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11560	NC_016911	AAT	2	6	454381	454386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723850
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11562	NC_016911	AAATGT	2	12	454434	454445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378723850
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11565	NC_016911	TAA	2	6	454499	454504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723850
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11567	NC_016911	GCTA	2	8	454587	454594	25 %	25 %	25 %	25 %	378723850
11568	NC_016911	TG	3	6	454642	454647	0 %	50 %	50 %	0 %	378723850
11569	NC_016911	A	7	7	454656	454662	100 %	0 %	0 %	0 %	378723850
11570	NC_016911	TATT	2	8	454854	454861	25 %	75 %	0 %	0 %	378723850
11571	NC_016911	AAT	2	6	454890	454895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723850
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11580	NC_016911	T	6	6	455211	455216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_016911	GAAT	2	8	455285	455292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_016911	TA	4	8	455311	455318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11589	NC_016911	AATA	2	8	455618	455625	75 %	25 %	0 %	0 %	378723851
11590	NC_016911	TGC	2	6	455657	455662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723851
11591	NC_016911	TAA	2	6	455666	455671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723851
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11593	NC_016911	ATCA	2	8	455865	455872	50 %	25 %	0 %	25 %	378723851
11594	NC_016911	T	6	6	455921	455926	0 %	100 %	0 %	0 %	378723851
11595	NC_016911	AT	3	6	456049	456054	50 %	50 %	0 %	0 %	378723851
11596	NC_016911	ATC	2	6	456122	456127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723851
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11598	NC_016911	TGA	2	6	456146	456151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723851
11599	NC_016911	ATT	2	6	456160	456165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723851
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11602	NC_016911	ATA	2	6	456259	456264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723851
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11604	NC_016911	TTA	2	6	456297	456302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723851
11605	NC_016911	A	6	6	456332	456337	100 %	0 %	0 %	0 %	378723851
11606	NC_016911	TTG	2	6	456356	456361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723852
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11608	NC_016911	TGC	2	6	456388	456393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723852
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11611	NC_016911	GAT	2	6	456481	456486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723852
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11617	NC_016911	TTTTA	2	10	456605	456614	20 %	80 %	0 %	0 %	378723852
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