MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016911	CTA	2	6	413802	413807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723801
10503	NC_016911	CGG	2	6	413841	413846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723801
10504	NC_016911	TGAA	2	8	413859	413866	50 %	25 %	25 %	0 %	378723801
10505	NC_016911	GAA	2	6	413926	413931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723801
10506	NC_016911	TGT	2	6	413939	413944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723801
10507	NC_016911	TCG	2	6	414051	414056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723801
10508	NC_016911	TG	3	6	414089	414094	0 %	50 %	50 %	0 %	378723801
10509	NC_016911	TAA	2	6	414100	414105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723801
10510	NC_016911	AG	3	6	414140	414145	50 %	0 %	50 %	0 %	378723801
10511	NC_016911	TACG	2	8	414176	414183	25 %	25 %	25 %	25 %	378723801
10512	NC_016911	TACA	2	8	414213	414220	50 %	25 %	0 %	25 %	378723801
10513	NC_016911	T	6	6	414250	414255	0 %	100 %	0 %	0 %	378723801
10514	NC_016911	AGG	2	6	414301	414306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723801
10515	NC_016911	TAA	2	6	414417	414422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723801
10516	NC_016911	TAG	2	6	414439	414444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723801
10517	NC_016911	ATT	2	6	414458	414463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723801
10518	NC_016911	CGT	2	6	414524	414529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723801
10519	NC_016911	GTA	2	6	414563	414568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723801
10520	NC_016911	CCG	2	6	414719	414724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723801
10521	NC_016911	TGA	2	6	414751	414756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723801
10522	NC_016911	TTAT	2	8	414816	414823	25 %	75 %	0 %	0 %	378723801
10523	NC_016911	GGC	2	6	414842	414847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723801
10524	NC_016911	GGAT	2	8	414848	414855	25 %	25 %	50 %	0 %	378723801
10525	NC_016911	AG	3	6	414860	414865	50 %	0 %	50 %	0 %	378723801
10526	NC_016911	GAG	2	6	414887	414892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723802
10527	NC_016911	TCGC	2	8	414947	414954	0 %	25 %	25 %	50 %	378723802
10528	NC_016911	GA	3	6	414958	414963	50 %	0 %	50 %	0 %	378723802
10529	NC_016911	A	6	6	414972	414977	100 %	0 %	0 %	0 %	378723802
10530	NC_016911	T	6	6	415009	415014	0 %	100 %	0 %	0 %	378723802
10531	NC_016911	GAA	2	6	415018	415023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723802
10532	NC_016911	GAT	2	6	415114	415119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10533	NC_016911	TCG	2	6	415134	415139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10534	NC_016911	TGC	2	6	415153	415158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10535	NC_016911	TGC	2	6	415243	415248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10536	NC_016911	GAT	2	6	415315	415320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10537	NC_016911	TGC	2	6	415351	415356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10538	NC_016911	TAG	2	6	415362	415367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10539	NC_016911	AGC	2	6	415402	415407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10540	NC_016911	ACT	2	6	415436	415441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723803
10541	NC_016911	CGG	2	6	415453	415458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723803
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10543	NC_016911	ATTT	2	8	415501	415508	25 %	75 %	0 %	0 %	378723803
10544	NC_016911	GCT	2	6	415592	415597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723803
10545	NC_016911	CTA	2	6	415614	415619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723803
10546	NC_016911	TAG	2	6	415659	415664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10547	NC_016911	GAG	2	6	415721	415726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723803
10548	NC_016911	TAT	2	6	415759	415764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723803
10549	NC_016911	ACT	2	6	415781	415786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723803
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10552	NC_016911	TTG	2	6	415905	415910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723803
10553	NC_016911	ATG	2	6	415931	415936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10554	NC_016911	TGA	3	9	415944	415952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723803
10555	NC_016911	T	6	6	415974	415979	0 %	100 %	0 %	0 %	378723803
10556	NC_016911	TAC	2	6	416001	416006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723803
10557	NC_016911	CTT	2	6	416070	416075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723803
10558	NC_016911	GGA	2	6	416090	416095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723803
10559	NC_016911	ATT	2	6	416110	416115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723803
10560	NC_016911	TA	3	6	416150	416155	50 %	50 %	0 %	0 %	378723803
10561	NC_016911	AAT	2	6	416164	416169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723803
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10564	NC_016911	TATT	2	8	416274	416281	25 %	75 %	0 %	0 %	378723803
10565	NC_016911	AT	3	6	416285	416290	50 %	50 %	0 %	0 %	378723803
10566	NC_016911	AT	3	6	416330	416335	50 %	50 %	0 %	0 %	378723803
10567	NC_016911	TTA	2	6	416340	416345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723803
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10569	NC_016911	T	6	6	416375	416380	0 %	100 %	0 %	0 %	378723803
10570	NC_016911	GAG	2	6	416423	416428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_016911	TAC	2	6	416465	416470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_016911	CTC	2	6	416502	416507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10573	NC_016911	GTAT	2	8	416523	416530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_016911	CAA	2	6	416536	416541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_016911	GAT	2	6	416605	416610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723804
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10578	NC_016911	TAT	2	6	416817	416822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723804
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10582	NC_016911	AT	3	6	417005	417010	50 %	50 %	0 %	0 %	378723804
10583	NC_016911	TAC	2	6	417036	417041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723804
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10585	NC_016911	AAG	2	6	417075	417080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723804
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10591	NC_016911	ATT	3	9	417341	417349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723804
10592	NC_016911	A	6	6	417375	417380	100 %	0 %	0 %	0 %	378723804
10593	NC_016911	CTA	2	6	417395	417400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723804
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10604	NC_016911	GAA	3	9	417748	417756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723804
10605	NC_016911	TA	3	6	417757	417762	50 %	50 %	0 %	0 %	378723804
10606	NC_016911	GAA	2	6	417792	417797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723804
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10608	NC_016911	AACT	2	8	417846	417853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10609	NC_016911	TAA	2	6	417859	417864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016911	TTATG	2	10	417910	417919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_016911	TGTGG	2	10	417933	417942	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_016911	GTC	2	6	417952	417957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_016911	GCA	2	6	417986	417991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10615	NC_016911	T	8	8	418020	418027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10617	NC_016911	CAA	2	6	418089	418094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_016911	CAA	2	6	418128	418133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_016911	GTT	2	6	418142	418147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10997	NC_016911	TCT	2	6	432939	432944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723822
10998	NC_016911	ATT	2	6	432953	432958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723822
10999	NC_016911	AAT	2	6	432967	432972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723822
11000	NC_016911	CAATAA	2	12	433165	433176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378723822

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