MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016911	TAT	2	6	277224	277229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016911	TA	3	6	277264	277269	50 %	50 %	0 %	0 %	378723654
7003	NC_016911	TAT	2	6	277312	277317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723654
7004	NC_016911	AAG	2	6	277340	277345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723654
7005	NC_016911	CTT	2	6	277352	277357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723654
7006	NC_016911	TTA	2	6	277387	277392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723654
7007	NC_016911	TTG	2	6	277436	277441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723654
7008	NC_016911	GTC	2	6	277454	277459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723654
7009	NC_016911	AGC	2	6	277466	277471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723654
7010	NC_016911	TGC	2	6	277511	277516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_016911	A	7	7	277550	277556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_016911	A	6	6	277599	277604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_016911	TAT	2	6	277674	277679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016911	TAG	2	6	277723	277728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_016911	TAT	2	6	277770	277775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016911	ACC	2	6	277808	277813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_016911	GGT	2	6	277830	277835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_016911	ATA	2	6	277890	277895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723655
7019	NC_016911	ATT	2	6	277897	277902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723655
7020	NC_016911	AGC	2	6	278013	278018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_016911	AAT	2	6	278043	278048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016911	AT	3	6	278053	278058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016911	GTC	2	6	278110	278115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_016911	A	6	6	278184	278189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016911	TA	3	6	278222	278227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_016911	A	6	6	278236	278241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016911	CAA	2	6	278282	278287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_016911	GCA	2	6	278294	278299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_016911	GAAA	2	8	278353	278360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016911	TAT	2	6	278363	278368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016911	TAT	2	6	278374	278379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_016911	TCT	3	9	278427	278435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723656
7033	NC_016911	AGATG	2	10	278459	278468	40 %	20 %	40 %	0 %	378723656
7034	NC_016911	TATCT	2	10	278473	278482	20 %	60 %	0 %	20 %	378723656
7035	NC_016911	AGTA	2	8	278504	278511	50 %	25 %	25 %	0 %	378723656
7036	NC_016911	CATG	2	8	278570	278577	25 %	25 %	25 %	25 %	378723656
7037	NC_016911	TAA	2	6	278594	278599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723656
7038	NC_016911	GATG	2	8	278750	278757	25 %	25 %	50 %	0 %	378723656
7039	NC_016911	GCG	2	6	278763	278768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723656
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7042	NC_016911	CGGT	2	8	278941	278948	0 %	25 %	50 %	25 %	378723656
7043	NC_016911	TA	4	8	279004	279011	50 %	50 %	0 %	0 %	378723656
7044	NC_016911	ATA	2	6	279013	279018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723656
7045	NC_016911	GTT	2	6	279048	279053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723656
7046	NC_016911	GTA	2	6	279130	279135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
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7048	NC_016911	AAGGC	2	10	279222	279231	40 %	0 %	40 %	20 %	378723656
7049	NC_016911	TTG	2	6	279232	279237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723656
7050	NC_016911	TGA	2	6	279293	279298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
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7052	NC_016911	AGT	2	6	279356	279361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
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7054	NC_016911	TGCT	2	8	279415	279422	0 %	50 %	25 %	25 %	378723656
7055	NC_016911	TGA	2	6	279445	279450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
7056	NC_016911	AAG	2	6	279457	279462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723656
7057	NC_016911	AGT	3	9	279491	279499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
7058	NC_016911	TA	3	6	279512	279517	50 %	50 %	0 %	0 %	378723656
7059	NC_016911	ACTA	2	8	279560	279567	50 %	25 %	0 %	25 %	378723656
7060	NC_016911	ATA	2	6	279591	279596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723656
7061	NC_016911	TAT	2	6	279599	279604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723656
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7063	NC_016911	TTAAAG	2	12	279907	279918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378723656
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7067	NC_016911	TGA	2	6	280106	280111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
7068	NC_016911	GTA	2	6	280138	280143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
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7083	NC_016911	GCGGTA	2	12	280843	280854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378723656
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7089	NC_016911	CTG	2	6	281068	281073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723656
7090	NC_016911	AGA	3	9	281078	281086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723656
7091	NC_016911	TCA	2	6	281217	281222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_016911	GAG	2	6	281227	281232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_016911	TTG	2	6	281236	281241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_016911	CAA	2	6	281314	281319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_016911	AGC	2	6	281329	281334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7097	NC_016911	TTA	2	6	281420	281425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_016911	C	10	10	281451	281460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7099	NC_016911	A	9	9	281461	281469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_016911	CT	3	6	281504	281509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_016911	ATA	2	6	281510	281515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016911	T	7	7	281557	281563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_016911	ACT	2	6	281564	281569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7106	NC_016911	TAT	2	6	281691	281696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_016911	TCTA	2	8	281763	281770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7108	NC_016911	ATT	2	6	281784	281789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_016911	ATT	2	6	281800	281805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016911	TGT	2	6	281826	281831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016911	T	6	6	281861	281866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_016911	ATT	2	6	281870	281875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016911	TGTT	2	8	281894	281901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_016911	TA	3	6	281927	281932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_016911	AT	3	6	281934	281939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7121	NC_016911	ATTGG	2	10	282093	282102	20 %	40 %	40 %	0 %	378723657
7122	NC_016911	TTG	2	6	282141	282146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723657
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7124	NC_016911	TTAT	2	8	282160	282167	25 %	75 %	0 %	0 %	378723657
7125	NC_016911	TGA	2	6	282195	282200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723657
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