MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_016911	ACA	2	6	257866	257871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723636
6503	NC_016911	GCT	2	6	257875	257880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723636
6504	NC_016911	GCA	2	6	257896	257901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723636
6505	NC_016911	TGT	2	6	257911	257916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723636
6506	NC_016911	AT	3	6	257947	257952	50 %	50 %	0 %	0 %	378723636
6507	NC_016911	TTAT	2	8	257980	257987	25 %	75 %	0 %	0 %	378723637
6508	NC_016911	ATT	2	6	258024	258029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723637
6509	NC_016911	TCG	2	6	258082	258087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723637
6510	NC_016911	TTC	2	6	258111	258116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723637
6511	NC_016911	TCT	2	6	258163	258168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723637
6512	NC_016911	AT	3	6	258179	258184	50 %	50 %	0 %	0 %	378723637
6513	NC_016911	AGC	2	6	258200	258205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_016911	T	6	6	258263	258268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016911	ATA	2	6	258269	258274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_016911	T	6	6	258306	258311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_016911	AGA	2	6	258314	258319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016911	TGT	2	6	258386	258391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_016911	TTC	2	6	258401	258406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_016911	AAT	2	6	258408	258413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_016911	TTA	2	6	258525	258530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016911	TTGT	2	8	258533	258540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016911	AAGA	2	8	258589	258596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016911	T	6	6	258598	258603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016911	GTATT	2	10	258613	258622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016911	A	6	6	258664	258669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016911	AGT	2	6	258675	258680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_016911	TA	3	6	258690	258695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016911	ATTG	2	8	258713	258720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016911	ATTA	2	8	258727	258734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_016911	TGTA	2	8	258760	258767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016911	GCT	2	6	258810	258815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_016911	AG	4	8	258866	258873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_016911	TTA	2	6	258876	258881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_016911	AT	3	6	258933	258938	50 %	50 %	0 %	0 %	378723638
6536	NC_016911	ATT	2	6	258987	258992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723638
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6538	NC_016911	TTA	2	6	259007	259012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723638
6539	NC_016911	T	6	6	259035	259040	0 %	100 %	0 %	0 %	378723638
6540	NC_016911	TTC	2	6	259044	259049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723638
6541	NC_016911	TCT	2	6	259072	259077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723638
6542	NC_016911	T	7	7	259116	259122	0 %	100 %	0 %	0 %	378723638
6543	NC_016911	CTA	2	6	259124	259129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723638
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6545	NC_016911	T	6	6	259254	259259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_016911	AT	3	6	259266	259271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_016911	GTT	2	6	259303	259308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016911	AAT	2	6	259318	259323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_016911	TTC	2	6	259338	259343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_016911	T	7	7	259387	259393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_016911	TAC	2	6	259414	259419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723639
6552	NC_016911	CTG	2	6	259442	259447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723639
6553	NC_016911	AAT	2	6	259457	259462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723639
6554	NC_016911	TCT	3	9	259516	259524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723639
6555	NC_016911	AT	3	6	259567	259572	50 %	50 %	0 %	0 %	378723639
6556	NC_016911	CGC	2	6	259618	259623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_016911	TAA	3	9	259639	259647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_016911	A	6	6	259723	259728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_016911	TGT	2	6	259729	259734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_016911	TAT	2	6	259741	259746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_016911	T	6	6	259800	259805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016911	TA	3	6	259812	259817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016911	TGA	2	6	259830	259835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016911	AT	3	6	259885	259890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016911	TAA	2	6	259966	259971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016911	TGAA	2	8	260052	260059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_016911	ATA	2	6	260199	260204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6570	NC_016911	TAT	3	9	260377	260385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_016911	TAG	2	6	260447	260452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6574	NC_016911	TAG	2	6	260584	260589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6582	NC_016911	AGTA	2	8	260884	260891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_016911	TGAT	2	8	260927	260934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_016911	TTA	2	6	261020	261025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_016911	ATT	2	6	261664	261669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_016911	ATA	2	6	261750	261755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6605	NC_016911	ATA	2	6	261918	261923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6612	NC_016911	TAA	2	6	262268	262273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016911	AT	5	10	262318	262327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_016911	TCA	2	6	262358	262363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6618	NC_016911	A	6	6	262413	262418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_016911	TAA	2	6	262435	262440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_016911	TTA	2	6	262444	262449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_016911	ATT	2	6	262503	262508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_016911	CTTA	2	8	262509	262516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6623	NC_016911	TGC	2	6	262527	262532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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