MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_016909	CT	4	8	1219861	1219868	0 %	50 %	0 %	50 %	378723303
31003	NC_016909	T	6	6	1219939	1219944	0 %	100 %	0 %	0 %	378723303
31004	NC_016909	ATT	2	6	1219975	1219980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723303
31005	NC_016909	ATTTT	2	10	1220058	1220067	20 %	80 %	0 %	0 %	378723303
31006	NC_016909	TATT	2	8	1220102	1220109	25 %	75 %	0 %	0 %	378723303
31007	NC_016909	TAA	2	6	1220121	1220126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723303
31008	NC_016909	TCTT	2	8	1220152	1220159	0 %	75 %	0 %	25 %	378723303
31009	NC_016909	T	7	7	1220163	1220169	0 %	100 %	0 %	0 %	378723303
31010	NC_016909	ATA	2	6	1220179	1220184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723303
31011	NC_016909	TAAT	2	8	1220196	1220203	50 %	50 %	0 %	0 %	378723303
31012	NC_016909	TAG	2	6	1220205	1220210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723303
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31014	NC_016909	TTC	2	6	1220392	1220397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723303
31015	NC_016909	AT	3	6	1220412	1220417	50 %	50 %	0 %	0 %	378723303
31016	NC_016909	T	7	7	1220438	1220444	0 %	100 %	0 %	0 %	378723303
31017	NC_016909	TTC	2	6	1220461	1220466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723303
31018	NC_016909	TAA	3	9	1220479	1220487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723303
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31023	NC_016909	CT	3	6	1220823	1220828	0 %	50 %	0 %	50 %	378723304
31024	NC_016909	TCA	2	6	1220833	1220838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723304
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31026	NC_016909	AAGC	2	8	1220855	1220862	50 %	0 %	25 %	25 %	378723304
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31032	NC_016909	ATA	2	6	1221126	1221131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723304
31033	NC_016909	TGC	2	6	1221133	1221138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723304
31034	NC_016909	CATAC	2	10	1221153	1221162	40 %	20 %	0 %	40 %	378723304
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31038	NC_016909	T	6	6	1221351	1221356	0 %	100 %	0 %	0 %	378723304
31039	NC_016909	TAT	3	9	1221364	1221372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_016909	GAAA	2	8	1221376	1221383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_016909	TTAA	2	8	1221414	1221421	50 %	50 %	0 %	0 %	378723305
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31053	NC_016909	AATA	2	8	1221864	1221871	75 %	25 %	0 %	0 %	378723306
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31068	NC_016909	A	7	7	1222631	1222637	100 %	0 %	0 %	0 %	378723307
31069	NC_016909	T	6	6	1222665	1222670	0 %	100 %	0 %	0 %	378723307
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31090	NC_016909	CGAA	2	8	1223602	1223609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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31092	NC_016909	ATA	2	6	1223679	1223684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_016909	ATA	2	6	1223691	1223696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_016909	CGT	2	6	1223746	1223751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31095	NC_016909	ATA	2	6	1223822	1223827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31097	NC_016909	TAC	2	6	1223842	1223847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31098	NC_016909	A	6	6	1223902	1223907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31099	NC_016909	TGC	2	6	1223908	1223913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31100	NC_016909	TATAA	2	10	1223916	1223925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_016909	TAC	2	6	1223988	1223993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31102	NC_016909	TTATT	2	10	1224007	1224016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_016909	A	7	7	1224022	1224028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31104	NC_016909	ATA	2	6	1224030	1224035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_016909	TTGC	2	8	1224090	1224097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31106	NC_016909	GTC	2	6	1224110	1224115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31107	NC_016909	GAG	2	6	1224121	1224126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_016909	AAT	2	6	1224151	1224156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_016909	TCG	2	6	1224196	1224201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31110	NC_016909	TTC	2	6	1224215	1224220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31111	NC_016909	CTAT	2	8	1224237	1224244	25 %	50 %	0 %	25 %	378723308
31112	NC_016909	T	6	6	1224319	1224324	0 %	100 %	0 %	0 %	378723308
31113	NC_016909	T	6	6	1224326	1224331	0 %	100 %	0 %	0 %	378723308
31114	NC_016909	AGA	2	6	1224340	1224345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723308
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31117	NC_016909	T	6	6	1224440	1224445	0 %	100 %	0 %	0 %	378723308
31118	NC_016909	TAT	2	6	1224495	1224500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723308
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31120	NC_016909	AT	3	6	1224590	1224595	50 %	50 %	0 %	0 %	378723308
31121	NC_016909	T	6	6	1224599	1224604	0 %	100 %	0 %	0 %	378723308
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