MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_016909	TCTA	2	8	649873	649880	25 %	50 %	0 %	25 %	378722698
16502	NC_016909	A	6	6	649930	649935	100 %	0 %	0 %	0 %	378722698
16503	NC_016909	GCA	2	6	649955	649960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722698
16504	NC_016909	TAAT	2	8	649976	649983	50 %	50 %	0 %	0 %	378722698
16505	NC_016909	GAA	2	6	649992	649997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722698
16506	NC_016909	CTA	2	6	650025	650030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722698
16507	NC_016909	ATA	2	6	650040	650045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722698
16508	NC_016909	CTTGC	2	10	650085	650094	0 %	40 %	20 %	40 %	378722698
16509	NC_016909	ATCTC	2	10	650170	650179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16510	NC_016909	CGA	2	6	650238	650243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_016909	GCT	2	6	650286	650291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_016909	ACT	2	6	650310	650315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722699
16513	NC_016909	CTTA	2	8	650335	650342	25 %	50 %	0 %	25 %	378722699
16514	NC_016909	ATT	2	6	650365	650370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722699
16515	NC_016909	GCG	3	9	650395	650403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722699
16516	NC_016909	TAA	2	6	650416	650421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722699
16517	NC_016909	ATT	2	6	650473	650478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722699
16518	NC_016909	TGCAC	2	10	650504	650513	20 %	20 %	20 %	40 %	378722699
16519	NC_016909	TAAT	2	8	650550	650557	50 %	50 %	0 %	0 %	378722699
16520	NC_016909	TGT	2	6	650558	650563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722699
16521	NC_016909	GTA	2	6	650573	650578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722699
16522	NC_016909	AT	3	6	650604	650609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_016909	AAG	2	6	650626	650631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722700
16524	NC_016909	TTAAA	2	10	650639	650648	60 %	40 %	0 %	0 %	378722700
16525	NC_016909	GCAA	2	8	650692	650699	50 %	0 %	25 %	25 %	378722700
16526	NC_016909	TGC	2	6	650819	650824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722700
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16528	NC_016909	TAAA	2	8	650894	650901	75 %	25 %	0 %	0 %	378722700
16529	NC_016909	GTC	2	6	650961	650966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722700
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16532	NC_016909	TA	3	6	651141	651146	50 %	50 %	0 %	0 %	378722700
16533	NC_016909	TCA	2	6	651193	651198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722700
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16535	NC_016909	CT	3	6	651261	651266	0 %	50 %	0 %	50 %	378722700
16536	NC_016909	CGG	2	6	651315	651320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722700
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16540	NC_016909	T	8	8	651584	651591	0 %	100 %	0 %	0 %	378722700
16541	NC_016909	AAT	2	6	651647	651652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722700
16542	NC_016909	AT	3	6	651702	651707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_016909	AAT	2	6	651740	651745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722701
16544	NC_016909	TTC	2	6	651773	651778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722701
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16547	NC_016909	TATTT	2	10	651881	651890	20 %	80 %	0 %	0 %	378722701
16548	NC_016909	TAC	2	6	651929	651934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722701
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16550	NC_016909	TA	3	6	652007	652012	50 %	50 %	0 %	0 %	378722701
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16552	NC_016909	AT	3	6	652045	652050	50 %	50 %	0 %	0 %	378722701
16553	NC_016909	TTA	2	6	652057	652062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722701
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16557	NC_016909	TAA	2	6	652283	652288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722701
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16561	NC_016909	TAA	2	6	652409	652414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722701
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16602	NC_016909	TGG	2	6	654510	654515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722702
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