MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016909	CCA	2	6	590450	590455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722639
15003	NC_016909	TAA	2	6	590496	590501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722639
15004	NC_016909	GCT	2	6	590588	590593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722639
15005	NC_016909	TCT	2	6	590609	590614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722639
15006	NC_016909	TCA	2	6	590615	590620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722639
15007	NC_016909	TAA	2	6	590695	590700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722639
15008	NC_016909	TGC	2	6	590743	590748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722639
15009	NC_016909	TTTC	2	8	590787	590794	0 %	75 %	0 %	25 %	378722639
15010	NC_016909	TAA	2	6	590889	590894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722639
15011	NC_016909	T	6	6	590895	590900	0 %	100 %	0 %	0 %	378722639
15012	NC_016909	T	6	6	590907	590912	0 %	100 %	0 %	0 %	378722639
15013	NC_016909	CTC	2	6	590934	590939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722639
15014	NC_016909	ATACT	2	10	590985	590994	40 %	40 %	0 %	20 %	378722639
15015	NC_016909	ATA	2	6	590998	591003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722639
15016	NC_016909	T	6	6	591112	591117	0 %	100 %	0 %	0 %	378722639
15017	NC_016909	CTT	3	9	591120	591128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722639
15018	NC_016909	AAC	2	6	591136	591141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722639
15019	NC_016909	CCG	2	6	591167	591172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722639
15020	NC_016909	ATTTA	2	10	591208	591217	40 %	60 %	0 %	0 %	378722639
15021	NC_016909	AAC	2	6	591250	591255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722639
15022	NC_016909	AAT	2	6	591329	591334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_016909	TTA	2	6	591335	591340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_016909	TTA	2	6	591414	591419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_016909	AAT	2	6	591443	591448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_016909	AT	3	6	591480	591485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_016909	AT	3	6	591499	591504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016909	ATTA	2	8	591544	591551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_016909	ATTT	2	8	591579	591586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_016909	ATG	2	6	591621	591626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_016909	TTA	2	6	591638	591643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016909	ATGTT	2	10	591647	591656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_016909	GCT	2	6	591671	591676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_016909	TCA	2	6	591689	591694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_016909	TTTACC	2	12	591803	591814	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378722640
15036	NC_016909	A	7	7	591815	591821	100 %	0 %	0 %	0 %	378722640
15037	NC_016909	T	7	7	591833	591839	0 %	100 %	0 %	0 %	378722640
15038	NC_016909	T	8	8	591864	591871	0 %	100 %	0 %	0 %	378722640
15039	NC_016909	TA	3	6	591920	591925	50 %	50 %	0 %	0 %	378722640
15040	NC_016909	TAC	2	6	591959	591964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722640
15041	NC_016909	ATA	2	6	591981	591986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722640
15042	NC_016909	TA	3	6	592018	592023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_016909	TAT	2	6	592034	592039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_016909	TAA	2	6	592100	592105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_016909	TGA	2	6	592108	592113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_016909	AAT	2	6	592136	592141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722641
15047	NC_016909	AGC	2	6	592156	592161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722641
15048	NC_016909	T	7	7	592173	592179	0 %	100 %	0 %	0 %	378722641
15049	NC_016909	AAAC	2	8	592225	592232	75 %	0 %	0 %	25 %	378722641
15050	NC_016909	ATG	2	6	592246	592251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722641
15051	NC_016909	TTA	2	6	592266	592271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722641
15052	NC_016909	TAA	2	6	592291	592296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722641
15053	NC_016909	TTA	3	9	592403	592411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722642
15054	NC_016909	AAC	2	6	592422	592427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722642
15055	NC_016909	ACTATA	2	12	592516	592527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378722642
15056	NC_016909	ACTT	2	8	592608	592615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_016909	A	6	6	592665	592670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_016909	A	6	6	592675	592680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_016909	ATT	2	6	592688	592693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_016909	TCT	2	6	592757	592762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722643
15061	NC_016909	T	6	6	592812	592817	0 %	100 %	0 %	0 %	378722643
15062	NC_016909	TGCTT	2	10	592991	593000	0 %	60 %	20 %	20 %	378722643
15063	NC_016909	CTGC	2	8	593028	593035	0 %	25 %	25 %	50 %	378722643
15064	NC_016909	TAAA	2	8	593067	593074	75 %	25 %	0 %	0 %	378722643
15065	NC_016909	CAA	2	6	593091	593096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722643
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15067	NC_016909	TA	4	8	593166	593173	50 %	50 %	0 %	0 %	378722643
15068	NC_016909	TAA	2	6	593218	593223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722643
15069	NC_016909	GCAA	2	8	593251	593258	50 %	0 %	25 %	25 %	378722643
15070	NC_016909	ATA	2	6	593318	593323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722643
15071	NC_016909	TAT	2	6	593346	593351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722643
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15073	NC_016909	TAT	2	6	593586	593591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722643
15074	NC_016909	CAT	2	6	593607	593612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
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15076	NC_016909	ATC	2	6	593672	593677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
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15078	NC_016909	T	6	6	593731	593736	0 %	100 %	0 %	0 %	378722643
15079	NC_016909	CTA	2	6	593819	593824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
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15086	NC_016909	TTAAAT	2	12	594216	594227	50 %	50 %	0 %	0 %	378722643
15087	NC_016909	TCA	2	6	594230	594235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
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15089	NC_016909	CTT	2	6	594361	594366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722643
15090	NC_016909	AGTA	2	8	594409	594416	50 %	25 %	25 %	0 %	378722643
15091	NC_016909	TCA	2	6	594464	594469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
15092	NC_016909	TA	3	6	594486	594491	50 %	50 %	0 %	0 %	378722643
15093	NC_016909	TAT	3	9	594501	594509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722643
15094	NC_016909	ATC	2	6	594574	594579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722643
15095	NC_016909	AT	3	6	594632	594637	50 %	50 %	0 %	0 %	378722643
15096	NC_016909	CGT	2	6	594642	594647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722643
15097	NC_016909	ATT	2	6	594701	594706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722643
15098	NC_016909	TTA	3	9	594750	594758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722643
15099	NC_016909	GACAT	2	10	594849	594858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15101	NC_016909	CTT	2	6	594915	594920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722644
15102	NC_016909	TTC	2	6	594949	594954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722644
15103	NC_016909	TAA	2	6	595005	595010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722644
15104	NC_016909	TTA	2	6	595016	595021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722644
15105	NC_016909	A	7	7	595069	595075	100 %	0 %	0 %	0 %	378722644
15106	NC_016909	T	6	6	595095	595100	0 %	100 %	0 %	0 %	378722644
15107	NC_016909	TTC	2	6	595105	595110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722644
15108	NC_016909	TATC	2	8	595122	595129	25 %	50 %	0 %	25 %	378722644
15109	NC_016909	T	6	6	595153	595158	0 %	100 %	0 %	0 %	378722644
15110	NC_016909	AGC	2	6	595162	595167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722644
15111	NC_016909	ATT	2	6	595198	595203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722644
15112	NC_016909	TTCCA	2	10	595249	595258	20 %	40 %	0 %	40 %	378722644
15113	NC_016909	TAT	2	6	595275	595280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722644
15114	NC_016909	CTA	2	6	595284	595289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722644
15115	NC_016909	T	7	7	595331	595337	0 %	100 %	0 %	0 %	378722644
15116	NC_016909	CTT	2	6	595338	595343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722644
15117	NC_016909	TAA	2	6	595377	595382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722644
15118	NC_016909	TAAT	2	8	595446	595453	50 %	50 %	0 %	0 %	378722644
15119	NC_016909	TTG	2	6	595454	595459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722644
15120	NC_016909	TAA	2	6	595489	595494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722644
15121	NC_016909	TAT	2	6	595498	595503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722644
15122	NC_016909	GAG	2	6	595506	595511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722644
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15500	NC_016909	CTG	2	6	609593	609598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722665

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