MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016909	AGT	2	6	40299	40304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016909	AGC	2	6	40395	40400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016909	TTG	2	6	40436	40441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016909	TTG	2	6	40467	40472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016909	TA	3	6	40499	40504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016909	TAA	2	6	40563	40568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016909	AT	3	6	40623	40628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016909	CTTG	2	8	40703	40710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016909	CTGA	2	8	40711	40718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016909	TAT	2	6	40748	40753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016909	AAT	2	6	40804	40809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016909	T	6	6	40867	40872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016909	TA	5	10	40877	40886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016909	ATTG	2	8	40889	40896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016909	ATCTTT	2	12	40975	40986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1016	NC_016909	TAA	2	6	41011	41016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016909	CTTTT	2	10	41017	41026	0 %	80 %	0 %	20 %	378722065
1018	NC_016909	TAAA	2	8	41045	41052	75 %	25 %	0 %	0 %	378722065
1019	NC_016909	T	6	6	41094	41099	0 %	100 %	0 %	0 %	378722065
1020	NC_016909	AGA	2	6	41137	41142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722065
1021	NC_016909	ATTT	2	8	41150	41157	25 %	75 %	0 %	0 %	378722065
1022	NC_016909	T	6	6	41190	41195	0 %	100 %	0 %	0 %	378722065
1023	NC_016909	TCT	2	6	41233	41238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722065
1024	NC_016909	TAA	2	6	41248	41253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722065
1025	NC_016909	ATTA	2	8	41316	41323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016909	TA	3	6	41329	41334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016909	CTT	2	6	41366	41371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016909	ATTA	2	8	41373	41380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016909	AT	3	6	41398	41403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016909	TTATT	2	10	41426	41435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016909	ATC	2	6	41460	41465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_016909	TGCT	3	12	41496	41507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016909	TTTTA	2	10	41530	41539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016909	TCA	2	6	41588	41593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016909	ATT	2	6	41617	41622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016909	GCTT	2	8	41623	41630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_016909	ACT	2	6	41643	41648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016909	TTTA	2	8	41663	41670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016909	T	6	6	41764	41769	0 %	100 %	0 %	0 %	378722066
1040	NC_016909	TAG	2	6	41786	41791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722066
1041	NC_016909	T	6	6	41807	41812	0 %	100 %	0 %	0 %	378722066
1042	NC_016909	TAG	2	6	41831	41836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722066
1043	NC_016909	AGC	2	6	41853	41858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722066
1044	NC_016909	T	6	6	41896	41901	0 %	100 %	0 %	0 %	378722066
1045	NC_016909	T	7	7	41942	41948	0 %	100 %	0 %	0 %	378722066
1046	NC_016909	TCT	2	6	42027	42032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016909	TTA	2	6	42060	42065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016909	AAT	2	6	42074	42079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016909	ATTA	2	8	42104	42111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016909	TCT	2	6	42176	42181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016909	T	6	6	42181	42186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016909	CAT	2	6	42190	42195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016909	ATT	2	6	42232	42237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016909	AGTTG	2	10	42278	42287	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016909	TTG	3	9	42290	42298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016909	CTA	2	6	42325	42330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016909	T	6	6	42347	42352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016909	TAAT	2	8	42397	42404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016909	GTT	2	6	42415	42420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016909	T	6	6	42419	42424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016909	TAA	2	6	42428	42433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016909	A	6	6	42443	42448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016909	TAA	2	6	42461	42466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016909	ATTA	2	8	42467	42474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016909	GAT	2	6	42528	42533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016909	AT	3	6	42543	42548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016909	TAT	2	6	42564	42569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016909	AAAT	2	8	42570	42577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016909	TAA	2	6	42580	42585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016909	ATA	2	6	42604	42609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722067
1071	NC_016909	TAT	2	6	42623	42628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722067
1072	NC_016909	ATA	2	6	42663	42668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722067
1073	NC_016909	TTC	2	6	42686	42691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722067
1074	NC_016909	TAG	2	6	42728	42733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722067
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1077	NC_016909	ATTT	2	8	42825	42832	25 %	75 %	0 %	0 %	378722067
1078	NC_016909	TAC	2	6	42836	42841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722067
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1080	NC_016909	TAT	2	6	42884	42889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722067
1081	NC_016909	GAA	2	6	42899	42904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722067
1082	NC_016909	AGT	2	6	42923	42928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722067
1083	NC_016909	TTA	2	6	42931	42936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722067
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1085	NC_016909	A	6	6	42985	42990	100 %	0 %	0 %	0 %	378722067
1086	NC_016909	GAT	2	6	42993	42998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722067
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1089	NC_016909	ACA	2	6	43109	43114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722067
1090	NC_016909	ATT	2	6	43162	43167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722067
1091	NC_016909	TGA	2	6	43222	43227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722068
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1101	NC_016909	GTT	2	6	43571	43576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722068
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1103	NC_016909	A	6	6	43597	43602	100 %	0 %	0 %	0 %	378722068
1104	NC_016909	CTT	2	6	43656	43661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722068
1105	NC_016909	GT	3	6	43664	43669	0 %	50 %	50 %	0 %	378722068
1106	NC_016909	TA	3	6	43789	43794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016909	AT	3	6	43795	43800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016909	ATT	2	6	43815	43820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016909	AAT	2	6	43835	43840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722069
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1111	NC_016909	TAT	2	6	43871	43876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722069
1112	NC_016909	TTA	2	6	43942	43947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722069
1113	NC_016909	T	6	6	43967	43972	0 %	100 %	0 %	0 %	378722069
1114	NC_016909	AT	3	6	43979	43984	50 %	50 %	0 %	0 %	378722069
1115	NC_016909	AT	3	6	44003	44008	50 %	50 %	0 %	0 %	378722069
1116	NC_016909	ATT	2	6	44031	44036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722069
1117	NC_016909	TTA	2	6	44148	44153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722069
1118	NC_016909	TAC	2	6	44171	44176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722069
1119	NC_016909	T	6	6	44193	44198	0 %	100 %	0 %	0 %	378722069
1120	NC_016909	GTA	2	6	44256	44261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722069
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1122	NC_016909	ATT	2	6	44314	44319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722069
1123	NC_016909	AAT	2	6	44403	44408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722069
1124	NC_016909	CT	3	6	44417	44422	0 %	50 %	0 %	50 %	378722069
1125	NC_016909	GAT	2	6	44445	44450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722069
1126	NC_016909	GAT	2	6	44496	44501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722069
1127	NC_016909	ATT	2	6	44544	44549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016909	TACC	2	8	44650	44657	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_016909	AAAC	2	8	44658	44665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016909	TAAT	2	8	44734	44741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016909	ATTT	2	8	44761	44768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016909	ATTA	2	8	44769	44776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016909	CGT	2	6	44782	44787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_016909	TAAGT	2	10	44812	44821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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