MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016909	TGC	2	6	239469	239474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722259
6003	NC_016909	TTGCT	2	10	239497	239506	0 %	60 %	20 %	20 %	378722259
6004	NC_016909	CGAA	2	8	239601	239608	50 %	0 %	25 %	25 %	378722259
6005	NC_016909	TCA	2	6	239648	239653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722259
6006	NC_016909	CTA	2	6	239706	239711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722259
6007	NC_016909	TTAG	2	8	239714	239721	25 %	50 %	25 %	0 %	378722259
6008	NC_016909	ATG	2	6	239773	239778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722259
6009	NC_016909	CAC	2	6	239823	239828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722259
6010	NC_016909	TGTA	2	8	239863	239870	25 %	50 %	25 %	0 %	378722259
6011	NC_016909	CTTCTA	2	12	239886	239897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378722259
6012	NC_016909	T	7	7	239916	239922	0 %	100 %	0 %	0 %	378722259
6013	NC_016909	AGA	2	6	239929	239934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722259
6014	NC_016909	TTA	2	6	239957	239962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722259
6015	NC_016909	TA	3	6	239961	239966	50 %	50 %	0 %	0 %	378722259
6016	NC_016909	T	6	6	239972	239977	0 %	100 %	0 %	0 %	378722259
6017	NC_016909	TCT	2	6	240107	240112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722259
6018	NC_016909	T	6	6	240161	240166	0 %	100 %	0 %	0 %	378722259
6019	NC_016909	AGA	2	6	240271	240276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722259
6020	NC_016909	ATT	3	9	240280	240288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722259
6021	NC_016909	T	7	7	240298	240304	0 %	100 %	0 %	0 %	378722259
6022	NC_016909	TCA	2	6	240308	240313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722259
6023	NC_016909	ATT	2	6	240320	240325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722259
6024	NC_016909	TAT	3	9	240351	240359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722259
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6029	NC_016909	T	7	7	240474	240480	0 %	100 %	0 %	0 %	378722259
6030	NC_016909	TCT	2	6	240485	240490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722259
6031	NC_016909	ATT	2	6	240496	240501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016909	GTT	2	6	240516	240521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016909	TTC	2	6	240573	240578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_016909	TTA	2	6	240625	240630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016909	TA	3	6	240658	240663	50 %	50 %	0 %	0 %	378722260
6036	NC_016909	T	6	6	240678	240683	0 %	100 %	0 %	0 %	378722260
6037	NC_016909	TAA	2	6	240703	240708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722260
6038	NC_016909	T	6	6	240719	240724	0 %	100 %	0 %	0 %	378722260
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6041	NC_016909	T	6	6	240826	240831	0 %	100 %	0 %	0 %	378722260
6042	NC_016909	TA	3	6	241116	241121	50 %	50 %	0 %	0 %	378722260
6043	NC_016909	TGC	2	6	241126	241131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722260
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6048	NC_016909	TAG	2	6	241377	241382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722260
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6050	NC_016909	TTTA	2	8	241561	241568	25 %	75 %	0 %	0 %	378722260
6051	NC_016909	T	6	6	241585	241590	0 %	100 %	0 %	0 %	378722260
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6054	NC_016909	TAG	3	9	241794	241802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722260
6055	NC_016909	CTA	2	6	241806	241811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722260
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6058	NC_016909	TC	3	6	241866	241871	0 %	50 %	0 %	50 %	378722260
6059	NC_016909	TCA	2	6	241892	241897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722260
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6062	NC_016909	GTT	3	9	242110	242118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722260
6063	NC_016909	TAT	2	6	242130	242135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016909	CAA	2	6	242196	242201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722261
6065	NC_016909	TGC	2	6	242208	242213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722261
6066	NC_016909	TCC	2	6	242263	242268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722261
6067	NC_016909	TTTC	2	8	242309	242316	0 %	75 %	0 %	25 %	378722261
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6071	NC_016909	TCA	2	6	242470	242475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722261
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6074	NC_016909	CCG	2	6	242548	242553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722261
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