MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016909	AATTA	2	10	218944	218953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016909	ATT	2	6	218973	218978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722236
5503	NC_016909	TAA	2	6	219000	219005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722236
5504	NC_016909	AAAAGC	2	12	219033	219044	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378722236
5505	NC_016909	T	6	6	219082	219087	0 %	100 %	0 %	0 %	378722236
5506	NC_016909	AGTA	2	8	219093	219100	50 %	25 %	25 %	0 %	378722236
5507	NC_016909	GTTT	2	8	219101	219108	0 %	75 %	25 %	0 %	378722236
5508	NC_016909	TAG	2	6	219114	219119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722236
5509	NC_016909	TAA	2	6	219140	219145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722236
5510	NC_016909	AT	3	6	219330	219335	50 %	50 %	0 %	0 %	378722236
5511	NC_016909	ATA	2	6	219355	219360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722236
5512	NC_016909	TGG	2	6	219426	219431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722236
5513	NC_016909	TAG	2	6	219440	219445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722236
5514	NC_016909	AAAT	2	8	219501	219508	75 %	25 %	0 %	0 %	378722236
5515	NC_016909	TTC	2	6	219527	219532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722236
5516	NC_016909	TAT	2	6	219546	219551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722236
5517	NC_016909	CAG	2	6	219553	219558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722236
5518	NC_016909	AG	3	6	219623	219628	50 %	0 %	50 %	0 %	378722236
5519	NC_016909	AGC	2	6	219651	219656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722236
5520	NC_016909	AAGT	2	8	219675	219682	50 %	25 %	25 %	0 %	378722236
5521	NC_016909	AAAT	2	8	219755	219762	75 %	25 %	0 %	0 %	378722236
5522	NC_016909	GAA	2	6	219772	219777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722236
5523	NC_016909	GAA	2	6	219805	219810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722236
5524	NC_016909	AAG	2	6	219812	219817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722236
5525	NC_016909	TAA	2	6	219840	219845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722236
5526	NC_016909	GGA	2	6	219883	219888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722236
5527	NC_016909	TA	3	6	219889	219894	50 %	50 %	0 %	0 %	378722236
5528	NC_016909	TTTA	3	12	219964	219975	25 %	75 %	0 %	0 %	378722237
5529	NC_016909	T	7	7	220013	220019	0 %	100 %	0 %	0 %	378722237
5530	NC_016909	AT	3	6	220182	220187	50 %	50 %	0 %	0 %	378722237
5531	NC_016909	CAT	2	6	220190	220195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722237
5532	NC_016909	ATT	2	6	220278	220283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722237
5533	NC_016909	AAT	2	6	220290	220295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722237
5534	NC_016909	GT	3	6	220390	220395	0 %	50 %	50 %	0 %	378722237
5535	NC_016909	AAGGC	2	10	220398	220407	40 %	0 %	40 %	20 %	378722237
5536	NC_016909	TGC	2	6	220434	220439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722238
5537	NC_016909	TTTCTT	2	12	220483	220494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378722238
5538	NC_016909	TTTTCT	2	12	220503	220514	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378722238
5539	NC_016909	AT	3	6	220516	220521	50 %	50 %	0 %	0 %	378722238
5540	NC_016909	TCA	2	6	220579	220584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722238
5541	NC_016909	TGC	2	6	220615	220620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722238
5542	NC_016909	CT	3	6	220643	220648	0 %	50 %	0 %	50 %	378722238
5543	NC_016909	TAT	2	6	220672	220677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722238
5544	NC_016909	T	6	6	220679	220684	0 %	100 %	0 %	0 %	378722238
5545	NC_016909	AT	3	6	220702	220707	50 %	50 %	0 %	0 %	378722239
5546	NC_016909	ATC	2	6	220773	220778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722239
5547	NC_016909	ATG	2	6	220818	220823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722239
5548	NC_016909	A	6	6	220918	220923	100 %	0 %	0 %	0 %	378722239
5549	NC_016909	TAA	2	6	220962	220967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722239
5550	NC_016909	AATA	2	8	220990	220997	75 %	25 %	0 %	0 %	378722239
5551	NC_016909	ATT	2	6	221024	221029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722239
5552	NC_016909	GGT	2	6	221043	221048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722239
5553	NC_016909	A	6	6	221167	221172	100 %	0 %	0 %	0 %	378722239
5554	NC_016909	AAT	3	9	221174	221182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722239
5555	NC_016909	AGA	2	6	221212	221217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722239
5556	NC_016909	TCA	2	6	221237	221242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722239
5557	NC_016909	TAT	2	6	221266	221271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722239
5558	NC_016909	GGAG	2	8	221281	221288	25 %	0 %	75 %	0 %	378722239
5559	NC_016909	ATG	2	6	221298	221303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722239
5560	NC_016909	CTT	2	6	221312	221317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722239
5561	NC_016909	AT	3	6	221358	221363	50 %	50 %	0 %	0 %	378722239
5562	NC_016909	CAG	2	6	221376	221381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722239
5563	NC_016909	GTT	2	6	221407	221412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722239
5564	NC_016909	GCT	2	6	221502	221507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_016909	TA	3	6	221610	221615	50 %	50 %	0 %	0 %	378722240
5566	NC_016909	AAT	2	6	221628	221633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722240
5567	NC_016909	AAATTA	2	12	221662	221673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722240
5568	NC_016909	AAT	2	6	221674	221679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722240
5569	NC_016909	AGA	2	6	221709	221714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722240
5570	NC_016909	TAA	2	6	221715	221720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722240
5571	NC_016909	AGT	2	6	221727	221732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722240
5572	NC_016909	ATT	2	6	221742	221747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722240
5573	NC_016909	TATT	2	8	221753	221760	25 %	75 %	0 %	0 %	378722240
5574	NC_016909	TTG	2	6	221799	221804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016909	TG	3	6	221803	221808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016909	TAT	2	6	221874	221879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_016909	CAA	2	6	221945	221950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_016909	AAT	2	6	221962	221967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_016909	CTA	2	6	221992	221997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_016909	TAT	2	6	222003	222008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_016909	TTA	2	6	222017	222022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722241
5582	NC_016909	CTT	2	6	222026	222031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722241
5583	NC_016909	AT	3	6	222041	222046	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
5584	NC_016909	TCC	2	6	222089	222094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722241
5585	NC_016909	AGC	3	9	222122	222130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722241
5586	NC_016909	GCA	2	6	222174	222179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722241
5587	NC_016909	AGT	2	6	222182	222187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722241
5588	NC_016909	TAT	2	6	222224	222229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722241
5589	NC_016909	CTT	2	6	222232	222237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722241
5590	NC_016909	CTA	2	6	222277	222282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
5591	NC_016909	ATA	2	6	222285	222290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722241
5592	NC_016909	TAAT	2	8	222301	222308	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
5593	NC_016909	TAA	2	6	222319	222324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722241
5594	NC_016909	AG	3	6	222367	222372	50 %	0 %	50 %	0 %	378722241
5595	NC_016909	ACC	2	6	222380	222385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722241
5596	NC_016909	TAA	2	6	222416	222421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722241
5597	NC_016909	CT	3	6	222512	222517	0 %	50 %	0 %	50 %	378722241
5598	NC_016909	TA	3	6	222536	222541	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
5599	NC_016909	CAT	2	6	222604	222609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
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5601	NC_016909	ATT	2	6	222659	222664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722241
5602	NC_016909	T	6	6	222691	222696	0 %	100 %	0 %	0 %	378722241
5603	NC_016909	ATT	3	9	222731	222739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722241
5604	NC_016909	T	6	6	222738	222743	0 %	100 %	0 %	0 %	378722241
5605	NC_016909	TTG	2	6	222848	222853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722241
5606	NC_016909	TTG	2	6	223016	223021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722241
5607	NC_016909	ATC	2	6	223037	223042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
5608	NC_016909	T	6	6	223206	223211	0 %	100 %	0 %	0 %	378722241
5609	NC_016909	GAAT	2	8	223216	223223	50 %	25 %	25 %	0 %	378722241
5610	NC_016909	AT	3	6	223273	223278	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
5611	NC_016909	T	6	6	223297	223302	0 %	100 %	0 %	0 %	378722241
5612	NC_016909	CTT	2	6	223306	223311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722241
5613	NC_016909	ACT	2	6	223314	223319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
5614	NC_016909	TAG	2	6	223321	223326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722241
5615	NC_016909	CAT	2	6	223378	223383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
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5617	NC_016909	T	6	6	223402	223407	0 %	100 %	0 %	0 %	378722241
5618	NC_016909	TAA	2	6	223423	223428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722241
5619	NC_016909	ATG	3	9	223441	223449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722241
5620	NC_016909	AAT	2	6	223451	223456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722241
5621	NC_016909	AT	3	6	223503	223508	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
5622	NC_016909	TAT	2	6	223567	223572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722241
5623	NC_016909	CAT	2	6	223595	223600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722241
5624	NC_016909	AGTTAA	2	12	223604	223615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378722241
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5653	NC_016909	TA	3	6	225167	225172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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