MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016908	GCC	2	6	550476	550481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378721241
14003	NC_016908	A	6	6	550589	550594	100 %	0 %	0 %	0 %	378721241
14004	NC_016908	GTG	2	6	550620	550625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378721241
14005	NC_016908	GTA	2	6	550645	550650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721241
14006	NC_016908	ATT	3	9	550663	550671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721242
14007	NC_016908	AATCCC	2	12	550738	550749	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378721242
14008	NC_016908	TCA	2	6	550782	550787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721242
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14010	NC_016908	ATACT	2	10	550822	550831	40 %	40 %	0 %	20 %	378721242
14011	NC_016908	ATAGCA	2	12	550839	550850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378721242
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14014	NC_016908	A	6	6	551056	551061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_016908	TAGTTT	2	12	551072	551083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_016908	CTG	2	6	551122	551127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_016908	ATC	2	6	551129	551134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_016908	ACT	2	6	551135	551140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_016908	TAA	2	6	551141	551146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_016908	TAT	2	6	551210	551215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_016908	TTAG	2	8	551243	551250	25 %	50 %	25 %	0 %	378721243
14022	NC_016908	CTT	2	6	551264	551269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721243
14023	NC_016908	TACT	2	8	551323	551330	25 %	50 %	0 %	25 %	378721243
14024	NC_016908	GATG	2	8	551359	551366	25 %	25 %	50 %	0 %	378721243
14025	NC_016908	T	6	6	551402	551407	0 %	100 %	0 %	0 %	378721243
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14044	NC_016908	TAA	2	6	552175	552180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721243
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14046	NC_016908	TAA	2	6	552283	552288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_016908	ATTT	2	8	552375	552382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_016908	CAG	2	6	552417	552422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_016908	TTTAG	2	10	552464	552473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14051	NC_016908	TTG	2	6	552523	552528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_016908	T	6	6	552553	552558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_016908	TAA	2	6	552564	552569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_016908	GTAAT	2	10	552646	552655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_016908	CAA	2	6	552662	552667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14058	NC_016908	ATA	2	6	552727	552732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_016908	TAT	2	6	552755	552760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_016908	TAA	2	6	552795	552800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_016908	ATA	2	6	552831	552836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_016908	TA	3	6	552843	552848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_016908	TAA	2	6	552852	552857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_016908	A	6	6	552877	552882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_016908	AAGA	2	8	552889	552896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14099	NC_016908	CTTA	2	8	553849	553856	25 %	50 %	0 %	25 %	378721244
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14103	NC_016908	A	6	6	554095	554100	100 %	0 %	0 %	0 %	378721244
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14107	NC_016908	A	6	6	554288	554293	100 %	0 %	0 %	0 %	378721244
14108	NC_016908	AGC	2	6	554344	554349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721244
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14110	NC_016908	TAG	2	6	554441	554446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_016908	A	6	6	554454	554459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_016908	T	6	6	554464	554469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_016908	ATTT	2	8	554474	554481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_016908	AT	3	6	554488	554493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_016908	TATTAA	2	12	554501	554512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_016908	GTT	2	6	554514	554519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_016908	T	6	6	554518	554523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_016908	ACT	2	6	554569	554574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_016908	A	7	7	554575	554581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_016908	GTA	2	6	554601	554606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_016908	TAA	3	9	554613	554621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14269	NC_016908	TAT	2	6	559762	559767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14297	NC_016908	TGATA	2	10	560667	560676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14323	NC_016908	AGTA	2	8	561610	561617	50 %	25 %	25 %	0 %	378721255
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14359	NC_016908	GAT	2	6	563316	563321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721258
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14363	NC_016908	AAGG	2	8	563522	563529	50 %	0 %	50 %	0 %	378721258
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14366	NC_016908	GTA	2	6	563608	563613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14367	NC_016908	CAT	2	6	563629	563634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14368	NC_016908	ATATTA	2	12	563675	563686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14369	NC_016908	CTT	2	6	563724	563729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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