MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016908	ATT	2	6	433018	433023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721112
11003	NC_016908	AAT	2	6	433032	433037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721112
11004	NC_016908	CAATAA	2	12	433230	433241	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378721112
11005	NC_016908	ATT	3	9	433243	433251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721112
11006	NC_016908	T	7	7	433250	433256	0 %	100 %	0 %	0 %	378721112
11007	NC_016908	TA	3	6	433280	433285	50 %	50 %	0 %	0 %	378721112
11008	NC_016908	ATT	2	6	433289	433294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721112
11009	NC_016908	AAT	2	6	433324	433329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_016908	CGT	2	6	433381	433386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378721113
11011	NC_016908	CGCTC	2	10	433422	433431	0 %	20 %	20 %	60 %	378721113
11012	NC_016908	TTAA	2	8	433509	433516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_016908	TAT	2	6	433540	433545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721114
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11015	NC_016908	A	6	6	433588	433593	100 %	0 %	0 %	0 %	378721114
11016	NC_016908	GAA	2	6	433598	433603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378721114
11017	NC_016908	AGC	2	6	433612	433617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721114
11018	NC_016908	ATA	2	6	433686	433691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721114
11019	NC_016908	ATT	2	6	433694	433699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721114
11020	NC_016908	ATG	2	6	433850	433855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721114
11021	NC_016908	TTG	2	6	433857	433862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378721114
11022	NC_016908	AT	3	6	433875	433880	50 %	50 %	0 %	0 %	378721114
11023	NC_016908	AAT	2	6	433919	433924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721114
11024	NC_016908	GCA	2	6	433928	433933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721114
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11026	NC_016908	CTG	2	6	434001	434006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378721114
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11028	NC_016908	ATA	2	6	434064	434069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721114
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11033	NC_016908	A	6	6	434191	434196	100 %	0 %	0 %	0 %	378721115
11034	NC_016908	GTC	2	6	434225	434230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378721115
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11040	NC_016908	TAG	2	6	434525	434530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721115
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11042	NC_016908	A	6	6	434570	434575	100 %	0 %	0 %	0 %	378721115
11043	NC_016908	TGA	2	6	434592	434597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721115
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11049	NC_016908	TAT	3	9	434772	434780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721115
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11052	NC_016908	ATG	2	6	434849	434854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721115
11053	NC_016908	TGA	2	6	434868	434873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721115
11054	NC_016908	A	6	6	434910	434915	100 %	0 %	0 %	0 %	378721115
11055	NC_016908	AG	3	6	434929	434934	50 %	0 %	50 %	0 %	378721115
11056	NC_016908	ACG	2	6	434971	434976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721115
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11058	NC_016908	TATT	2	8	435017	435024	25 %	75 %	0 %	0 %	378721115
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11073	NC_016908	TAG	2	6	435587	435592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11093	NC_016908	GTT	2	6	436651	436656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378721118
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11097	NC_016908	TGCT	2	8	436767	436774	0 %	50 %	25 %	25 %	378721118
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11104	NC_016908	ATTT	2	8	437107	437114	25 %	75 %	0 %	0 %	378721119
11105	NC_016908	TAA	2	6	437181	437186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_016908	GAA	2	6	437236	437241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378721120
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11110	NC_016908	CTA	2	6	437357	437362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721120
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11114	NC_016908	TA	3	6	437512	437517	50 %	50 %	0 %	0 %	378721121
11115	NC_016908	TGT	2	6	437534	437539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378721121
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11120	NC_016908	AT	3	6	437639	437644	50 %	50 %	0 %	0 %	378721121
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11496	NC_016908	TA	3	6	451986	451991	50 %	50 %	0 %	0 %	378721136
11497	NC_016908	A	9	9	451991	451999	100 %	0 %	0 %	0 %	378721136
11498	NC_016908	TA	3	6	452004	452009	50 %	50 %	0 %	0 %	378721136
11499	NC_016908	AAGC	2	8	452037	452044	50 %	0 %	25 %	25 %	378721136
11500	NC_016908	CCTTAA	2	12	452067	452078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721136

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