MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016908	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016908	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016908	A	6	6	19872	19877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016908	A	7	7	19880	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016908	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016908	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016908	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016908	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016908	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016908	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016908	TTTAA	2	10	20172	20181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016908	AAC	2	6	20213	20218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
513	NC_016908	A	7	7	20226	20232	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
514	NC_016908	AAG	2	6	20312	20317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
515	NC_016908	TAA	2	6	20337	20342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
516	NC_016908	TTG	2	6	20344	20349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720694
517	NC_016908	GCA	2	6	20397	20402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720694
518	NC_016908	GTA	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720694
519	NC_016908	A	6	6	20618	20623	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
520	NC_016908	TAA	2	6	20690	20695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
521	NC_016908	TAC	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720694
522	NC_016908	TAC	2	6	20787	20792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720694
523	NC_016908	CAT	2	6	20807	20812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720694
524	NC_016908	ACC	2	6	20880	20885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720694
525	NC_016908	GCA	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720694
526	NC_016908	CAA	2	6	20938	20943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
527	NC_016908	TCC	2	6	20982	20987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720694
528	NC_016908	A	7	7	21015	21021	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
529	NC_016908	GTAA	2	8	21049	21056	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
530	NC_016908	GAT	2	6	21075	21080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720694
531	NC_016908	A	6	6	21130	21135	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
532	NC_016908	A	6	6	21182	21187	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
533	NC_016908	TCAAG	2	10	21200	21209	40 %	20 %	20 %	20 %	378720694
534	NC_016908	ATAAA	2	10	21254	21263	80 %	20 %	0 %	0 %	378720694
535	NC_016908	AGAT	2	8	21303	21310	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
536	NC_016908	A	6	6	21326	21331	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
537	NC_016908	AGCA	2	8	21422	21429	50 %	0 %	25 %	25 %	378720694
538	NC_016908	TAA	2	6	21459	21464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
539	NC_016908	AAAT	2	8	21465	21472	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
540	NC_016908	AGAAA	2	10	21516	21525	80 %	0 %	20 %	0 %	378720694
541	NC_016908	A	6	6	21523	21528	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
542	NC_016908	AAG	2	6	21530	21535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
543	NC_016908	GCT	2	6	21610	21615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720694
544	NC_016908	AGA	2	6	21624	21629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
545	NC_016908	AATG	2	8	21666	21673	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
546	NC_016908	TTA	2	6	21715	21720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720694
547	NC_016908	TGT	2	6	21726	21731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720694
548	NC_016908	AAAGC	2	10	21772	21781	60 %	0 %	20 %	20 %	378720694
549	NC_016908	AAC	2	6	21824	21829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
550	NC_016908	CAG	2	6	21868	21873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720694
551	NC_016908	ATTA	2	8	21967	21974	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
552	NC_016908	GAATA	2	10	21978	21987	60 %	20 %	20 %	0 %	378720694
553	NC_016908	ATAG	2	8	22015	22022	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
554	NC_016908	ATAG	2	8	22027	22034	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
555	NC_016908	TAT	2	6	22256	22261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720694
556	NC_016908	ATC	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720694
557	NC_016908	GAA	2	6	22303	22308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
558	NC_016908	ACA	2	6	22358	22363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
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560	NC_016908	TAA	2	6	22404	22409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
561	NC_016908	ATTTAG	2	12	22424	22435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378720694
562	NC_016908	CGTT	2	8	22445	22452	0 %	50 %	25 %	25 %	378720694
563	NC_016908	TAA	2	6	22499	22504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
564	NC_016908	AAT	2	6	22552	22557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
565	NC_016908	ACA	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
566	NC_016908	A	6	6	22598	22603	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
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570	NC_016908	TAATA	2	10	22719	22728	60 %	40 %	0 %	0 %	378720694
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575	NC_016908	TAGT	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	378720694
576	NC_016908	A	6	6	22908	22913	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
577	NC_016908	AAC	2	6	22965	22970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720694
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585	NC_016908	TA	3	6	23288	23293	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
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589	NC_016908	TA	3	6	23424	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
590	NC_016908	TGA	2	6	23442	23447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720694
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595	NC_016908	TGA	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720694
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601	NC_016908	TAA	2	6	24129	24134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720694
602	NC_016908	TA	3	6	24151	24156	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
603	NC_016908	A	6	6	24179	24184	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
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613	NC_016908	TACCT	2	10	24429	24438	20 %	40 %	0 %	40 %	378720694
614	NC_016908	AAG	2	6	24455	24460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
615	NC_016908	AAGT	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
616	NC_016908	TACCT	2	10	24516	24525	20 %	40 %	0 %	40 %	378720694
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619	NC_016908	AAGT	2	8	24554	24561	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
620	NC_016908	GCATTA	2	12	24607	24618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378720694
621	NC_016908	GAA	2	6	24670	24675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
622	NC_016908	GAA	3	9	24700	24708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720694
623	NC_016908	TCCGAT	2	12	24724	24735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378720694
624	NC_016908	A	7	7	24792	24798	100 %	0 %	0 %	0 %	378720694
625	NC_016908	AAATGC	2	12	24800	24811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378720694
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