MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016835	GCTG	2	8	436403	436410	0 %	25 %	50 %	25 %	379704316
9002	NC_016835	CTT	2	6	436468	436473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704316
9003	NC_016835	CAC	2	6	436502	436507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704316
9004	NC_016835	A	6	6	436599	436604	100 %	0 %	0 %	0 %	379704317
9005	NC_016835	CGT	2	6	436641	436646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704317
9006	NC_016835	ATG	2	6	436668	436673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704317
9007	NC_016835	GAA	2	6	436692	436697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704317
9008	NC_016835	CCGG	2	8	436753	436760	0 %	0 %	50 %	50 %	379704317
9009	NC_016835	A	6	6	436818	436823	100 %	0 %	0 %	0 %	379704317
9010	NC_016835	CAT	2	6	436829	436834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704317
9011	NC_016835	GT	3	6	436845	436850	0 %	50 %	50 %	0 %	379704317
9012	NC_016835	CGC	2	6	436882	436887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704317
9013	NC_016835	ATA	2	6	436919	436924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_016835	T	7	7	436949	436955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_016835	CACG	2	8	436991	436998	25 %	0 %	25 %	50 %	379704318
9016	NC_016835	GTT	2	6	437298	437303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704318
9017	NC_016835	CCG	2	6	437327	437332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704318
9018	NC_016835	CAATA	2	10	437336	437345	60 %	20 %	0 %	20 %	379704318
9019	NC_016835	ATG	2	6	437455	437460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704318
9020	NC_016835	GATG	2	8	437465	437472	25 %	25 %	50 %	0 %	379704318
9021	NC_016835	GGT	2	6	437480	437485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704318
9022	NC_016835	GAT	2	6	437562	437567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704318
9023	NC_016835	CAT	2	6	437595	437600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704318
9024	NC_016835	GCT	2	6	437647	437652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_016835	AAT	2	6	437670	437675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_016835	GCCA	2	8	437691	437698	25 %	0 %	25 %	50 %	379704319
9027	NC_016835	GCC	2	6	437699	437704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704319
9028	NC_016835	ATCAG	2	10	437772	437781	40 %	20 %	20 %	20 %	379704319
9029	NC_016835	AGGC	2	8	437783	437790	25 %	0 %	50 %	25 %	379704319
9030	NC_016835	CGGC	2	8	437796	437803	0 %	0 %	50 %	50 %	379704319
9031	NC_016835	GTT	2	6	437861	437866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704319
9032	NC_016835	TGT	2	6	437905	437910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704319
9033	NC_016835	CAG	2	6	437930	437935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704319
9034	NC_016835	AAG	2	6	437974	437979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704319
9035	NC_016835	GCC	2	6	437990	437995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704319
9036	NC_016835	GCC	2	6	438032	438037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704319
9037	NC_016835	GAA	2	6	438080	438085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704319
9038	NC_016835	TCA	2	6	438106	438111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704319
9039	NC_016835	CAT	2	6	438112	438117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704319
9040	NC_016835	CGG	2	6	438253	438258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704319
9041	NC_016835	CAA	2	6	438331	438336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704319
9042	NC_016835	ATG	2	6	438444	438449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704319
9043	NC_016835	T	6	6	438609	438614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016835	ATC	2	6	438712	438717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_016835	GGA	2	6	438719	438724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_016835	GA	3	6	438755	438760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_016835	CGG	2	6	438774	438779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_016835	GCAG	2	8	438844	438851	25 %	0 %	50 %	25 %	379704320
9049	NC_016835	TGT	2	6	438939	438944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704320
9050	NC_016835	CGC	2	6	438985	438990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704320
9051	NC_016835	T	6	6	439022	439027	0 %	100 %	0 %	0 %	379704320
9052	NC_016835	TTC	2	6	439136	439141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704320
9053	NC_016835	GATC	2	8	439150	439157	25 %	25 %	25 %	25 %	379704320
9054	NC_016835	TGAA	2	8	439173	439180	50 %	25 %	25 %	0 %	379704320
9055	NC_016835	CTT	2	6	439209	439214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_016835	C	6	6	439226	439231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9057	NC_016835	TCA	2	6	439321	439326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_016835	ATT	2	6	439437	439442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_016835	TGA	2	6	439447	439452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_016835	A	6	6	439467	439472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_016835	CGG	2	6	439498	439503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_016835	AC	3	6	439533	439538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_016835	AAATAA	2	12	439542	439553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379704321
9064	NC_016835	TGA	2	6	439554	439559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704321
9065	NC_016835	GTT	2	6	439577	439582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704321
9066	NC_016835	TGC	2	6	439684	439689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704321
9067	NC_016835	TTAA	2	8	439724	439731	50 %	50 %	0 %	0 %	379704321
9068	NC_016835	TCAG	2	8	439737	439744	25 %	25 %	25 %	25 %	379704321
9069	NC_016835	CG	3	6	439797	439802	0 %	0 %	50 %	50 %	379704321
9070	NC_016835	GC	5	10	439927	439936	0 %	0 %	50 %	50 %	379704321
9071	NC_016835	GAG	2	6	439954	439959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704321
9072	NC_016835	GCTG	2	8	439993	440000	0 %	25 %	50 %	25 %	379704321
9073	NC_016835	AAG	2	6	440007	440012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704321
9074	NC_016835	CGT	2	6	440024	440029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704321
9075	NC_016835	GAT	2	6	440149	440154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704321
9076	NC_016835	TGG	2	6	440337	440342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704321
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9078	NC_016835	ATT	2	6	440464	440469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704321
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9080	NC_016835	AAGGC	2	10	440577	440586	40 %	0 %	40 %	20 %	379704321
9081	NC_016835	GGA	2	6	440621	440626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704321
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9085	NC_016835	CTG	2	6	440883	440888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704322
9086	NC_016835	CGC	2	6	440986	440991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704322
9087	NC_016835	GAA	2	6	440994	440999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704322
9088	NC_016835	TCCG	2	8	441079	441086	0 %	25 %	25 %	50 %	379704322
9089	NC_016835	CCG	2	6	441164	441169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704322
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9091	NC_016835	CAGATT	2	12	441318	441329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379704322
9092	NC_016835	AGATGA	2	12	441524	441535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379704322
9093	NC_016835	ATC	2	6	441546	441551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704322
9094	NC_016835	AAT	2	6	441645	441650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704322
9095	NC_016835	CGAT	2	8	441697	441704	25 %	25 %	25 %	25 %	379704322
9096	NC_016835	GGT	2	6	441818	441823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704322
9097	NC_016835	CA	3	6	441825	441830	50 %	0 %	0 %	50 %	379704322
9098	NC_016835	CGT	2	6	441842	441847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704322
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9101	NC_016835	GTC	2	6	442014	442019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704322
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9104	NC_016835	TGC	2	6	442282	442287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704322
9105	NC_016835	CGCGG	2	10	442428	442437	0 %	0 %	60 %	40 %	379704322
9106	NC_016835	CTG	2	6	442455	442460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704322
9107	NC_016835	TG	3	6	442462	442467	0 %	50 %	50 %	0 %	379704322
9108	NC_016835	CGG	2	6	442468	442473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704322
9109	NC_016835	G	6	6	442496	442501	0 %	0 %	100 %	0 %	379704322
9110	NC_016835	TTC	2	6	442698	442703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704322
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9114	NC_016835	TCGGC	2	10	443065	443074	0 %	20 %	40 %	40 %	379704322
9115	NC_016835	AGA	2	6	443153	443158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704322
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9119	NC_016835	TTC	2	6	443312	443317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704322
9120	NC_016835	GACC	2	8	443387	443394	25 %	0 %	25 %	50 %	379704322
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9498	NC_016835	GAC	3	9	462219	462227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9499	NC_016835	CTG	2	6	462240	462245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9500	NC_016835	TGA	2	6	462347	462352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704339

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