MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016835	AGA	2	6	412803	412808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704301
8502	NC_016835	GCGG	2	8	412815	412822	0 %	0 %	75 %	25 %	379704301
8503	NC_016835	TGA	2	6	412872	412877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704301
8504	NC_016835	TG	3	6	412925	412930	0 %	50 %	50 %	0 %	379704301
8505	NC_016835	GAC	2	6	412947	412952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704301
8506	NC_016835	CGA	2	6	412968	412973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704301
8507	NC_016835	CTG	2	6	413033	413038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704301
8508	NC_016835	TAC	2	6	413046	413051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704301
8509	NC_016835	GGC	3	9	413121	413129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704301
8510	NC_016835	GGC	2	6	413146	413151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704301
8511	NC_016835	CG	3	6	413209	413214	0 %	0 %	50 %	50 %	379704301
8512	NC_016835	GCGCTG	2	12	413239	413250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704301
8513	NC_016835	ATT	2	6	413277	413282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704301
8514	NC_016835	CGC	2	6	413310	413315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704301
8515	NC_016835	TTACCG	2	12	413353	413364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379704301
8516	NC_016835	CATCT	2	10	413395	413404	20 %	40 %	0 %	40 %	379704301
8517	NC_016835	ATT	2	6	413454	413459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_016835	CTT	2	6	413467	413472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_016835	T	8	8	413555	413562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_016835	TAT	3	9	413593	413601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_016835	TCG	2	6	413602	413607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_016835	CG	3	6	413630	413635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_016835	GTTT	2	8	413641	413648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_016835	CAA	2	6	413726	413731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704302
8525	NC_016835	TGC	2	6	413790	413795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704302
8526	NC_016835	CGG	2	6	413958	413963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704302
8527	NC_016835	TGG	2	6	413998	414003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704302
8528	NC_016835	TAA	2	6	414031	414036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704302
8529	NC_016835	A	7	7	414095	414101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_016835	TC	4	8	414197	414204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8531	NC_016835	GTT	2	6	414223	414228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704303
8532	NC_016835	TA	3	6	414282	414287	50 %	50 %	0 %	0 %	379704303
8533	NC_016835	AC	3	6	414322	414327	50 %	0 %	0 %	50 %	379704303
8534	NC_016835	ATT	3	9	414405	414413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704303
8535	NC_016835	GCA	2	6	414523	414528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704303
8536	NC_016835	G	6	6	414534	414539	0 %	0 %	100 %	0 %	379704303
8537	NC_016835	CTG	2	6	414697	414702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704303
8538	NC_016835	AAAT	2	8	414712	414719	75 %	25 %	0 %	0 %	379704303
8539	NC_016835	GTCA	2	8	414735	414742	25 %	25 %	25 %	25 %	379704303
8540	NC_016835	ACC	2	6	414828	414833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704303
8541	NC_016835	CTG	2	6	414854	414859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704303
8542	NC_016835	GCC	2	6	414900	414905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704303
8543	NC_016835	T	6	6	415147	415152	0 %	100 %	0 %	0 %	379704303
8544	NC_016835	CCA	2	6	415183	415188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704303
8545	NC_016835	ATT	2	6	415342	415347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704303
8546	NC_016835	CTT	2	6	415354	415359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704304
8547	NC_016835	TTCA	2	8	415412	415419	25 %	50 %	0 %	25 %	379704304
8548	NC_016835	CTT	2	6	415493	415498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704304
8549	NC_016835	CCA	2	6	415581	415586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704304
8550	NC_016835	ATA	3	9	415623	415631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8551	NC_016835	GCTG	2	8	415637	415644	0 %	25 %	50 %	25 %	379704304
8552	NC_016835	TA	3	6	415667	415672	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
8553	NC_016835	CAA	3	9	415687	415695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704304
8554	NC_016835	TAA	2	6	415721	415726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8555	NC_016835	ATA	2	6	415728	415733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8556	NC_016835	G	6	6	415783	415788	0 %	0 %	100 %	0 %	379704304
8557	NC_016835	GCT	2	6	415790	415795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704304
8558	NC_016835	GTC	2	6	415812	415817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704304
8559	NC_016835	TGT	2	6	415829	415834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704304
8560	NC_016835	AAT	2	6	415839	415844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8561	NC_016835	AT	3	6	415861	415866	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
8562	NC_016835	CGT	2	6	415909	415914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704304
8563	NC_016835	TCA	2	6	415917	415922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
8564	NC_016835	TCA	2	6	415929	415934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
8565	NC_016835	CTG	2	6	415948	415953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704304
8566	NC_016835	GCA	2	6	416004	416009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704304
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8568	NC_016835	TGAC	2	8	416276	416283	25 %	25 %	25 %	25 %	379704304
8569	NC_016835	GTG	2	6	416305	416310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704304
8570	NC_016835	GA	3	6	416324	416329	50 %	0 %	50 %	0 %	379704304
8571	NC_016835	CAT	3	9	416362	416370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
8572	NC_016835	ACG	2	6	416372	416377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704304
8573	NC_016835	AAT	2	6	416379	416384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8574	NC_016835	ACTGA	2	10	416435	416444	40 %	20 %	20 %	20 %	379704304
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8582	NC_016835	GCCA	2	8	416795	416802	25 %	0 %	25 %	50 %	379704304
8583	NC_016835	AAT	2	6	416818	416823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
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8585	NC_016835	CAT	2	6	416986	416991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
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8587	NC_016835	AAT	2	6	417087	417092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8588	NC_016835	TAA	2	6	417182	417187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
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8590	NC_016835	AAG	2	6	417279	417284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704304
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8593	NC_016835	A	6	6	417500	417505	100 %	0 %	0 %	0 %	379704304
8594	NC_016835	ATC	2	6	417515	417520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
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8598	NC_016835	TA	3	6	417587	417592	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
8599	NC_016835	TTTC	2	8	417600	417607	0 %	75 %	0 %	25 %	379704304
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8601	NC_016835	AT	3	6	417665	417670	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
8602	NC_016835	TGCT	2	8	417685	417692	0 %	50 %	25 %	25 %	379704304
8603	NC_016835	CTTTG	2	10	417706	417715	0 %	60 %	20 %	20 %	379704304
8604	NC_016835	TAT	2	6	417757	417762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704304
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8607	NC_016835	TAA	2	6	417844	417849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704304
8608	NC_016835	CAT	2	6	417877	417882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
8609	NC_016835	ATT	2	6	418011	418016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704304
8610	NC_016835	T	8	8	418020	418027	0 %	100 %	0 %	0 %	379704304
8611	NC_016835	T	6	6	418048	418053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_016835	TAAA	2	8	418058	418065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_016835	TTA	2	6	418109	418114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_016835	GTATT	2	10	418127	418136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_016835	ATGAA	2	10	418163	418172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_016835	TAG	2	6	418221	418226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704305
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8619	NC_016835	TGC	2	6	418336	418341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704305
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8622	NC_016835	TCA	2	6	418539	418544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704305
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8993	NC_016835	AC	3	6	436122	436127	50 %	0 %	0 %	50 %	379704316
8994	NC_016835	ATGT	2	8	436158	436165	25 %	50 %	25 %	0 %	379704316
8995	NC_016835	CCG	2	6	436199	436204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704316
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8997	NC_016835	TGA	2	6	436264	436269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704316
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9000	NC_016835	CGT	2	6	436389	436394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704316

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