MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016835	TTAA	2	8	387728	387735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_016835	TA	3	6	387790	387795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_016835	GAAA	2	8	387823	387830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_016835	GGC	2	6	387850	387855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_016835	T	6	6	387858	387863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016835	TTAC	2	8	387968	387975	25 %	50 %	0 %	25 %	379704277
8007	NC_016835	TGA	2	6	387978	387983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704277
8008	NC_016835	CTG	2	6	387993	387998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704277
8009	NC_016835	ACT	2	6	388010	388015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704277
8010	NC_016835	GCG	2	6	388085	388090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704277
8011	NC_016835	CGT	2	6	388137	388142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704277
8012	NC_016835	TGA	2	6	388162	388167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704277
8013	NC_016835	CAA	3	9	388238	388246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704277
8014	NC_016835	GAT	2	6	388425	388430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016835	CTG	2	6	388500	388505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_016835	ACG	2	6	388709	388714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704278
8017	NC_016835	GGC	2	6	388762	388767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704278
8018	NC_016835	ATGC	2	8	388843	388850	25 %	25 %	25 %	25 %	379704278
8019	NC_016835	TTGA	2	8	388852	388859	25 %	50 %	25 %	0 %	379704278
8020	NC_016835	TCT	2	6	388893	388898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704278
8021	NC_016835	CAA	2	6	388908	388913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704278
8022	NC_016835	CTG	2	6	388933	388938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704278
8023	NC_016835	GAAC	2	8	388989	388996	50 %	0 %	25 %	25 %	379704278
8024	NC_016835	AC	3	6	389047	389052	50 %	0 %	0 %	50 %	379704278
8025	NC_016835	GCA	2	6	389060	389065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704278
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8028	NC_016835	GAAA	2	8	389183	389190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016835	ACGC	2	8	389201	389208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_016835	CGTA	2	8	389235	389242	25 %	25 %	25 %	25 %	379704279
8031	NC_016835	GCG	2	6	389251	389256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704279
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8033	NC_016835	GCG	2	6	389344	389349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704279
8034	NC_016835	GCG	2	6	389354	389359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704279
8035	NC_016835	CTT	2	6	389534	389539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704279
8036	NC_016835	GAC	2	6	389577	389582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704279
8037	NC_016835	TA	3	6	389629	389634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_016835	CAT	2	6	389662	389667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_016835	GCG	2	6	389687	389692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_016835	ATA	2	6	389708	389713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_016835	A	6	6	389858	389863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_016835	TAC	2	6	389913	389918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_016835	TCG	2	6	389934	389939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704280
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8045	NC_016835	AATC	2	8	390022	390029	50 %	25 %	0 %	25 %	379704280
8046	NC_016835	TGCC	2	8	390210	390217	0 %	25 %	25 %	50 %	379704280
8047	NC_016835	CGG	2	6	390274	390279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704280
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8050	NC_016835	GCCA	2	8	390508	390515	25 %	0 %	25 %	50 %	379704280
8051	NC_016835	ACG	2	6	390534	390539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704280
8052	NC_016835	GAT	2	6	390571	390576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704280
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8055	NC_016835	CAGC	2	8	390680	390687	25 %	0 %	25 %	50 %	379704281
8056	NC_016835	GCG	2	6	390722	390727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704281
8057	NC_016835	GCC	2	6	390743	390748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704281
8058	NC_016835	GCA	2	6	390766	390771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704281
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8062	NC_016835	CTGA	2	8	390972	390979	25 %	25 %	25 %	25 %	379704281
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8071	NC_016835	GC	3	6	391372	391377	0 %	0 %	50 %	50 %	379704282
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8075	NC_016835	AT	3	6	391471	391476	50 %	50 %	0 %	0 %	379704282
8076	NC_016835	GGCA	2	8	391487	391494	25 %	0 %	50 %	25 %	379704282
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8081	NC_016835	CATG	2	8	391866	391873	25 %	25 %	25 %	25 %	379704283
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8088	NC_016835	GC	3	6	392071	392076	0 %	0 %	50 %	50 %	379704283
8089	NC_016835	GGCG	2	8	392131	392138	0 %	0 %	75 %	25 %	379704283
8090	NC_016835	TAA	2	6	392139	392144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704283
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8113	NC_016835	GC	3	6	393082	393087	0 %	0 %	50 %	50 %	379704284
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8493	NC_016835	TGC	2	6	412443	412448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704300
8494	NC_016835	A	6	6	412484	412489	100 %	0 %	0 %	0 %	379704300
8495	NC_016835	GCT	2	6	412496	412501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8496	NC_016835	CTGA	2	8	412579	412586	25 %	25 %	25 %	25 %	379704301
8497	NC_016835	TGA	2	6	412596	412601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704301
8498	NC_016835	GCC	2	6	412636	412641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704301
8499	NC_016835	GCTCG	2	10	412662	412671	0 %	20 %	40 %	40 %	379704301
8500	NC_016835	TGC	2	6	412790	412795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704301

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