MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016835	ATG	2	6	317425	317430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704215
6502	NC_016835	GAA	2	6	317493	317498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704215
6503	NC_016835	GCG	2	6	317511	317516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704215
6504	NC_016835	GGT	2	6	317535	317540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704215
6505	NC_016835	TCG	2	6	317627	317632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704215
6506	NC_016835	GCG	2	6	317694	317699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704215
6507	NC_016835	TTC	2	6	317700	317705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704215
6508	NC_016835	AT	3	6	317786	317791	50 %	50 %	0 %	0 %	379704215
6509	NC_016835	ACA	2	6	317796	317801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704215
6510	NC_016835	ATT	2	6	317815	317820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704215
6511	NC_016835	TGT	2	6	317906	317911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704215
6512	NC_016835	TGT	2	6	317966	317971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704215
6513	NC_016835	TAAT	2	8	318108	318115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_016835	AAT	2	6	318125	318130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704216
6515	NC_016835	ATTT	2	8	318145	318152	25 %	75 %	0 %	0 %	379704216
6516	NC_016835	A	6	6	318189	318194	100 %	0 %	0 %	0 %	379704216
6517	NC_016835	CAAT	2	8	318250	318257	50 %	25 %	0 %	25 %	379704216
6518	NC_016835	CTGAT	2	10	318337	318346	20 %	40 %	20 %	20 %	379704216
6519	NC_016835	A	7	7	318375	318381	100 %	0 %	0 %	0 %	379704216
6520	NC_016835	GCAA	2	8	318477	318484	50 %	0 %	25 %	25 %	379704216
6521	NC_016835	AAG	2	6	318573	318578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704216
6522	NC_016835	ACA	2	6	318633	318638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_016835	CGC	2	6	318644	318649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_016835	GCA	2	6	318691	318696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704217
6525	NC_016835	ATA	2	6	318705	318710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704217
6526	NC_016835	GAA	2	6	318740	318745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704217
6527	NC_016835	AGC	2	6	318752	318757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704217
6528	NC_016835	TGA	2	6	318766	318771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704217
6529	NC_016835	TGC	2	6	318777	318782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704217
6530	NC_016835	TTAA	2	8	318827	318834	50 %	50 %	0 %	0 %	379704217
6531	NC_016835	T	6	6	318867	318872	0 %	100 %	0 %	0 %	379704217
6532	NC_016835	GAA	2	6	318980	318985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704217
6533	NC_016835	TTCA	2	8	319000	319007	25 %	50 %	0 %	25 %	379704217
6534	NC_016835	TTA	2	6	319008	319013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704217
6535	NC_016835	A	6	6	319115	319120	100 %	0 %	0 %	0 %	379704218
6536	NC_016835	TTA	2	6	319129	319134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704218
6537	NC_016835	AGA	2	6	319231	319236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704218
6538	NC_016835	ATT	2	6	319253	319258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704218
6539	NC_016835	AGCC	2	8	319537	319544	25 %	0 %	25 %	50 %	379704218
6540	NC_016835	TGA	2	6	319558	319563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704218
6541	NC_016835	GGC	2	6	319615	319620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704218
6542	NC_016835	GCG	2	6	319644	319649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704218
6543	NC_016835	TTG	2	6	319679	319684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704218
6544	NC_016835	CCGTG	2	10	319753	319762	0 %	20 %	40 %	40 %	379704218
6545	NC_016835	TGC	2	6	319824	319829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704218
6546	NC_016835	TCT	2	6	319839	319844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704218
6547	NC_016835	CTGC	2	8	319877	319884	0 %	25 %	25 %	50 %	379704218
6548	NC_016835	TGG	2	6	319890	319895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704218
6549	NC_016835	TGG	2	6	319920	319925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704218
6550	NC_016835	GC	3	6	319949	319954	0 %	0 %	50 %	50 %	379704218
6551	NC_016835	CGGTG	2	10	319972	319981	0 %	20 %	60 %	20 %	379704218
6552	NC_016835	CTG	2	6	320013	320018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704218
6553	NC_016835	CAG	2	6	320067	320072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704218
6554	NC_016835	ATT	2	6	320081	320086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704218
6555	NC_016835	TCA	2	6	320098	320103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704218
6556	NC_016835	GTCTG	2	10	320117	320126	0 %	40 %	40 %	20 %	379704218
6557	NC_016835	CCCG	2	8	320172	320179	0 %	0 %	25 %	75 %	379704218
6558	NC_016835	AT	3	6	320180	320185	50 %	50 %	0 %	0 %	379704218
6559	NC_016835	GTT	2	6	320188	320193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704218
6560	NC_016835	CAGC	2	8	320208	320215	25 %	0 %	25 %	50 %	379704218
6561	NC_016835	TTAT	2	8	320288	320295	25 %	75 %	0 %	0 %	379704218
6562	NC_016835	GCC	2	6	320485	320490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704218
6563	NC_016835	TTAA	2	8	320630	320637	50 %	50 %	0 %	0 %	379704218
6564	NC_016835	GAA	2	6	320750	320755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704218
6565	NC_016835	CTG	2	6	320768	320773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704218
6566	NC_016835	ATTG	2	8	320783	320790	25 %	50 %	25 %	0 %	379704218
6567	NC_016835	CAG	2	6	320938	320943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704219
6568	NC_016835	A	6	6	320982	320987	100 %	0 %	0 %	0 %	379704219
6569	NC_016835	ATTTC	2	10	321017	321026	20 %	60 %	0 %	20 %	379704219
6570	NC_016835	CAG	2	6	321082	321087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704219
6571	NC_016835	GAT	2	6	321162	321167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704219
6572	NC_016835	CAG	3	9	321358	321366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704219
6573	NC_016835	ATTT	2	8	321380	321387	25 %	75 %	0 %	0 %	379704219
6574	NC_016835	GGC	2	6	321447	321452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704219
6575	NC_016835	CGG	2	6	321471	321476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704219
6576	NC_016835	GAA	2	6	321612	321617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704219
6577	NC_016835	T	7	7	321626	321632	0 %	100 %	0 %	0 %	379704219
6578	NC_016835	CTG	2	6	321712	321717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704219
6579	NC_016835	CGT	2	6	321735	321740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704219
6580	NC_016835	A	6	6	321845	321850	100 %	0 %	0 %	0 %	379704219
6581	NC_016835	GTA	2	6	321859	321864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704220
6582	NC_016835	GACAA	2	10	321866	321875	60 %	0 %	20 %	20 %	379704220
6583	NC_016835	CGT	2	6	321983	321988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704220
6584	NC_016835	T	6	6	322011	322016	0 %	100 %	0 %	0 %	379704220
6585	NC_016835	AC	3	6	322081	322086	50 %	0 %	0 %	50 %	379704220
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6589	NC_016835	TGCG	2	8	322259	322266	0 %	25 %	50 %	25 %	379704220
6590	NC_016835	GTC	2	6	322325	322330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704220
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6592	NC_016835	CGG	2	6	322430	322435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704220
6593	NC_016835	GGCGA	2	10	322460	322469	20 %	0 %	60 %	20 %	379704220
6594	NC_016835	TTC	2	6	322500	322505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704220
6595	NC_016835	GCAG	2	8	322548	322555	25 %	0 %	50 %	25 %	379704220
6596	NC_016835	ATT	2	6	322592	322597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704220
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6598	NC_016835	ATGC	2	8	322807	322814	25 %	25 %	25 %	25 %	379704220
6599	NC_016835	TGA	2	6	322827	322832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704220
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6601	NC_016835	CCG	2	6	322891	322896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704220
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6604	NC_016835	GCC	2	6	323193	323198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704220
6605	NC_016835	GCCT	2	8	323204	323211	0 %	25 %	25 %	50 %	379704220
6606	NC_016835	GAA	2	6	323266	323271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704220
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6608	NC_016835	A	6	6	323296	323301	100 %	0 %	0 %	0 %	379704220
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6611	NC_016835	A	6	6	323352	323357	100 %	0 %	0 %	0 %	379704220
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6988	NC_016835	CGT	2	6	340663	340668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6989	NC_016835	TA	3	6	340724	340729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6990	NC_016835	ATT	2	6	340778	340783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6991	NC_016835	ACC	2	6	340856	340861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704235
6992	NC_016835	TGT	2	6	340882	340887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704235
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