MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016835	GGCC	2	8	293749	293756	0 %	0 %	50 %	50 %	379704195
6002	NC_016835	GGGCC	2	10	293805	293814	0 %	0 %	60 %	40 %	379704195
6003	NC_016835	CAT	2	6	293824	293829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704195
6004	NC_016835	TCAT	2	8	293840	293847	25 %	50 %	0 %	25 %	379704195
6005	NC_016835	GCG	2	6	293883	293888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704195
6006	NC_016835	TCAG	2	8	293891	293898	25 %	25 %	25 %	25 %	379704195
6007	NC_016835	TTC	2	6	293974	293979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704195
6008	NC_016835	ATC	2	6	293990	293995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704195
6009	NC_016835	TTCA	2	8	294049	294056	25 %	50 %	0 %	25 %	379704195
6010	NC_016835	GAA	2	6	294079	294084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704195
6011	NC_016835	TCC	2	6	294092	294097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704195
6012	NC_016835	CGGTC	2	10	294115	294124	0 %	20 %	40 %	40 %	379704195
6013	NC_016835	GAT	3	9	294161	294169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704195
6014	NC_016835	GTG	2	6	294425	294430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704195
6015	NC_016835	CCA	2	6	294453	294458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704195
6016	NC_016835	TCA	2	6	294459	294464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704195
6017	NC_016835	CG	3	6	294472	294477	0 %	0 %	50 %	50 %	379704195
6018	NC_016835	CTCA	2	8	294526	294533	25 %	25 %	0 %	50 %	379704195
6019	NC_016835	TCA	2	6	294548	294553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704195
6020	NC_016835	GGT	2	6	294595	294600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704195
6021	NC_016835	CGG	2	6	294619	294624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704195
6022	NC_016835	ATC	2	6	294796	294801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704195
6023	NC_016835	CGT	2	6	294810	294815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704195
6024	NC_016835	TCAG	2	8	294926	294933	25 %	25 %	25 %	25 %	379704195
6025	NC_016835	GCC	2	6	294949	294954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704195
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6029	NC_016835	T	6	6	295149	295154	0 %	100 %	0 %	0 %	379704195
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6031	NC_016835	GCC	2	6	295199	295204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704195
6032	NC_016835	CGCC	2	8	295283	295290	0 %	0 %	25 %	75 %	379704195
6033	NC_016835	GT	3	6	295333	295338	0 %	50 %	50 %	0 %	379704195
6034	NC_016835	AGTCC	2	10	295431	295440	20 %	20 %	20 %	40 %	379704195
6035	NC_016835	CGC	2	6	295533	295538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704196
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6037	NC_016835	GGCG	2	8	295698	295705	0 %	0 %	75 %	25 %	379704196
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6040	NC_016835	CTGC	2	8	295904	295911	0 %	25 %	25 %	50 %	379704196
6041	NC_016835	GAA	2	6	295935	295940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704196
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6045	NC_016835	CGTT	2	8	296028	296035	0 %	50 %	25 %	25 %	379704196
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6051	NC_016835	CG	3	6	296147	296152	0 %	0 %	50 %	50 %	379704196
6052	NC_016835	GCG	2	6	296165	296170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704196
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6059	NC_016835	TTCG	2	8	296423	296430	0 %	50 %	25 %	25 %	379704196
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6108	NC_016835	AATTT	2	10	299421	299430	40 %	60 %	0 %	0 %	379704199
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6125	NC_016835	GAT	2	6	300203	300208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704199
6126	NC_016835	TGG	2	6	300216	300221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704199
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6238	NC_016835	GAC	2	6	306374	306379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6240	NC_016835	CCAGG	2	10	306402	306411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6241	NC_016835	AG	3	6	306437	306442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_016835	AG	3	6	306515	306520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_016835	CAA	2	6	306548	306553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704205
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6372	NC_016835	GCA	2	6	312035	312040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704210
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6497	NC_016835	GCC	2	6	317353	317358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704215
6498	NC_016835	GAA	2	6	317403	317408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704215
6499	NC_016835	A	6	6	317407	317412	100 %	0 %	0 %	0 %	379704215
6500	NC_016835	CGA	2	6	317414	317419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704215

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