MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016835	CAG	2	6	270509	270514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704177
5502	NC_016835	GGC	2	6	270605	270610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704177
5503	NC_016835	TGG	2	6	270615	270620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704177
5504	NC_016835	TGCG	2	8	270687	270694	0 %	25 %	50 %	25 %	379704177
5505	NC_016835	G	6	6	270694	270699	0 %	0 %	100 %	0 %	379704177
5506	NC_016835	TGC	2	6	270736	270741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704177
5507	NC_016835	GCC	3	9	270764	270772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704177
5508	NC_016835	GAAG	2	8	270822	270829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016835	ATA	2	6	270930	270935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704178
5510	NC_016835	TGA	2	6	270945	270950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016835	A	6	6	271025	271030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016835	TTG	2	6	271031	271036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016835	T	6	6	271152	271157	0 %	100 %	0 %	0 %	379704179
5514	NC_016835	AGC	2	6	271199	271204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5515	NC_016835	TTC	2	6	271279	271284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704179
5516	NC_016835	CAA	2	6	271296	271301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704179
5517	NC_016835	CCGC	2	8	271359	271366	0 %	0 %	25 %	75 %	379704179
5518	NC_016835	GTT	2	6	271425	271430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704179
5519	NC_016835	GCG	2	6	271491	271496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704179
5520	NC_016835	GCA	2	6	271581	271586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5521	NC_016835	CGG	2	6	271596	271601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704179
5522	NC_016835	TGC	2	6	271692	271697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5523	NC_016835	ATC	2	6	271735	271740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704179
5524	NC_016835	ACCG	2	8	271813	271820	25 %	0 %	25 %	50 %	379704179
5525	NC_016835	GCCC	2	8	271835	271842	0 %	0 %	25 %	75 %	379704179
5526	NC_016835	CAG	2	6	271867	271872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5527	NC_016835	AT	3	6	271943	271948	50 %	50 %	0 %	0 %	379704179
5528	NC_016835	GGT	2	6	271955	271960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704179
5529	NC_016835	ACC	2	6	271990	271995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704179
5530	NC_016835	GAC	2	6	271998	272003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5531	NC_016835	GCA	2	6	272051	272056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5532	NC_016835	CTG	2	6	272061	272066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704179
5533	NC_016835	CAT	2	6	272067	272072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704179
5534	NC_016835	ATG	2	6	272138	272143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704179
5535	NC_016835	T	7	7	272198	272204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016835	AGGTCA	2	12	272247	272258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5537	NC_016835	G	6	6	272288	272293	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016835	CGC	2	6	272302	272307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_016835	C	6	6	272310	272315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5540	NC_016835	C	6	6	272320	272325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5541	NC_016835	GC	3	6	272339	272344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_016835	ACG	2	6	272355	272360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_016835	AGTG	2	8	272379	272386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_016835	TC	3	6	272415	272420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_016835	A	6	6	272497	272502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016835	GA	3	6	272588	272593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016835	AGCG	2	8	272651	272658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_016835	GCA	2	6	272744	272749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_016835	TGC	2	6	272845	272850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_016835	GTT	2	6	272956	272961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704180
5551	NC_016835	CCG	2	6	273110	273115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704180
5552	NC_016835	TCT	2	6	273209	273214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704180
5553	NC_016835	GCC	2	6	273229	273234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704180
5554	NC_016835	CG	3	6	273379	273384	0 %	0 %	50 %	50 %	379704180
5555	NC_016835	CCG	2	6	273476	273481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704180
5556	NC_016835	TGT	2	6	273582	273587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704180
5557	NC_016835	TCT	2	6	273588	273593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704180
5558	NC_016835	TTC	2	6	273715	273720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704180
5559	NC_016835	TTC	2	6	273787	273792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704180
5560	NC_016835	CTG	2	6	273829	273834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704180
5561	NC_016835	TCA	2	6	273855	273860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704180
5562	NC_016835	CGA	2	6	273954	273959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704180
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5564	NC_016835	CAT	2	6	274024	274029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704180
5565	NC_016835	GTG	2	6	274106	274111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704180
5566	NC_016835	TGG	2	6	274119	274124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704180
5567	NC_016835	CGA	2	6	274169	274174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704180
5568	NC_016835	TGC	2	6	274185	274190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704180
5569	NC_016835	CAG	2	6	274267	274272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704180
5570	NC_016835	T	6	6	274315	274320	0 %	100 %	0 %	0 %	379704180
5571	NC_016835	CACG	2	8	274380	274387	25 %	0 %	25 %	50 %	379704180
5572	NC_016835	GCG	2	6	274404	274409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704180
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5574	NC_016835	TCA	2	6	274539	274544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704180
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5581	NC_016835	CG	3	6	274815	274820	0 %	0 %	50 %	50 %	379704180
5582	NC_016835	GGT	2	6	274846	274851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704180
5583	NC_016835	GGC	2	6	274873	274878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704180
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5585	NC_016835	CGCC	2	8	274929	274936	0 %	0 %	25 %	75 %	379704180
5586	NC_016835	T	7	7	274938	274944	0 %	100 %	0 %	0 %	379704180
5587	NC_016835	GTT	2	6	274949	274954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704180
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5592	NC_016835	ATT	2	6	275029	275034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704180
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5594	NC_016835	AC	3	6	275081	275086	50 %	0 %	0 %	50 %	379704180
5595	NC_016835	TTATT	2	10	275106	275115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016835	T	6	6	275117	275122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_016835	CT	3	6	275151	275156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_016835	GAA	2	6	275204	275209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_016835	AAT	2	6	275239	275244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016835	CG	3	6	275355	275360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_016835	TC	3	6	275464	275469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_016835	TGAG	2	8	275601	275608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016835	AGCG	2	8	275700	275707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_016835	GCA	2	6	275780	275785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_016835	GCA	2	6	275798	275803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_016835	CGTT	2	8	275906	275913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_016835	GATT	2	8	275944	275951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_016835	TGG	3	9	275970	275978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016835	TGG	2	6	276009	276014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704181
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5618	NC_016835	GGC	2	6	276339	276344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704181
5619	NC_016835	A	6	6	276346	276351	100 %	0 %	0 %	0 %	379704181
5620	NC_016835	TGG	2	6	276365	276370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704181
5621	NC_016835	CTGG	2	8	276396	276403	0 %	25 %	50 %	25 %	379704181
5622	NC_016835	CGA	2	6	276504	276509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704181
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5625	NC_016835	GCG	3	9	276580	276588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704181
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5746	NC_016835	TGC	2	6	281907	281912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704185
5747	NC_016835	TGGC	2	8	281935	281942	0 %	25 %	50 %	25 %	379704185
5748	NC_016835	TCC	2	6	281973	281978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5749	NC_016835	CGG	2	6	281983	281988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5750	NC_016835	CTC	2	6	281999	282004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5751	NC_016835	GGGA	2	8	282016	282023	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5752	NC_016835	CTT	2	6	282038	282043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5753	NC_016835	TTAT	2	8	282080	282087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5754	NC_016835	TAAA	2	8	282108	282115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5755	NC_016835	AT	3	6	282146	282151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5756	NC_016835	ATT	2	6	282155	282160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5757	NC_016835	TCA	2	6	282215	282220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704186
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5994	NC_016835	T	6	6	293362	293367	0 %	100 %	0 %	0 %	379704195
5995	NC_016835	CGG	2	6	293411	293416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704195
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5997	NC_016835	GATA	2	8	293460	293467	50 %	25 %	25 %	0 %	379704195
5998	NC_016835	GTT	2	6	293635	293640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704195
5999	NC_016835	CGA	2	6	293685	293690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704195
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