MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 2308

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016819	CCG	2	6	101545	101550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192403
2002	NC_016819	CAG	3	9	101570	101578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192403
2003	NC_016819	TGC	2	6	101613	101618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
2004	NC_016819	CAT	2	6	101650	101655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192403
2005	NC_016819	TGC	2	6	101673	101678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
2006	NC_016819	TTC	2	6	101723	101728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
2007	NC_016819	CGG	2	6	101764	101769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192403
2008	NC_016819	GCC	2	6	101829	101834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192403
2009	NC_016819	CTT	2	6	101845	101850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
2010	NC_016819	CTG	2	6	101858	101863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
2011	NC_016819	CTG	2	6	101885	101890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
2012	NC_016819	TTC	2	6	101915	101920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
2013	NC_016819	CA	3	6	101967	101972	50 %	0 %	0 %	50 %	383192403
2014	NC_016819	CAAA	2	8	102039	102046	75 %	0 %	0 %	25 %	383192404
2015	NC_016819	TCA	2	6	102084	102089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192404
2016	NC_016819	CAC	3	9	102112	102120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192404
2017	NC_016819	CAC	2	6	102123	102128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192404
2018	NC_016819	GCCA	2	8	102182	102189	25 %	0 %	25 %	50 %	383192404
2019	NC_016819	AAT	2	6	102229	102234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192404
2020	NC_016819	GTC	3	9	102238	102246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192404
2021	NC_016819	CACG	2	8	102297	102304	25 %	0 %	25 %	50 %	383192404
2022	NC_016819	CGG	2	6	102320	102325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192404
2023	NC_016819	CGC	2	6	102336	102341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192404
2024	NC_016819	CTG	2	6	102394	102399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192404
2025	NC_016819	CGGCC	2	10	102507	102516	0 %	0 %	40 %	60 %	383192405
2026	NC_016819	CAG	2	6	102540	102545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192405
2027	NC_016819	GCC	2	6	102557	102562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192405
2028	NC_016819	TTC	2	6	102579	102584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192405
2029	NC_016819	ATG	2	6	102640	102645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192405
2030	NC_016819	GGC	2	6	102653	102658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192405
2031	NC_016819	GAA	2	6	102690	102695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192405
2032	NC_016819	TCA	2	6	102724	102729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192405
2033	NC_016819	CCT	2	6	102882	102887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192406
2034	NC_016819	CG	3	6	102932	102937	0 %	0 %	50 %	50 %	383192406
2035	NC_016819	GCCT	3	12	102953	102964	0 %	25 %	25 %	50 %	383192406
2036	NC_016819	CCCG	2	8	102993	103000	0 %	0 %	25 %	75 %	383192406
2037	NC_016819	AG	3	6	103004	103009	50 %	0 %	50 %	0 %	383192406
2038	NC_016819	GCA	2	6	103041	103046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192406
2039	NC_016819	GCC	2	6	103049	103054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2040	NC_016819	CCG	2	6	103088	103093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2041	NC_016819	TGC	2	6	103103	103108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192406
2042	NC_016819	CGC	2	6	103126	103131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2043	NC_016819	AGC	2	6	103132	103137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192406
2044	NC_016819	GGC	2	6	103143	103148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192406
2045	NC_016819	CCCG	2	8	103238	103245	0 %	0 %	25 %	75 %	383192406
2046	NC_016819	CCG	2	6	103296	103301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2047	NC_016819	CCG	2	6	103355	103360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2048	NC_016819	CCG	2	6	103458	103463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2049	NC_016819	CGG	2	6	103494	103499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192406
2050	NC_016819	AC	3	6	103525	103530	50 %	0 %	0 %	50 %	383192406
2051	NC_016819	CTG	2	6	103686	103691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192406
2052	NC_016819	CAC	2	6	103703	103708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192406
2053	NC_016819	CAT	2	6	103711	103716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192406
2054	NC_016819	CGCA	2	8	103754	103761	25 %	0 %	25 %	50 %	383192406
2055	NC_016819	T	6	6	103839	103844	0 %	100 %	0 %	0 %	383192406
2056	NC_016819	GTG	2	6	103892	103897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192406
2057	NC_016819	ACC	2	6	103927	103932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192406
2058	NC_016819	GCC	2	6	103955	103960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
2059	NC_016819	GCC	2	6	104002	104007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192407
2060	NC_016819	CTG	2	6	104029	104034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192407
2061	NC_016819	GCG	2	6	104150	104155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192407
2062	NC_016819	AT	3	6	104279	104284	50 %	50 %	0 %	0 %	383192407
2063	NC_016819	TGG	2	6	104352	104357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192407
2064	NC_016819	CAG	2	6	104359	104364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192407
2065	NC_016819	CAT	2	6	104404	104409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192407
2066	NC_016819	GCC	2	6	104503	104508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192407
2067	NC_016819	GCGG	2	8	104517	104524	0 %	0 %	75 %	25 %	383192407
2068	NC_016819	GGC	2	6	104686	104691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192407
2069	NC_016819	GTT	2	6	104731	104736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192407
2070	NC_016819	CAT	2	6	104743	104748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192407
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2072	NC_016819	GC	3	6	104802	104807	0 %	0 %	50 %	50 %	383192407
2073	NC_016819	CTT	2	6	104808	104813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192407
2074	NC_016819	CGG	2	6	104892	104897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192407
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2078	NC_016819	CAG	2	6	105010	105015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192407
2079	NC_016819	GCCCG	2	10	105045	105054	0 %	0 %	40 %	60 %	383192407
2080	NC_016819	TAA	2	6	105095	105100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192407
2081	NC_016819	CAT	2	6	105115	105120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192407
2082	NC_016819	GTG	2	6	105149	105154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192407
2083	NC_016819	GTT	2	6	105157	105162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192407
2084	NC_016819	TGTT	2	8	105211	105218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2086	NC_016819	TA	3	6	105250	105255	50 %	50 %	0 %	0 %	383192408
2087	NC_016819	GCCAG	2	10	105288	105297	20 %	0 %	40 %	40 %	383192408
2088	NC_016819	GTCA	2	8	105304	105311	25 %	25 %	25 %	25 %	383192408
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2091	NC_016819	GCCA	2	8	105437	105444	25 %	0 %	25 %	50 %	383192408
2092	NC_016819	GCC	2	6	105464	105469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192408
2093	NC_016819	TTC	2	6	105502	105507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192408
2094	NC_016819	T	6	6	105522	105527	0 %	100 %	0 %	0 %	383192408
2095	NC_016819	AGG	2	6	105534	105539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192408
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2098	NC_016819	GC	3	6	105654	105659	0 %	0 %	50 %	50 %	383192408
2099	NC_016819	CTT	2	6	105660	105665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192408
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2101	NC_016819	T	6	6	105747	105752	0 %	100 %	0 %	0 %	383192408
2102	NC_016819	CTG	2	6	105799	105804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192408
2103	NC_016819	CGA	2	6	105847	105852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192408
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2105	NC_016819	CGC	2	6	105948	105953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192408
2106	NC_016819	CGT	2	6	105987	105992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192408
2107	NC_016819	A	7	7	106018	106024	100 %	0 %	0 %	0 %	383192408
2108	NC_016819	AAT	2	6	106044	106049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192408
2109	NC_016819	ACC	2	6	106141	106146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192409
2110	NC_016819	CTGTT	2	10	106162	106171	0 %	60 %	20 %	20 %	383192409
2111	NC_016819	TGT	2	6	106192	106197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192409
2112	NC_016819	CAG	2	6	106224	106229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192409
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2114	NC_016819	CGC	2	6	106316	106321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192409
2115	NC_016819	GCC	2	6	106338	106343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192409
2116	NC_016819	C	6	6	106342	106347	0 %	0 %	0 %	100 %	383192409
2117	NC_016819	CCG	2	6	106391	106396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192409
2118	NC_016819	CAT	2	6	106407	106412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192409
2119	NC_016819	CCT	2	6	106420	106425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2120	NC_016819	ACT	2	6	106439	106444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2122	NC_016819	CAG	2	6	106603	106608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192410
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2232	NC_016819	TCA	2	6	112068	112073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192415
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2240	NC_016819	GTG	2	6	112404	112409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192415
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2244	NC_016819	TC	3	6	112550	112555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2245	NC_016819	GTC	2	6	112593	112598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_016819	CATGTC	2	12	112660	112671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383192416
2247	NC_016819	CGT	2	6	112692	112697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192416
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2253	NC_016819	GAT	2	6	112963	112968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192416
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2273	NC_016819	CAAC	2	8	113789	113796	50 %	0 %	0 %	50 %	383192416
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2284	NC_016819	TGT	2	6	114352	114357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192417
2285	NC_016819	CAGC	2	8	114397	114404	25 %	0 %	25 %	50 %	383192417
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2301	NC_016819	ACAA	2	8	115159	115166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2302	NC_016819	CTG	2	6	115213	115218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2303	NC_016819	AGG	2	6	115226	115231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2304	NC_016819	GCCGG	2	10	115248	115257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2305	NC_016819	CTGG	2	8	115284	115291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2306	NC_016819	CGA	2	6	115334	115339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2307	NC_016819	ATG	2	6	115368	115373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2308	NC_016819	GGC	2	6	115457	115462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.