MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016818	TATT	2	8	142384	142391	25 %	75 %	0 %	0 %	383188094
3002	NC_016818	CGC	2	6	142397	142402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188094
3003	NC_016818	T	7	7	142503	142509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016818	CTG	2	6	142524	142529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_016818	CAT	2	6	142588	142593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016818	CTG	2	6	142614	142619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016818	A	6	6	142686	142691	100 %	0 %	0 %	0 %	383188095
3008	NC_016818	TTC	2	6	142744	142749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188095
3009	NC_016818	GAT	2	6	142820	142825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188095
3010	NC_016818	TCT	2	6	142840	142845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188095
3011	NC_016818	GTC	2	6	142851	142856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188095
3012	NC_016818	GCT	2	6	142913	142918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188095
3013	NC_016818	ATC	2	6	142950	142955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188095
3014	NC_016818	GCG	2	6	143010	143015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188095
3015	NC_016818	CAT	2	6	143066	143071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188095
3016	NC_016818	TTC	2	6	143131	143136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188095
3017	NC_016818	TGC	2	6	143140	143145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188095
3018	NC_016818	TGT	2	6	143155	143160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188095
3019	NC_016818	CAT	2	6	143243	143248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188095
3020	NC_016818	ACCTG	2	10	143362	143371	20 %	20 %	20 %	40 %	383188095
3021	NC_016818	GTG	4	12	143382	143393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188095
3022	NC_016818	CG	3	6	143405	143410	0 %	0 %	50 %	50 %	383188095
3023	NC_016818	AGA	2	6	143453	143458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188095
3024	NC_016818	GCT	2	6	143459	143464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188095
3025	NC_016818	TCT	2	6	143484	143489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188095
3026	NC_016818	TGC	2	6	143686	143691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188095
3027	NC_016818	TGT	2	6	143692	143697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188095
3028	NC_016818	GCG	2	6	143709	143714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188095
3029	NC_016818	GGC	2	6	143744	143749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188095
3030	NC_016818	A	6	6	143975	143980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016818	AGGA	2	8	144006	144013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016818	ATTT	2	8	144026	144033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016818	ATA	2	6	144091	144096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016818	ATA	2	6	144131	144136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016818	CGAC	2	8	144234	144241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_016818	TGG	2	6	144322	144327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188096
3037	NC_016818	TGC	2	6	144330	144335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3038	NC_016818	GCA	2	6	144338	144343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3039	NC_016818	GCA	2	6	144391	144396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3040	NC_016818	CGC	2	6	144438	144443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188096
3041	NC_016818	TGG	2	6	144474	144479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188096
3042	NC_016818	GCTG	2	8	144493	144500	0 %	25 %	50 %	25 %	383188096
3043	NC_016818	TTCC	2	8	144530	144537	0 %	50 %	0 %	50 %	383188096
3044	NC_016818	GCA	2	6	144595	144600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3045	NC_016818	GCC	2	6	144625	144630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188096
3046	NC_016818	CTGG	2	8	144712	144719	0 %	25 %	50 %	25 %	383188096
3047	NC_016818	CGG	2	6	144726	144731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188096
3048	NC_016818	GCC	2	6	144764	144769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188096
3049	NC_016818	CGGT	2	8	144789	144796	0 %	25 %	50 %	25 %	383188096
3050	NC_016818	TGG	2	6	144824	144829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188096
3051	NC_016818	CCA	2	6	144871	144876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188096
3052	NC_016818	CCAA	2	8	144881	144888	50 %	0 %	0 %	50 %	383188096
3053	NC_016818	ATC	2	6	144921	144926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188096
3054	NC_016818	TCG	3	9	144957	144965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3055	NC_016818	TCA	2	6	145013	145018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188096
3056	NC_016818	GCC	2	6	145029	145034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188096
3057	NC_016818	CAC	2	6	145069	145074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188096
3058	NC_016818	GCA	2	6	145222	145227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3059	NC_016818	A	6	6	145253	145258	100 %	0 %	0 %	0 %	383188096
3060	NC_016818	CCCGG	2	10	145271	145280	0 %	0 %	40 %	60 %	383188096
3061	NC_016818	GC	3	6	145312	145317	0 %	0 %	50 %	50 %	383188096
3062	NC_016818	AGA	2	6	145381	145386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188096
3063	NC_016818	CGTG	2	8	145396	145403	0 %	25 %	50 %	25 %	383188096
3064	NC_016818	TGA	2	6	145506	145511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188096
3065	NC_016818	TGGTG	2	10	145537	145546	0 %	40 %	60 %	0 %	383188096
3066	NC_016818	CAG	2	6	145580	145585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188096
3067	NC_016818	TTA	2	6	145655	145660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188096
3068	NC_016818	GCGG	2	8	145705	145712	0 %	0 %	75 %	25 %	383188096
3069	NC_016818	CGG	2	6	145779	145784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188096
3070	NC_016818	CGG	2	6	145788	145793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188096
3071	NC_016818	TTG	2	6	145816	145821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016818	TCGG	2	8	145831	145838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_016818	CTCC	2	8	145839	145846	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3074	NC_016818	TGGGG	2	10	145864	145873	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016818	GCT	2	6	145913	145918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016818	GAG	2	6	145960	145965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_016818	CCG	2	6	146065	146070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188097
3078	NC_016818	GCC	2	6	146084	146089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188097
3079	NC_016818	CTG	3	9	146131	146139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3080	NC_016818	CAT	2	6	146182	146187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188097
3081	NC_016818	GAC	2	6	146237	146242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3082	NC_016818	GC	3	6	146270	146275	0 %	0 %	50 %	50 %	383188097
3083	NC_016818	CGT	3	9	146281	146289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3084	NC_016818	TCG	3	9	146316	146324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3085	NC_016818	GGC	2	6	146369	146374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188097
3086	NC_016818	TCA	2	6	146467	146472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188097
3087	NC_016818	CAGATA	2	12	146519	146530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383188097
3088	NC_016818	GCA	2	6	146595	146600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3089	NC_016818	CTG	2	6	146711	146716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188097
3090	NC_016818	CGTAA	2	10	146762	146771	40 %	20 %	20 %	20 %	383188097
3091	NC_016818	CCA	2	6	146835	146840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188097
3092	NC_016818	GAAAG	2	10	146952	146961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016818	ATT	2	6	146973	146978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016818	GTCA	2	8	147006	147013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_016818	T	6	6	147036	147041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016818	A	7	7	147055	147061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016818	A	6	6	147067	147072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016818	GAC	2	6	147147	147152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188098
3099	NC_016818	ACC	2	6	147191	147196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188098
3100	NC_016818	GTC	2	6	147200	147205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188098
3101	NC_016818	CCA	2	6	147228	147233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188098
3102	NC_016818	TCT	2	6	147264	147269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188098
3103	NC_016818	T	7	7	147318	147324	0 %	100 %	0 %	0 %	383188098
3104	NC_016818	TGT	2	6	147341	147346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016818	GATA	2	8	147473	147480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016818	CTA	2	6	147484	147489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016818	AC	3	6	147544	147549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_016818	TGA	2	6	147605	147610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016818	AT	3	6	147637	147642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016818	GAT	2	6	147652	147657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188099
3111	NC_016818	CTT	2	6	147675	147680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188099
3112	NC_016818	AG	3	6	147729	147734	50 %	0 %	50 %	0 %	383188099
3113	NC_016818	GAATT	2	10	147780	147789	40 %	40 %	20 %	0 %	383188099
3114	NC_016818	GAA	2	6	147839	147844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188099
3115	NC_016818	CTG	2	6	147902	147907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188099
3116	NC_016818	GCA	2	6	147916	147921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188099
3117	NC_016818	TGC	2	6	147981	147986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188099
3118	NC_016818	GC	4	8	148003	148010	0 %	0 %	50 %	50 %	383188099
3119	NC_016818	CTTC	2	8	148146	148153	0 %	50 %	0 %	50 %	383188099
3120	NC_016818	ACC	2	6	148154	148159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188099
3121	NC_016818	TGA	2	6	148254	148259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188099
3122	NC_016818	ATT	2	6	148280	148285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188099
3123	NC_016818	TAT	2	6	148352	148357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188099
3124	NC_016818	ACCTG	2	10	148426	148435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3125	NC_016818	CT	3	6	148513	148518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_016818	CCT	2	6	148539	148544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_016818	GTG	2	6	148661	148666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188100
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3135	NC_016818	TGGT	2	8	149241	149248	0 %	50 %	50 %	0 %	383188100
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3145	NC_016818	GC	4	8	150044	150051	0 %	0 %	50 %	50 %	383188100
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3158	NC_016818	GC	3	6	150734	150739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3241	NC_016818	GCG	2	6	154385	154390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_016818	GCG	2	6	154505	154510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188105
3243	NC_016818	AAT	2	6	154584	154589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188105
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3246	NC_016818	GCG	2	6	154779	154784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188105
3247	NC_016818	CA	3	6	154875	154880	50 %	0 %	0 %	50 %	383188105
3248	NC_016818	CAC	2	6	154896	154901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188105
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3250	NC_016818	TGC	2	6	155185	155190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188105
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3286	NC_016818	TAA	2	6	157039	157044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3352	NC_016818	ATA	2	6	159751	159756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188112
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3356	NC_016818	GTT	2	6	159875	159880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_016818	GAA	2	6	159896	159901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3358	NC_016818	AGA	2	6	160023	160028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188113
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3362	NC_016818	TGC	2	6	160325	160330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188113
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3365	NC_016818	TG	3	6	160374	160379	0 %	50 %	50 %	0 %	383188113
3366	NC_016818	TGA	2	6	160383	160388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188113
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3369	NC_016818	GGC	2	6	160530	160535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3370	NC_016818	TGG	2	6	160589	160594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188113
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3372	NC_016818	AAAG	2	8	160711	160718	75 %	0 %	25 %	0 %	383188113
3373	NC_016818	TCA	2	6	160721	160726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
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3379	NC_016818	CAT	2	6	161052	161057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
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3382	NC_016818	GAT	2	6	161128	161133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188113
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3387	NC_016818	GGC	2	6	161242	161247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
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3446	NC_016818	TAA	2	6	164967	164972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3468	NC_016818	ATT	2	6	166013	166018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_016818	GC	3	6	166103	166108	0 %	0 %	50 %	50 %	383188118
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3483	NC_016818	TTA	2	6	166530	166535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188118
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3487	NC_016818	A	6	6	166622	166627	100 %	0 %	0 %	0 %	383188119
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3491	NC_016818	ATTA	2	8	166761	166768	50 %	50 %	0 %	0 %	383188119
3492	NC_016818	TGT	2	6	166861	166866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188119
3493	NC_016818	CGG	2	6	166886	166891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188119
3494	NC_016818	CAGG	2	8	166930	166937	25 %	0 %	50 %	25 %	383188119
3495	NC_016818	CGAA	2	8	166977	166984	50 %	0 %	25 %	25 %	383188119
3496	NC_016818	G	6	6	166988	166993	0 %	0 %	100 %	0 %	383188119
3497	NC_016818	GAT	2	6	166996	167001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188119
3498	NC_016818	TCC	2	6	167015	167020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188119
3499	NC_016818	TTA	2	6	167035	167040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188119
3500	NC_016818	GGCA	2	8	167106	167113	25 %	0 %	50 %	25 %	383188119

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