MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016818	TGA	3	9	862156	862164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188743
17503	NC_016818	CGG	2	6	862169	862174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
17504	NC_016818	GCC	2	6	862185	862190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188743
17505	NC_016818	CGA	2	6	862217	862222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188743
17506	NC_016818	TGGTC	2	10	862285	862294	0 %	40 %	40 %	20 %	383188743
17507	NC_016818	TGC	2	6	862342	862347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
17508	NC_016818	CGG	2	6	862352	862357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
17509	NC_016818	CTG	2	6	862422	862427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
17510	NC_016818	TGA	2	6	862447	862452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188743
17511	NC_016818	CGG	3	9	862463	862471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
17512	NC_016818	CAG	2	6	862523	862528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188743
17513	NC_016818	A	7	7	862653	862659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_016818	CGG	2	6	862700	862705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17515	NC_016818	TTC	2	6	862814	862819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188744
17516	NC_016818	ATG	2	6	862836	862841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188744
17517	NC_016818	AAGA	2	8	862844	862851	75 %	0 %	25 %	0 %	383188744
17518	NC_016818	GAA	2	6	862859	862864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188744
17519	NC_016818	GTT	2	6	862972	862977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188744
17520	NC_016818	CTG	2	6	863003	863008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188744
17521	NC_016818	GAT	2	6	863027	863032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188744
17522	NC_016818	CCG	2	6	863101	863106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188744
17523	NC_016818	GCT	2	6	863136	863141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188744
17524	NC_016818	GGT	2	6	863165	863170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188744
17525	NC_016818	TGC	2	6	863199	863204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188744
17526	NC_016818	CCA	2	6	863292	863297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188744
17527	NC_016818	ATC	2	6	863303	863308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188744
17528	NC_016818	GGCT	2	8	863324	863331	0 %	25 %	50 %	25 %	383188744
17529	NC_016818	CGG	2	6	863383	863388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188744
17530	NC_016818	ATCGAA	2	12	863444	863455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383188744
17531	NC_016818	CG	3	6	863489	863494	0 %	0 %	50 %	50 %	383188744
17532	NC_016818	GGT	2	6	863504	863509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188744
17533	NC_016818	CAA	2	6	863518	863523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188744
17534	NC_016818	TGCG	2	8	863628	863635	0 %	25 %	50 %	25 %	383188744
17535	NC_016818	CAG	2	6	863678	863683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188744
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17537	NC_016818	CAA	2	6	863873	863878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188745
17538	NC_016818	CAG	2	6	863880	863885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188745
17539	NC_016818	AAC	2	6	863915	863920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188745
17540	NC_016818	TCG	2	6	863932	863937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188745
17541	NC_016818	CGT	2	6	863990	863995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188745
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17544	NC_016818	ATG	2	6	864089	864094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188745
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17546	NC_016818	CGG	2	6	864142	864147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188745
17547	NC_016818	TGA	2	6	864172	864177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188745
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17549	NC_016818	TGG	2	6	864462	864467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188745
17550	NC_016818	GAT	2	6	864496	864501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188745
17551	NC_016818	GGC	2	6	864515	864520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188745
17552	NC_016818	GCG	3	9	864521	864529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188745
17553	NC_016818	CAC	2	6	864545	864550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188745
17554	NC_016818	ATG	2	6	864698	864703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188745
17555	NC_016818	CTGA	2	8	864770	864777	25 %	25 %	25 %	25 %	383188745
17556	NC_016818	GCA	2	6	864789	864794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188745
17557	NC_016818	GTG	2	6	864797	864802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188745
17558	NC_016818	CGA	2	6	864904	864909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188745
17559	NC_016818	GAA	2	6	864998	865003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188745
17560	NC_016818	CCG	2	6	865005	865010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188745
17561	NC_016818	GC	3	6	865070	865075	0 %	0 %	50 %	50 %	383188745
17562	NC_016818	TTC	2	6	865115	865120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188745
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17566	NC_016818	ACA	2	6	865407	865412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17567	NC_016818	TGC	2	6	865438	865443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_016818	CCG	2	6	865504	865509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17569	NC_016818	TTA	2	6	865630	865635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_016818	GT	3	6	865728	865733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17571	NC_016818	CAA	2	6	865790	865795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17572	NC_016818	TTA	2	6	865865	865870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_016818	TGG	2	6	865881	865886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_016818	CGCTC	2	10	865994	866003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17575	NC_016818	ACC	2	6	866017	866022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17588	NC_016818	AAT	2	6	866782	866787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188746
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17591	NC_016818	GTA	2	6	866884	866889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188746
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17599	NC_016818	TAAT	2	8	867080	867087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17600	NC_016818	TAT	2	6	867090	867095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_016818	GA	3	6	867118	867123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_016818	TC	3	6	867128	867133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17603	NC_016818	GCA	2	6	867200	867205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188747
17604	NC_016818	CTAG	2	8	867365	867372	25 %	25 %	25 %	25 %	383188747
17605	NC_016818	TTTGA	2	10	867428	867437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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17607	NC_016818	CCG	2	6	867764	867769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17608	NC_016818	TTA	2	6	867846	867851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_016818	A	7	7	867860	867866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17610	NC_016818	A	6	6	867894	867899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_016818	GCG	2	6	867910	867915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17612	NC_016818	T	6	6	867968	867973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_016818	TAT	2	6	868064	868069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_016818	TGAG	2	8	868077	868084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17616	NC_016818	TGC	2	6	868097	868102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17618	NC_016818	GTT	2	6	868173	868178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_016818	AC	3	6	868221	868226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17620	NC_016818	TTG	2	6	868271	868276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17985	NC_016818	ACC	2	6	887323	887328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188766
17986	NC_016818	GCT	2	6	887337	887342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188766
17987	NC_016818	TCG	2	6	887411	887416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188766
17988	NC_016818	TTC	2	6	887554	887559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188767
17989	NC_016818	TGC	2	6	887582	887587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188767
17990	NC_016818	CTG	2	6	887629	887634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188767
17991	NC_016818	GGC	2	6	887715	887720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188767
17992	NC_016818	CGC	2	6	887732	887737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188767
17993	NC_016818	TCGATC	2	12	887822	887833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383188767
17994	NC_016818	CGGCG	2	10	887844	887853	0 %	0 %	60 %	40 %	383188767
17995	NC_016818	GGC	2	6	887865	887870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188767
17996	NC_016818	AGC	2	6	887899	887904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188767
17997	NC_016818	ATC	2	6	887953	887958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188767
17998	NC_016818	TGG	2	6	888068	888073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188767
17999	NC_016818	GCGT	2	8	888089	888096	0 %	25 %	50 %	25 %	383188767
18000	NC_016818	GAT	2	6	888219	888224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188767

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